11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2772 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2772  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  293  6e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.308344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2830  hypothetical protein  88.89 
 
 		 146 aa  239  7e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000108966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0593  hypothetical protein  43.75 
 
 		 143 aa  114  3.9999999999999997e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.650029 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3522  hypothetical protein  39.1 
 
 		 126 aa  68.6  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2316  hypothetical protein  29.58 
 
 		 164 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.614466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4131  Protein of unknown function DUF2231, transmembrane  31.03 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.159201 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2673  Rieske (2Fe-2S) oxidoreductase  30.77 
 
 		 270 aa  44.3  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3979  hypothetical protein  31.94 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2790  hypothetical protein  28.17 
 
 		 173 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.49529 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0983  hypothetical protein  25.71 
 
 		 168 aa  41.2  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.328819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3227  cytochrome b5  40.91 
 
 		 236 aa  40.4  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.852192 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>