135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1235 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1235  hypothetical protein  100 
 
 		 91 aa  193  9e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1077  hypothetical protein  94.51 
 
 		 91 aa  186  7e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1169  hypothetical protein  94.51 
 
 		 91 aa  186  7e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0980986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2071  hypothetical protein  91.21 
 
 		 114 aa  183  7e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.152399  normal  0.926717 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2067  hypothetical protein  94.32 
 
 		 90 aa  180  7e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.436295  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1836  hypothetical protein  87.5 
 
 		 91 aa  169  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.703285  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5466  hypothetical protein  86.36 
 
 		 91 aa  166  9e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0407948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5920  hypothetical protein  86.36 
 
 		 91 aa  166  9e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2157  hypothetical protein  86.36 
 
 		 91 aa  166  9e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220709  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2175  hypothetical protein  86.36 
 
 		 91 aa  166  9e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1114  hypothetical protein  86.36 
 
 		 91 aa  166  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.158096  normal  0.927439 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1752  hypothetical protein  85.23 
 
 		 91 aa  165  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2778  hypothetical protein  85.23 
 
 		 91 aa  165  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2261  hypothetical protein  85.23 
 
 		 91 aa  165  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.283774  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3058  hypothetical protein  85.23 
 
 		 91 aa  165  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.141568  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2644  hypothetical protein  85.23 
 
 		 91 aa  165  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.593  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2700  hypothetical protein  85.23 
 
 		 91 aa  165  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0938348  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1533  hypothetical protein  85.23 
 
 		 91 aa  165  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.795875  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2067  hypothetical protein  85.23 
 
 		 91 aa  165  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2194  hypothetical protein  84.09 
 
 		 91 aa  163  9e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.609831  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1490  hypothetical protein  84.09 
 
 		 91 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0380307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0687  hypothetical protein  82.22 
 
 		 91 aa  160  8.000000000000001e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.166712  normal  0.641044 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1511  hypothetical protein  81.82 
 
 		 90 aa  159  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.309754 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2624  hypothetical protein  78.89 
 
 		 91 aa  157  5e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.804415 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1263  hypothetical protein  83.91 
 
 		 90 aa  155  1e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.339369  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2982  hypothetical protein  76.67 
 
 		 90 aa  154  5.0000000000000005e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1222  hypothetical protein  74.44 
 
 		 90 aa  153  9e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2102  hypothetical protein  75.56 
 
 		 90 aa  152  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.183711  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1798  hypothetical protein  71.11 
 
 		 90 aa  148  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.716542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1924  hypothetical protein  71.11 
 
 		 90 aa  148  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.441849  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0133  hypothetical protein  74.44 
 
 		 109 aa  147  3e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2229  hypothetical protein  73.33 
 
 		 90 aa  147  4e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2344  hypothetical protein  71.11 
 
 		 90 aa  146  8e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2423  hypothetical protein  71.59 
 
 		 93 aa  146  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1372  hypothetical protein  71.59 
 
 		 91 aa  142  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1524  hypothetical protein  70.45 
 
 		 90 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.384209  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3047  hypothetical protein  75.56 
 
 		 90 aa  137  3.9999999999999997e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.45877  normal  0.0178408 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0024  hypothetical protein  70.79 
 
 		 91 aa  137  4.999999999999999e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.828588  normal  0.104747 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3583  hypothetical protein  67.05 
 
 		 90 aa  135  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.507536 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0381  hypothetical protein  64.37 
 
 		 90 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4642  hypothetical protein  72.22 
 
 		 90 aa  132  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.451223  hitchhiker  0.0000118597 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2959  hypothetical protein  67.05 
 
 		 93 aa  127  4.0000000000000003e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.269424  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2572  hypothetical protein  67.05 
 
 		 93 aa  127  4.0000000000000003e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2268  hypothetical protein  62.5 
 
 		 90 aa  127  5.0000000000000004e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2944  hypothetical protein  63.64 
 
 		 90 aa  122  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.807996  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2485  Fe(II) trafficking protein YggX  61.36 
 
 		 91 aa  120  5e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0570791  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1891  hypothetical protein  61.18 
 
 		 89 aa  117  7.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1902  hypothetical protein  60 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2696  hypothetical protein  59.77 
 
 		 88 aa  115  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.62763 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0336  hypothetical protein  56.82 
 
 		 90 aa  109  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.11522 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1142  hypothetical protein  54.02 
 
 		 90 aa  108  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0856  hypothetical protein  54.44 
 
 		 90 aa  103  7e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0075  hypothetical protein  55.56 
 
 		 90 aa  102  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.206235  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3964  hypothetical protein  53.41 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.82757  normal  0.502915 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1668  hypothetical protein  57.3 
 
 		 91 aa  101  3e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2491  hypothetical protein  58.43 
 
 		 91 aa  101  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.427029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00283  hypothetical protein  54.55 
 
 		 90 aa  100  5e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0121  hypothetical protein  56.58 
 
 		 90 aa  100  6e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000208752  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2437  hypothetical protein  50 
 
 		 92 aa  99.8  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.117093  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2874  hypothetical protein  55.06 
 
 		 92 aa  100  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.429816  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3177  hypothetical protein  53.41 
 
 		 90 aa  99.4  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.293941  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1443  hypothetical protein  52.22 
 
 		 92 aa  99.4  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3369  hypothetical protein  54.55 
 
 		 92 aa  98.6  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1179  hypothetical protein  55.68 
 
 		 92 aa  99.4  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000882261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1250  hypothetical protein  55.68 
 
 		 92 aa  99.4  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00387926  normal  0.782101 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1180  hypothetical protein  55.68 
 
 		 92 aa  99.4  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000191738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1132  hypothetical protein  47.67 
 
 		 90 aa  98.6  2e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0319  hypothetical protein  52.27 
 
 		 90 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0490853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2699  hypothetical protein  53.41 
 
 		 91 aa  98.6  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000360658  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5276  Fe(II) trafficking protein YggX  50.57 
 
 		 91 aa  98.2  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1426  hypothetical protein  50 
 
 		 92 aa  97.8  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1107  hypothetical protein  56.82 
 
 		 92 aa  98.2  4e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000149514  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1002  hypothetical protein  47.67 
 
 		 90 aa  97.8  4e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0880728  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4923  hypothetical protein  51.14 
 
 		 90 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000436986 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0285  hypothetical protein  51.14 
 
 		 90 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000110357 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3040  hypothetical protein  51.72 
 
 		 92 aa  97.8  5e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000474974  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2701  hypothetical protein  51.72 
 
 		 92 aa  97.8  5e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0665477  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0305  hypothetical protein  51.14 
 
 		 90 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284678 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3054  hypothetical protein  51.72 
 
 		 92 aa  97.8  5e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00037558  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3197  hypothetical protein  51.72 
 
 		 92 aa  97.8  5e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000564871  normal  0.56493 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04520  hypothetical protein  52.27 
 
 		 90 aa  97.4  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.683421  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0310  hypothetical protein  51.14 
 
 		 90 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1324  hypothetical protein  51.72 
 
 		 92 aa  97.8  5e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000513126  normal  0.0116062 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1850  Fe(II) trafficking protein YggX  52.87 
 
 		 93 aa  97.4  6e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.302914  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68000  hypothetical protein  50 
 
 		 90 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0291982  normal  0.0102639 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1521  hypothetical protein  48.89 
 
 		 113 aa  96.3  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.62203  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5885  hypothetical protein  50 
 
 		 90 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0533  hypothetical protein  52.27 
 
 		 90 aa  95.5  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000920147  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0759  hypothetical protein  48.86 
 
 		 94 aa  94.7  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1218  hypothetical protein  52.87 
 
 		 92 aa  94.4  5e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000284712  normal  0.540197 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0908  hypothetical protein  46.59 
 
 		 95 aa  94  7e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.431969  hitchhiker  0.00353106 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1162  Fe(II) trafficking protein YggX  49.43 
 
 		 105 aa  94  7e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2250  hypothetical protein  46.15 
 
 		 100 aa  93.6  8e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000276973 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0002  hypothetical protein  50 
 
 		 90 aa  93.2  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000338126  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03592  hypothetical protein  52.81 
 
 		 90 aa  93.2  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4149  hypothetical protein  50 
 
 		 90 aa  92  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.786111  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002445  hypothetical protein  51.69 
 
 		 90 aa  92.8  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000631832  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0523  hypothetical protein  50 
 
 		 90 aa  92.8  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000507577  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4260  hypothetical protein  51.14 
 
 		 90 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221746  hitchhiker  0.00000000242965 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1544  hypothetical protein  47.13 
 
 		 89 aa  92  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.251513  normal  0.581544 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>