188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0257 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0257  ankyrin repeat-containing protein  100 
 
 		 912 aa  1854    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0418694  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08767  ankyrin repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_3G02830)  34.72 
 
 		 855 aa  97.1  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0941887  normal  0.535904 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  37.29 
 
 		 2413 aa  83.6  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_002978  WD0147  ankyrin repeat-containing protein  29.58 
 
 		 954 aa  80.9  0.00000000000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4090  hypothetical protein  27.17 
 
 		 427 aa  80.5  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4314  ankyrin  30.99 
 
 		 426 aa  74.7  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  30.51 
 
 		 1402 aa  74.3  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08019  Pfs, NACHT and Ankyrin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G01020)  29.36 
 
 		 1156 aa  73.2  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.596222  hitchhiker  0.00162932 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1284  ankyrin  34.31 
 
 		 870 aa  73.6  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.226002  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0738  hypothetical protein  26.59 
 
 		 1005 aa  73.2  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1152  hypothetical protein  32.56 
 
 		 339 aa  72.4  0.00000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1153  hypothetical protein  27.01 
 
 		 811 aa  72  0.00000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0909  hypothetical protein  28.98 
 
 		 865 aa  71.2  0.00000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.122525 
 
 
-
 
NC_002978  WD0385  ankyrin repeat-containing protein  27.31 
 
 		 542 aa  70.9  0.0000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.317443  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0871  hypothetical protein  35.4 
 
 		 646 aa  70.5  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.985956 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2058  hypothetical protein  30.18 
 
 		 951 aa  69.7  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3533  Ankyrin  37.06 
 
 		 173 aa  69.7  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.254367  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1865  hypothetical protein  35.34 
 
 		 138 aa  69.7  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000370925 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1784  hypothetical protein  26.98 
 
 		 511 aa  69.3  0.0000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1000  ankyrin  29.24 
 
 		 494 aa  69.3  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1634  ankyrin repeat-containing protein  27.18 
 
 		 1116 aa  69.3  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0269822  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06663  conserved hypothetical protein  28.92 
 
 		 712 aa  68.9  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.121561  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01130  conserved hypothetical protein  25.75 
 
 		 1030 aa  67  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.329359  normal  0.12831 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0228  hypothetical protein  33.33 
 
 		 750 aa  66.2  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.871268 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1221  hypothetical protein  28.77 
 
 		 472 aa  67  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0911  hypothetical protein  28.12 
 
 		 931 aa  66.6  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0380613 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0996  hypothetical protein  36.97 
 
 		 447 aa  65.9  0.000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0836466 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09003  conserved hypothetical protein  32.12 
 
 		 1387 aa  65.1  0.000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0428  Ankyrin  31.79 
 
 		 222 aa  64.7  0.000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1610  hypothetical protein  26.18 
 
 		 4520 aa  64.3  0.000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1435  hypothetical protein  31.84 
 
 		 1585 aa  64.3  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.015567 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0519  hypothetical protein  27.56 
 
 		 278 aa  63.2  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.682563 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0849  hypothetical protein  25.32 
 
 		 723 aa  63.2  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.048411 
 
 
-
 
NC_002978  WD0294  ankyrin repeat-containing protein  34.67 
 
 		 541 aa  62.8  0.00000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.365976  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2193  ankyrin  36.81 
 
 		 219 aa  62  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.862508 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2151  Ankyrin  28.03 
 
 		 490 aa  62.4  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.712677 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02364  ankyrin repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_8G06990)  23.96 
 
 		 716 aa  62  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.963301  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0766  ankyrin repeat-containing protein  26.48 
 
 		 474 aa  61.6  0.00000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.705844  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  32.8 
 
 		 731 aa  61.6  0.00000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0382  ankyrin repeat protein  32.45 
 
 		 891 aa  61.6  0.00000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2080  Ankyrin  24.68 
 
 		 668 aa  61.2  0.00000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000184702  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3438  ankyrin  29.27 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0550  ankyrin repeat-containing protein  37.82 
 
 		 329 aa  60.8  0.0000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02010  proteolysis and peptidolysis-related protein, putative  34.03 
 
 		 236 aa  60.8  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0225  hypothetical protein  37.59 
 
 		 423 aa  60.8  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.728925 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0898  ankyrin  21.81 
 
 		 450 aa  60.1  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.0000205657  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0574  hypothetical protein  24.04 
 
 		 335 aa  59.3  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1878  hypothetical protein  31.51 
 
 		 806 aa  59.7  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1096  ankyrin  28.7 
 
 		 1061 aa  59.3  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0912242  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2380  hypothetical protein  33.96 
 
 		 305 aa  58.9  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.691759  normal  0.155983 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0224  hypothetical protein  28.63 
 
 		 404 aa  58.9  0.0000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.505071 
 
 
-
 
NC_002978  WD0514  ankyrin repeat-containing protein  31.1 
 
 		 469 aa  58.5  0.0000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.919326  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0703  hypothetical protein  28.57 
 
 		 762 aa  58.2  0.0000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0219  Ankyrin  29.44 
 
 		 382 aa  58.2  0.0000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.41533e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2199  ankyrin repeat-containing protein  34.09 
 
 		 442 aa  57.4  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1797  ankyrin repeat-containing protein  31.79 
 
 		 483 aa  57.4  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1108  ankyrin repeat protein  29.52 
 
 		 740 aa  56.6  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.383427  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10397  conserved hypothetical protein  25.11 
 
 		 307 aa  56.2  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0636  hypothetical protein  29.76 
 
 		 545 aa  55.5  0.000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0285  ankyrin repeat-containing prophage LambdaW1  36.28 
 
 		 200 aa  55.5  0.000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1229  hypothetical protein  26.91 
 
 		 1249 aa  55.5  0.000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0154751 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2896  ankyrin-related protein  31.76 
 
 		 346 aa  54.7  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1144  hypothetical protein  28.16 
 
 		 2122 aa  55.1  0.000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2661  ankyrin  32.76 
 
 		 287 aa  54.7  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0806598 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3877  Ankyrin  31.67 
 
 		 226 aa  54.7  0.000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0393  hypothetical protein  31.25 
 
 		 821 aa  54.3  0.000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09187  conserved hypothetical protein  32.93 
 
 		 747 aa  54.3  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.511883 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0620  ankyrin repeat domain protein  27.22 
 
 		 289 aa  53.9  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02346  conserved hypothetical protein  23.4 
 
 		 539 aa  53.1  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.256706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1253  hypothetical protein  33.96 
 
 		 956 aa  53.5  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2693  ankyrin repeat-containing protein  29.53 
 
 		 933 aa  53.5  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.82952  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0475  ankyrin repeat-containing protein  27.22 
 
 		 249 aa  53.1  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.498558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0477  ankyrin repeat-containing protein  27.22 
 
 		 255 aa  53.1  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0395  Ankyrin  29.37 
 
 		 640 aa  53.1  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0418  Ankyrin  25.44 
 
 		 544 aa  53.1  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0622  Ankyrin  28.25 
 
 		 711 aa  53.5  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0976  Ankyrin  29.18 
 
 		 395 aa  52.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.157423  normal  0.476091 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0582  ankyrin  36.09 
 
 		 344 aa  52.8  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1618  Ankyrin  36.97 
 
 		 187 aa  52.4  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1317  hypothetical protein  30.6 
 
 		 536 aa  52  0.00004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2256  ankyrin  36.97 
 
 		 187 aa  52.4  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.410202  normal  0.75483 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0474  Ankyrin  28.93 
 
 		 868 aa  52.4  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0015  ankyrin  36.28 
 
 		 194 aa  52.4  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.189305  hitchhiker  0.00296993 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02195  conserved hypothetical protein  26.74 
 
 		 1800 aa  52  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.222907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0349  ankyrin repeat-containing protein  35.14 
 
 		 201 aa  51.6  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1824  ankyrin  30.23 
 
 		 226 aa  52  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109877  hitchhiker  0.0044061 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1063  Ankyrin  35.79 
 
 		 341 aa  51.6  0.00006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00277  hypothetical protein  35.14 
 
 		 201 aa  51.2  0.00008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.568599  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00274  predicted transcriptional regulator with ankyrin domain  35.14 
 
 		 201 aa  51.2  0.00008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.528097  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3288  Ankyrin  35.14 
 
 		 201 aa  51.2  0.00008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4739  ankyrin repeat domain protein  25.85 
 
 		 289 aa  51.2  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3305  ankyrin  35.14 
 
 		 201 aa  51.2  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0382  ankyrin repeat protein  35.14 
 
 		 201 aa  51.2  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.415795 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_5133  predicted protein  37.36 
 
 		 184 aa  51.2  0.00008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.648247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0379  ankyrin repeat-containing protein  35.14 
 
 		 201 aa  51.2  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.89591  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0337  ankyrin repeat-containing protein  35.14 
 
 		 201 aa  51.2  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1999  ankyrin repeat-containing protein  32.46 
 
 		 512 aa  51.2  0.00009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224221 
 
 
-
 
NC_003296  RS03159  ankyrin repeat-containing protein  31 
 
 		 599 aa  50.8  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.954518  normal  0.246981 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0361  ankyrin  31.94 
 
 		 301 aa  50.8  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0332017 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29424  predicted protein  36.36 
 
 		 565 aa  50.8  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0916704 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>