87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4416 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_4416  hypothetical protein  100 
 
 
261 aa  510  1e-144  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.921944  normal  0.0304901 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3441  hypothetical protein  81.38 
 
 
249 aa  345  5e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.169478  normal  0.0964499 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0416  protein of unknown function DUF540  61.11 
 
 
250 aa  295  4e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.881692  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2099  protein of unknown function DUF540  49.22 
 
 
269 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000514107 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0890  hypothetical protein  48.83 
 
 
285 aa  230  1e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.148607 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1157  protein of unknown function DUF540  46.44 
 
 
272 aa  215  4e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.377801  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1126  protein of unknown function DUF540  46.44 
 
 
272 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1024  CysZ protein  30.16 
 
 
258 aa  95.1  9e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000955852  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2664  putative sulfate transport protein CysZ  27.12 
 
 
287 aa  89.4  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00333644  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2941  putative sulfate transport protein CysZ  24.34 
 
 
253 aa  89.7  5e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000526268  normal  0.109677 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2622  putative sulfate transport protein CysZ  27.12 
 
 
287 aa  89.4  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00041893  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2688  putative sulfate transport protein CysZ  27.12 
 
 
287 aa  89.4  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.211046  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2573  putative sulfate transport protein CysZ  27.12 
 
 
287 aa  89.4  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000546131  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2794  putative sulfate transport protein CysZ  27.12 
 
 
287 aa  89.4  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0621521  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2767  putative sulfate transport protein CysZ  25.21 
 
 
253 aa  87.4  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000160365  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2568  putative sulfate transport protein CysZ  25.21 
 
 
253 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000943682  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1265  putative sulfate transport protein CysZ  25.21 
 
 
253 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000198921  decreased coverage  0.0000225757 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02313  putative sulfate transport protein CysZ  25.21 
 
 
253 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000659923  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2548  putative sulfate transport protein CysZ  25.21 
 
 
253 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000814239  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3644  putative sulfate transport protein CysZ  25.21 
 
 
253 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000423219  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02274  hypothetical protein  25.21 
 
 
253 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000358279  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1248  protein of unknown function DUF540  25.21 
 
 
253 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000124469  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2700  putative sulfate transport protein CysZ  24.79 
 
 
253 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000399677  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0886  putative sulfate transport protein CysZ  26.61 
 
 
250 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.693732 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3197  putative sulfate uptake protein  28.57 
 
 
268 aa  85.5  9e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.155979  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1319  putative sulfate transport protein CysZ  25 
 
 
244 aa  83.6  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  3.35913e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2746  putative sulfate transport protein CysZ  25 
 
 
244 aa  83.6  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000416155  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1430  putative sulfate transport protein CysZ  25 
 
 
244 aa  83.6  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000173702  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0490  putative sulfate transport protein CysZ  25.54 
 
 
250 aa  82.8  0.000000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000555073  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1834  putative sulfate transport protein CysZ  28.1 
 
 
253 aa  82  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.724541  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3189  protein of unknown function DUF540  25.91 
 
 
256 aa  82  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000074726  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0777  putative sulfate transport protein CysZ  23.87 
 
 
263 aa  81.3  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000677117  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1014  putative sulfate transport protein CysZ  23.39 
 
 
263 aa  80.9  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000500888  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3267  protein of unknown function DUF540  25.81 
 
 
256 aa  80.5  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000136601  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1513  putative sulfate transport protein CysZ  23.98 
 
 
264 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.73829 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2227  protein of unknown function DUF540  25.42 
 
 
241 aa  79.3  0.00000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1177  cysZ protein  25.61 
 
 
253 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2474  hypothetical protein  29.03 
 
 
250 aa  79  0.00000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.030274  normal  0.489953 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3616  hypothetical protein  27.78 
 
 
249 aa  79  0.00000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1686  putative sulfate transport protein CysZ  23.39 
 
 
257 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.04306  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1015  putative sulfate transport protein CysZ  24.8 
 
 
253 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4403  hypothetical protein  29.88 
 
 
259 aa  77  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53330  putative sulfate transport protein CysZ  27.16 
 
 
246 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.442824 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2899  putative sulfate transport protein CysZ  25.3 
 
 
259 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3468  putative sulfate transport protein CysZ  22.63 
 
 
251 aa  75.5  0.0000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1572  putative sulfate transport protein CysZ  24.9 
 
 
259 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000851255  hitchhiker  0.00212574 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1505  putative sulfate transport protein CysZ  24.9 
 
 
259 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000542518  hitchhiker  0.0000000567341 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4674  putative sulfate transport protein CysZ  26.75 
 
 
246 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.581083  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2367  putative sulfate transport protein CysZ  27.02 
 
 
259 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0829317  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1566  putative sulfate transport protein CysZ  24.9 
 
 
259 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000261033  hitchhiker  0.0000695889 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1702  putative sulfate transport protein CysZ  24.32 
 
 
259 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000296404  hitchhiker  0.000000528176 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2682  putative sulfate transport protein CysZ  24.32 
 
 
259 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000538475  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2761  putative sulfate transport protein CysZ  24.5 
 
 
259 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00115668  hitchhiker  0.0000596308 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2657  putative sulfate transport protein CysZ  24.32 
 
 
259 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131365  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004155  sulfate transporter CysZ-type  26.09 
 
 
228 aa  73.6  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000767256  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01310  putative sulfate transport protein CysZ  23.04 
 
 
249 aa  73.2  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2339  hypothetical protein  24.12 
 
 
263 aa  72.4  0.000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.747358  normal  0.0441816 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0808  putative sulfate transport protein CysZ  25 
 
 
242 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00684995  normal  0.0715554 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4409  putative sulfate transport protein CysZ  23.04 
 
 
242 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.285932  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0785  putative sulfate transport protein CysZ  25 
 
 
242 aa  72  0.000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0197776  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1734  putative sulfate transport protein CysZ  23.27 
 
 
257 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.847735  hitchhiker  0.00000000137908 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2517  putative sulfate transport protein CysZ  21.63 
 
 
257 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.160746  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2380  putative sulfate transport protein CysZ  24.9 
 
 
257 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0944134  hitchhiker  0.000158699 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0819  putative sulfate transport protein CysZ  24.61 
 
 
242 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2030  protein of unknown function DUF540  32.52 
 
 
240 aa  70.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3446  putative sulfate transport protein CysZ  25.13 
 
 
253 aa  70.9  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00219453  hitchhiker  0.000157048 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2464  putative sulfate transport protein CysZ  21.77 
 
 
257 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000013069  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2355  putative sulfate transport protein CysZ  22.58 
 
 
250 aa  69.3  0.00000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2850  putative sulfate transport protein CysZ  24.08 
 
 
257 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000397841 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0976  putative sulfate transport protein CysZ  25.1 
 
 
246 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.828685  normal  0.13166 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4000  protein of unknown function DUF540  26.02 
 
 
279 aa  64.3  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.105937  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0370  putative sulfate transport protein CysZ  24.4 
 
 
257 aa  63.9  0.000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.308056  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10220  putative sulfate transport protein CysZ  26.57 
 
 
240 aa  61.6  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1773  hypothetical protein  26.46 
 
 
244 aa  61.6  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03620  hypothetical protein  28.19 
 
 
217 aa  60.8  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.424084  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1712  putative sulfate transport protein CysZ  31.42 
 
 
234 aa  60.8  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3262  hypothetical protein  27.39 
 
 
242 aa  58.9  0.00000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0899601  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7196  putative sulfate transport protein CysZ  26.77 
 
 
249 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.053163 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0322  hypothetical protein  29.2 
 
 
302 aa  56.6  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1581  protein of unknown function DUF540  27.14 
 
 
212 aa  56.6  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.768375 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2442  hypothetical protein  27.7 
 
 
261 aa  56.6  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0221132 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0384  hypothetical protein  26.69 
 
 
280 aa  55.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1699  hypothetical protein  25.87 
 
 
261 aa  50.8  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.195825  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0202  protein of unknown function DUF540  28.1 
 
 
252 aa  49.7  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01847  putative sulfate transport protein CysZ  23.15 
 
 
245 aa  48.5  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5770  hypothetical protein  24.12 
 
 
251 aa  45.4  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.327277  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1193  protein of unknown function DUF540  21.6 
 
 
259 aa  43.9  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.436714 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>