47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4145 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_4145  hypothetical protein  100 
 
 
132 aa  268  2e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0363435 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3061  protein of unknown function DUF820  31.93 
 
 
183 aa  68.2  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000687112  decreased coverage  0.000000069205 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3414  protein of unknown function DUF820  28.57 
 
 
191 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2987  protein of unknown function DUF820  29.82 
 
 
182 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2702  protein of unknown function DUF820  26.98 
 
 
191 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.993643  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0017  protein of unknown function DUF820  28.43 
 
 
180 aa  55.1  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2373  protein of unknown function DUF820  30 
 
 
193 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0747431  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2546  hypothetical protein  33.33 
 
 
188 aa  53.1  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2037  hypothetical protein  32.52 
 
 
253 aa  51.6  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000309479  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2009  DNA binding domain protein, excisionase family  30.77 
 
 
257 aa  51.2  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0310521  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0952  protein of unknown function DUF820  28.07 
 
 
184 aa  50.8  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.472157  normal  0.397022 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0024  protein of unknown function DUF820  32.26 
 
 
193 aa  50.4  0.000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.164318  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0813  hypothetical protein  29.82 
 
 
201 aa  50.4  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00107511 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4461  hypothetical protein  30.7 
 
 
201 aa  50.1  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0118803 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1489  protein of unknown function DUF820  32.77 
 
 
203 aa  49.3  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0998  hypothetical protein  31.15 
 
 
190 aa  48.1  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.631502  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1800  hypothetical protein  30.58 
 
 
191 aa  48.1  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.736972  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2991  protein of unknown function DUF820  32.76 
 
 
188 aa  48.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0645262  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0436  hypothetical protein  34.48 
 
 
204 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0970705  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2097  protein of unknown function DUF820  34.51 
 
 
191 aa  47.8  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4205  hypothetical protein  32.76 
 
 
204 aa  47.4  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.398339 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1727  protein of unknown function DUF820  28.21 
 
 
191 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2404  hypothetical protein  36 
 
 
205 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.586663  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1703  hypothetical protein  27.42 
 
 
184 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2061  hypothetical protein  25.4 
 
 
187 aa  45.4  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1166  hypothetical protein  26.19 
 
 
187 aa  44.3  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000632173  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1528  hypothetical protein  31.45 
 
 
192 aa  43.5  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.379264  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1413  hypothetical protein  29.17 
 
 
184 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00371058 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0123  protein of unknown function DUF820  25.62 
 
 
185 aa  42  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.532678  normal  0.129383 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1255  protein of unknown function DUF820  27.84 
 
 
189 aa  42.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1857  hypothetical protein  27.72 
 
 
202 aa  42.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.39074 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2271  hypothetical protein  30.53 
 
 
190 aa  42  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3647  protein of unknown function DUF820  27.59 
 
 
215 aa  42  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0651314 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3790  hypothetical protein  26.09 
 
 
197 aa  42  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.880809  normal  0.480481 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1702  hypothetical protein  25.81 
 
 
184 aa  41.6  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0749103 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0292  hypothetical protein  24.6 
 
 
190 aa  41.2  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.633898  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1327  protein of unknown function DUF820  33.33 
 
 
223 aa  41.6  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621558  normal  0.19062 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3386  protein of unknown function DUF820  27.68 
 
 
194 aa  41.6  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127932  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0036  hypothetical protein  27.56 
 
 
192 aa  41.2  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000477397  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1751  protein of unknown function DUF820  26.5 
 
 
191 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2481  hypothetical protein  35.09 
 
 
205 aa  40.8  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.646403  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3912  protein of unknown function DUF820  31.3 
 
 
190 aa  40.4  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1865  hypothetical protein  34.65 
 
 
205 aa  40.4  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.978149 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2089  protein of unknown function DUF820  31.93 
 
 
198 aa  40.4  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.675581  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3475  protein of unknown function DUF820  22.13 
 
 
193 aa  40  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000439019  normal  0.0457719 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2628  protein of unknown function DUF820  22.13 
 
 
193 aa  40  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2784  hypothetical protein  27.27 
 
 
203 aa  40  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>