More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4032 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_4032  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  100 
 
 
304 aa  607  9.999999999999999e-173  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000393605  hitchhiker  0.000152914 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1191  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  88.49 
 
 
304 aa  526  1e-148  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.20749  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4576  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  50.31 
 
 
316 aa  261  1e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0123  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  51.41 
 
 
316 aa  246  4.9999999999999997e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.953735  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1080  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.38 
 
 
322 aa  228  9e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00570901  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0223  thioredoxin reductase  32.67 
 
 
323 aa  149  4e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0406  glutaredoxin  32.43 
 
 
383 aa  145  9e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0240048  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3049  glutaredoxin  29.9 
 
 
391 aa  144  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0760  thioredoxin reductase  29.7 
 
 
323 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.474741  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3218  glutaredoxin  32.79 
 
 
395 aa  135  9e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0924  thioredoxin reductase  31.56 
 
 
304 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0084  glutaredoxin  30.41 
 
 
384 aa  133  3e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.833578  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0169  glutaredoxin  31.51 
 
 
402 aa  133  5e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0823  thioredoxin reductase  32.79 
 
 
396 aa  132  6e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3691  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.9 
 
 
326 aa  132  7.999999999999999e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0649931  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0622  thioredoxin reductase  31 
 
 
312 aa  132  7.999999999999999e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00106042  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1919  thioredoxin reductase  32.13 
 
 
306 aa  130  3e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0632  thioredoxin reductase (NADPH)  33.33 
 
 
323 aa  130  3e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00998267  normal  0.636604 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1512  thioredoxin reductase  32.26 
 
 
309 aa  129  6e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000715153  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0058  thioredoxin reductase  29.66 
 
 
317 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0360012  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1278  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  33.11 
 
 
316 aa  127  3e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0709  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.06 
 
 
314 aa  127  3e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0058  thioredoxin reductase  28.62 
 
 
317 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00992397  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1501  hypothetical protein  29.93 
 
 
398 aa  126  6e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.226157 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1964  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.76 
 
 
509 aa  125  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0579  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.59 
 
 
325 aa  124  2e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.455766  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2235  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.01 
 
 
526 aa  123  4e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0449918  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0776  thioredoxin-disulfide reductase  29.93 
 
 
321 aa  122  7e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.624753  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0626  thioredoxin-disulfide reductase  29.61 
 
 
320 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl064  thioredoxin reductase NADPH  29.08 
 
 
311 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0619  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  30.43 
 
 
515 aa  120  3e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.633675 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1892  thioredoxin reductase  33.33 
 
 
324 aa  120  3e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0767369  hitchhiker  0.00000000000000724203 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0518  thioredoxin reductase  28.76 
 
 
306 aa  119  6e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0723  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.15 
 
 
321 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1779  thioredoxin reductase  28.99 
 
 
308 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1451  Alkyl hydroperoxide reductase, large subunit  29.06 
 
 
569 aa  118  9.999999999999999e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1411  thioredoxin reductase  31.41 
 
 
313 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0214  thioredoxin-disulfide reductase  30.41 
 
 
312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.136255  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1704  thioredoxin-disulfide reductase  28.67 
 
 
321 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.473306  normal  0.0188738 
 
 
-
 
NC_002936  DET0542  thioredoxin-disulfide reductase  28.34 
 
 
306 aa  116  5e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0172  thioredoxin reductase  29.17 
 
 
310 aa  116  5e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.454317  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0470  thioredoxin reductase  27.18 
 
 
409 aa  115  6e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0766  thioredoxin reductase  28.52 
 
 
304 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0341299  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0101  thioredoxin reductase  34.86 
 
 
306 aa  115  8.999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.386376  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0779  thioredoxin reductase  27.45 
 
 
310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0943  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  33.74 
 
 
509 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0448  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  33.74 
 
 
509 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0860  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.03 
 
 
403 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000828046  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21210  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  31.29 
 
 
523 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0675992  normal  0.523116 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0559  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.49 
 
 
328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.239384  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0211  thioredoxin reductase  29.97 
 
 
343 aa  114  3e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_483  thioredoxin reductase  28.01 
 
 
306 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1927  alkyl hydroperoxide reductase subunit  37.56 
 
 
601 aa  113  5e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.586969  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0040  glucose-inhibited division protein A  30 
 
 
340 aa  113  5e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.390106  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26320  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36 
 
 
521 aa  112  7.000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0059  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  29.47 
 
 
507 aa  112  9e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.492285  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3149  thioredoxin reductase  29.74 
 
 
318 aa  112  9e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0845  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.58 
 
 
312 aa  111  1.0000000000000001e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4276  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.41 
 
 
533 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.63016  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0782  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.8 
 
 
301 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2750  thioredoxin-disulfide reductase  29.57 
 
 
312 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2436  thioredoxin-disulfide reductase  29.57 
 
 
312 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4090  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.41 
 
 
533 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3433  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  35.41 
 
 
533 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0161  thioredoxin-disulfide reductase  31.09 
 
 
312 aa  111  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2420  thioredoxin reductase  31.46 
 
 
304 aa  111  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290803  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3186  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  37.44 
 
 
520 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1907  Thioredoxin-disulfide reductase  28.77 
 
 
310 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000488747  normal  0.327863 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0477  alkyl hydroperoxide reductase F subunit  31.61 
 
 
555 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000501172  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01775  probable alkyl hydroperoxide reductase subunit F  27.88 
 
 
529 aa  110  3e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2972  thioredoxin reductase  28.43 
 
 
315 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000488903  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2440  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  36.49 
 
 
520 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0559  thioredoxin reductase  31.82 
 
 
304 aa  110  4.0000000000000004e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2898  thioredoxin reductase (NADPH)  32.88 
 
 
309 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.611748  hitchhiker  0.00113285 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3408  thioredoxin reductase  29.08 
 
 
320 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.15977  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3612  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  32.39 
 
 
519 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3255  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  36.49 
 
 
520 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1071  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.43 
 
 
555 aa  109  5e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000005332  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1196  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.52 
 
 
518 aa  109  5e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000420739  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1531  Thioredoxin-disulfide reductase  29.39 
 
 
313 aa  109  6e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.22031  normal  0.0207408 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5262  thioredoxin reductase  27.21 
 
 
318 aa  109  6e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3533  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  36.49 
 
 
520 aa  109  6e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.463079  normal  0.050661 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1535  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.85 
 
 
526 aa  109  6e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000673423  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5243  thioredoxin-disulfide reductase  27.21 
 
 
318 aa  109  6e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5387  thioredoxin reductase  27.21 
 
 
318 aa  109  6e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5319  thioredoxin-disulfide reductase  27.21 
 
 
318 aa  109  6e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4496  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  35.41 
 
 
532 aa  109  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.783992  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5007  thioredoxin reductase  27.21 
 
 
321 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.548386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4836  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  27.21 
 
 
321 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4851  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  27.21 
 
 
321 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.881258  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1814  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  33.49 
 
 
523 aa  109  7.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.724768  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0182  thioredoxin-disulfide reductase  30.77 
 
 
312 aa  109  7.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.68776  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0381  thioredoxin reductase  31.17 
 
 
326 aa  108  8.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  30.92 
 
 
332 aa  108  8.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3983  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  34.45 
 
 
532 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.170234  normal  0.309156 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3500  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.69 
 
 
532 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.393361  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5277  thioredoxin-disulfide reductase  26.56 
 
 
318 aa  108  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.450322  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0204  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.8 
 
 
301 aa  108  1e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.642537  normal  0.976039 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0246  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  34.86 
 
 
524 aa  107  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0118696  normal  0.0355514 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1696  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.47 
 
 
300 aa  107  2e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>