10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_4204 on replicon NC_007490
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007490  RSP_4204  hypothetical protein  100 
 
 
105 aa  211  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2024  Rhodanese domain protein  50.77 
 
 
131 aa  61.2  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0463  rhodanese domain-containing protein  44.07 
 
 
132 aa  54.3  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000512984  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0775  Rhodanese domain protein  40.3 
 
 
124 aa  54.3  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.61343 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2860  Rhodanese domain protein  40 
 
 
129 aa  50.1  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  46.03 
 
 
170 aa  47  0.00009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0149  rhodanese domain-containing protein  56 
 
 
116 aa  44.3  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0127705 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0533  rhodanese-like protein  33.85 
 
 
124 aa  44.3  0.0006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000298777  normal  0.316081 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0487  Rhodanese domain protein  32.81 
 
 
134 aa  42.4  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0154  rhodanese domain-containing protein  44.23 
 
 
113 aa  41.6  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>