27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3543 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B3543  hypothetical protein  100 
 
 
161 aa  326  6e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3203  hypothetical protein  36.17 
 
 
167 aa  89  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000632331  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0037  hypothetical protein  36 
 
 
171 aa  80.9  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.894017  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0018  hypothetical protein  35.33 
 
 
171 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0052  hypothetical protein  35.33 
 
 
171 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376527  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3995  hypothetical protein  31.94 
 
 
257 aa  74.3  0.0000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00690793  normal  0.10342 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1264  hypothetical protein  27.34 
 
 
170 aa  67.4  0.00000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5082  hypothetical protein  34.65 
 
 
264 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1531  hypothetical protein  28.95 
 
 
320 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0158  hypothetical protein  30.58 
 
 
262 aa  57.8  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5084  hypothetical protein  31.68 
 
 
262 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5086  hypothetical protein  32.67 
 
 
265 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2141  group-specific protein  26.71 
 
 
302 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4655  hypothetical protein  32.67 
 
 
264 aa  54.7  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2108  hypothetical protein  26.62 
 
 
335 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.251468  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2072  hypothetical protein  26.03 
 
 
308 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2040  hypothetical protein  26.03 
 
 
337 aa  52.4  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1893  hypothetical protein  26.03 
 
 
337 aa  52.4  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.897359  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5052  hypothetical protein  26.67 
 
 
262 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4813  hypothetical protein  26.67 
 
 
264 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.269891  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5178  hypothetical protein  26.67 
 
 
264 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4762  hypothetical protein  30.93 
 
 
257 aa  51.6  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1890  hypothetical protein  26.71 
 
 
332 aa  51.2  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0252667  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1845  group-specific protein  26.71 
 
 
337 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0273412  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1855  hypothetical protein  26 
 
 
316 aa  47.8  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3279  group-specific protein  26 
 
 
328 aa  47.4  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2030  hypothetical protein  26 
 
 
334 aa  47  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.875114  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>