116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1399 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2207  hypothetical protein  70.35 
 
 		 938 aa  1175    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120954 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1399  peptidase M23B  100 
 
 		 945 aa  1907    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.173601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  29.55 
 
 		 567 aa  67.8  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1658  peptidase M23B  38.95 
 
 		 265 aa  67.8  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.508498  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4129  WD40 domain-containing protein  30.32 
 
 		 572 aa  65.9  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000900599 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  40.22 
 
 		 305 aa  63.5  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0511  peptidase M23B  35.85 
 
 		 271 aa  60.5  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.119076  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0525  peptidase M23  34.91 
 
 		 271 aa  60.5  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3257  peptidase M23  31.82 
 
 		 450 aa  60.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000000116683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0735  M24/M37 family peptidase  36.05 
 
 		 296 aa  60.1  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0510667  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  38.32 
 
 		 372 aa  60.1  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0210  peptidase M23B  37.14 
 
 		 216 aa  58.5  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  normal  0.0105886 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6698  Peptidase M23  33.33 
 
 		 271 aa  58.5  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2753  LysM/M23/M37 peptidase  30.1 
 
 		 363 aa  57.4  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0178  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  39.08 
 
 		 321 aa  57.4  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1541  peptidase M23  38.64 
 
 		 425 aa  57.4  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  35.58 
 
 		 274 aa  57.4  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1518  peptidase M23B  40.91 
 
 		 425 aa  57  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1995  peptidase M23B  32.8 
 
 		 309 aa  56.6  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1615  Peptidase M23  39.08 
 
 		 299 aa  56.6  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2852  peptidase M23B  33.04 
 
 		 315 aa  55.8  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0621759  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0737  Peptidase M23  36.27 
 
 		 580 aa  56.2  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.200765  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5107  peptidase M23B  33.33 
 
 		 345 aa  55.8  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000871581  decreased coverage  0.00235334 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2318  LysM/M23/M37 peptidase  34.83 
 
 		 307 aa  55.1  0.000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.234924  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0798  peptidase M23B  30.83 
 
 		 316 aa  55.1  0.000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000346497  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1618  peptidase M23B  36.63 
 
 		 412 aa  54.7  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.127445 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4765  peptidase M23B  37.5 
 
 		 420 aa  53.9  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2941  peptidase M23B  36.36 
 
 		 454 aa  54.3  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0504  peptidase M23B  35.16 
 
 		 419 aa  54.3  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1140  peptidase M23B  37.5 
 
 		 421 aa  53.9  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1620  peptidase M23B  37.5 
 
 		 421 aa  53.9  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0188  peptidase M23B  35.29 
 
 		 271 aa  53.9  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.248105  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1596  peptidase M23B  37.5 
 
 		 400 aa  53.9  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0192  Peptidase M23  37.21 
 
 		 312 aa  54.3  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4988  peptidase M23B  30.58 
 
 		 457 aa  53.5  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.333903  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3172  peptidase M23B  30.58 
 
 		 457 aa  53.5  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  36.9 
 
 		 430 aa  53.5  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1955  peptidase M23B  38.82 
 
 		 293 aa  52.8  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.090565  normal  0.0651038 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0883  peptidase M23B  38.82 
 
 		 278 aa  52.8  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  32.77 
 
 		 374 aa  52.4  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0286  peptidase M23B  40 
 
 		 374 aa  52.4  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  31.25 
 
 		 379 aa  52.4  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0935  peptidase M23B  36.26 
 
 		 598 aa  52  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1980  Peptidase M23  34.09 
 
 		 460 aa  52  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00339871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4308  peptidase M23B  31.31 
 
 		 457 aa  51.6  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000552586  decreased coverage  0.0000000100746 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2121  Peptidase M23  29.01 
 
 		 262 aa  51.6  0.00008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  36.36 
 
 		 377 aa  51.2  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1230  M24/M37 family peptidase  33.03 
 
 		 300 aa  51.2  0.00009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.448984  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0483  M23/M37 peptidase domain-containing protein  26.79 
 
 		 312 aa  50.4  0.0001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0302091  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  34.31 
 
 		 399 aa  50.8  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0616  peptidase M23B  32.79 
 
 		 319 aa  50.8  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137898  hitchhiker  0.00000225062 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2111  peptidase M23B  34.12 
 
 		 362 aa  50.8  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.315561 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2441  Peptidase M23  33.33 
 
 		 735 aa  50.8  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00201295  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1041  peptidase, M23/M37 family  36.05 
 
 		 302 aa  50.8  0.0001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.432604  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3111  peptidase M23B  31.82 
 
 		 225 aa  50.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.324565  normal  0.312255 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6410  peptidase M23B  37.5 
 
 		 491 aa  49.3  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101162  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  36.67 
 
 		 376 aa  49.7  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0912  Peptidase M23  36.56 
 
 		 276 aa  49.3  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.677753 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  35.48 
 
 		 446 aa  49.3  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0681  M24/M37 family peptidase  35.8 
 
 		 577 aa  48.9  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1887  M24/M37 family peptidase  34.83 
 
 		 472 aa  48.9  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0768301  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0673  M24/M37 family peptidase  35.8 
 
 		 577 aa  49.3  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38498  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1417  peptidase M23B  35.29 
 
 		 523 aa  48.9  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2055  peptidase  34.83 
 
 		 512 aa  48.5  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.485622  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1105  M24/M37 family peptidase  33.33 
 
 		 300 aa  48.5  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1900  M24/M37 family peptidase  34.83 
 
 		 471 aa  48.9  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0520216  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  32.67 
 
 		 569 aa  48.9  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0654  Peptidase M23  38.37 
 
 		 274 aa  48.5  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2761  peptidase M23  35.29 
 
 		 529 aa  48.9  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.758494  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2607  peptidase M23B  31 
 
 		 581 aa  48.5  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1665  peptidase  34.83 
 
 		 470 aa  48.1  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0321  metallopeptidase  34.83 
 
 		 509 aa  48.1  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.255107  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  37.74 
 
 		 375 aa  48.1  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00220  metalloendopeptidase-like membrane protein  31.63 
 
 		 554 aa  48.1  0.0007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  35.71 
 
 		 324 aa  48.1  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  35.29 
 
 		 377 aa  47.8  0.0009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  33.33 
 
 		 399 aa  47.8  0.0009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2447  M23/M37 familypeptidase  32.95 
 
 		 499 aa  47.4  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.372819  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3351  peptidase M23B  31.48 
 
 		 687 aa  47.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0955739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0734  peptidase M23B  33.33 
 
 		 373 aa  47.4  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0522246  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0539  Peptidase M23  32.97 
 
 		 308 aa  47.8  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  32.53 
 
 		 400 aa  46.6  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1202  Peptidase M23  34.29 
 
 		 367 aa  47  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0727  peptidase M23B  31.18 
 
 		 465 aa  47  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4275  peptidase M23B  31.82 
 
 		 695 aa  46.6  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0353482 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1089  peptidase M23B  35.16 
 
 		 443 aa  46.6  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.156803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0472  Peptidase M23  33.66 
 
 		 223 aa  47  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2213  Peptidase M23  29.59 
 
 		 457 aa  46.6  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.987255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0795  peptidase M23B  37.08 
 
 		 253 aa  46.2  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  31.11 
 
 		 314 aa  46.2  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0268  M23 peptidase domain protein  33.33 
 
 		 417 aa  46.2  0.003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2406  Peptidase M23  34.09 
 
 		 517 aa  46.2  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000297595  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3154  membrane proteins, metalloendopeptidase-like  32.61 
 
 		 388 aa  45.4  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  36.47 
 
 		 387 aa  45.8  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4092  peptidase M23B  30.68 
 
 		 681 aa  45.8  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0416  peptidase M23B  32.95 
 
 		 464 aa  45.4  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.749321  normal  0.0708981 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2182  peptidase M23B  36.67 
 
 		 233 aa  45.8  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1533  peptidase M23B  37.21 
 
 		 431 aa  45.8  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00239746  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2457  peptidoglycan binding domain-containing protein  25.83 
 
 		 294 aa  45.8  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.156102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0789  NlpD  27.17 
 
 		 295 aa  45.4  0.004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.278455  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>