17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_4206 on replicon NC_007490
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007490  RSP_4206    100 
 
 		 423 bp  839    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3071  aconitate hydratase  93.62 
 
 		 2565 bp  69.9  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.146254 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2060  aconitate hydratase  100 
 
 		 2694 bp  54  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2080  aconitate hydratase 1  86.21 
 
 		 2847 bp  52  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0717816  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2333  aconitate hydratase 1  90.24 
 
 		 2664 bp  50.1  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2431  heavy metal efflux pump, CzcA family  100 
 
 		 3114 bp  50.1  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2060  heavy metal efflux pump, CzcA family  100 
 
 		 3111 bp  50.1  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2830  aconitate hydratase 1  81 
 
 		 2745 bp  48.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.901853  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3319  inner-membrane translocator  93.75 
 
 		 990 bp  48.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2340  aconitate hydratase  96.3 
 
 		 2718 bp  46.1  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0493  aconitate hydratase  96.3 
 
 		 2718 bp  46.1  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1755  aconitate hydratase  96.3 
 
 		 2718 bp  46.1  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2478  aconitate hydratase  96.3 
 
 		 2718 bp  46.1  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0931101  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1823  aconitate hydratase  96.3 
 
 		 2718 bp  46.1  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1615  aconitate hydratase  96.3 
 
 		 2718 bp  46.1  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2492  aconitate hydratase  96.3 
 
 		 2706 bp  46.1  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0800  aconitate hydratase  96.3 
 
 		 2718 bp  46.1  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>