More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3965 on replicon NC_007488
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007488  RSP_3965  ABC branched chain amino acid transporter, ATPase subunit  100 
 
 
260 aa  527  1e-149  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4217  ABC transporter related  44.79 
 
 
260 aa  199  3.9999999999999996e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0739843 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1661  ABC transporter related  40.23 
 
 
260 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4046  ABC transporter related  41.13 
 
 
251 aa  185  7e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4485  ABC transporter related  40.71 
 
 
264 aa  185  7e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5130  ABC transporter related  38.49 
 
 
250 aa  184  9e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0104997 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2011  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.34 
 
 
257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  39.61 
 
 
264 aa  184  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2032  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.34 
 
 
257 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0564166  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0196  ABC transporter related  42.11 
 
 
251 aa  183  3e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4463  ABC transporter related  40.89 
 
 
265 aa  183  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27047  normal  0.236919 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3410  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.74 
 
 
257 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000400579 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  40.78 
 
 
265 aa  182  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0638  ABC transporter related protein  38.76 
 
 
260 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0293111  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1968  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.13 
 
 
257 aa  182  6e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000325906 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0357  ABC transporter related  36.86 
 
 
261 aa  181  7e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0585  ABC transporter component  41.77 
 
 
259 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1860  ABC transporter related  39.85 
 
 
259 aa  181  9.000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180905  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4328  ABC transporter related  40.08 
 
 
269 aa  181  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233197  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1767  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.74 
 
 
257 aa  181  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.790665  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1932  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.34 
 
 
257 aa  180  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1978  ABC transporter related  41.53 
 
 
259 aa  180  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.951957  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0659  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  40.08 
 
 
269 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  36.5 
 
 
256 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1793  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  38.34 
 
 
257 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1750  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.34 
 
 
257 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.844188  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1933  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  38.34 
 
 
257 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2430  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  40.3 
 
 
263 aa  178  5.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0174  ABC transporter related  40.86 
 
 
250 aa  178  7e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.159658  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2932  ABC transporter related  37.15 
 
 
263 aa  178  7e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1607  ABC transporter related  33.82 
 
 
284 aa  177  1e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.714039  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2418  ABC transporter related  36.69 
 
 
255 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4607  ABC transporter related  39.6 
 
 
251 aa  177  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0024  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  36.11 
 
 
250 aa  176  3e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0027  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  36.11 
 
 
250 aa  176  3e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0156  ABC transporter related  40.94 
 
 
252 aa  176  3e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2305  ABC transporter related protein  37.2 
 
 
251 aa  176  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2270  ABC transporter related  37.45 
 
 
257 aa  176  3e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.881925 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  39.36 
 
 
271 aa  176  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1243  ABC transporter related  40.73 
 
 
260 aa  176  4e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1802  ABC transporter related  37.94 
 
 
257 aa  176  4e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.201927  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0261  ATPase  39.29 
 
 
255 aa  176  5e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0588  ABC transporter related protein  40.08 
 
 
255 aa  176  5e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2552  ABC transporter related  36.29 
 
 
260 aa  176  5e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.94553 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3032  ABC transporter related  39.76 
 
 
275 aa  175  6e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  0.334419 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3063  ABC transporter related  39.76 
 
 
275 aa  175  6e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.542546 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3555  ABC transporter related  39.37 
 
 
256 aa  175  6e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0799958  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3017  ABC transporter related  39.76 
 
 
275 aa  175  6e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289222  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  37.85 
 
 
258 aa  175  8e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7683  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  37.8 
 
 
254 aa  174  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1945  ABC transporter related protein  37.36 
 
 
257 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0267  ABC transporter related  36.22 
 
 
598 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.59454  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2237  ABC transporter related  34.77 
 
 
255 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.945618  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1673  ABC transporter related  33.09 
 
 
284 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4747  ABC transporter related  38.19 
 
 
253 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2988  ABC transporter related  38.65 
 
 
250 aa  173  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.682077  normal  0.759622 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3571  ABC transporter related  38.98 
 
 
283 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0233348 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0989  ABC transporter related  40.16 
 
 
251 aa  173  2.9999999999999996e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  unclonable  0.00000217247 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2844  ABC transporter-related protein  39.37 
 
 
293 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191148  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20630  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  39.76 
 
 
333 aa  172  5e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172871  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3424  ABC transporter related  37.3 
 
 
255 aa  172  5e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4552  ABC transporter related  38.8 
 
 
260 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3510  ABC transporter component  38.13 
 
 
274 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.850532  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4413  ABC transporter related  39.33 
 
 
271 aa  172  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.222133  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3137  ABC transporter-related protein  38.17 
 
 
265 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.489025 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2026  ABC transporter related  36.8 
 
 
252 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1576  ABC transporter related  36.25 
 
 
250 aa  171  6.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4998  ABC transporter related  36.59 
 
 
250 aa  172  6.999999999999999e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101708  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2499  ABC transporter related  35.88 
 
 
262 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.241387  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2686  ABC transporter-like protein  38.66 
 
 
484 aa  171  7.999999999999999e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.473658  normal  0.293946 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0032  ABC transporter related  39.53 
 
 
294 aa  171  9e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1285  ABC transporter related  37.4 
 
 
256 aa  171  9e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1447  ABC transporter related  37.4 
 
 
256 aa  171  9e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0752148  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2502  ABC transporter related protein  39.04 
 
 
254 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2028  ABC transporter related  37.11 
 
 
252 aa  171  1e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.480224  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3054  ABC transporter related protein  36.33 
 
 
259 aa  170  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  38.4 
 
 
276 aa  170  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3478  ABC transporter related  39.44 
 
 
254 aa  170  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.213105 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0735  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  36.55 
 
 
256 aa  170  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4057  ABC transporter related  36.18 
 
 
254 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0519536  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4001  ABC transporter related  38.8 
 
 
251 aa  170  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.172922  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1831  ABC transporter related  36.09 
 
 
269 aa  170  2e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1873  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  36.36 
 
 
263 aa  170  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.188258 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0344  ABC transporter related  39.77 
 
 
336 aa  169  3e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.952475  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4062  ABC transporter related  38.37 
 
 
289 aa  170  3e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1373  ABC transporter related  36.93 
 
 
254 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.791476 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2096  ABC transporter related  40.15 
 
 
297 aa  169  3e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.185907  normal  0.0132496 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2314  ABC transporter related  36 
 
 
249 aa  169  3e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0178  ABC transporter related  37.4 
 
 
249 aa  169  3e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0463  ABC transporter related protein  33.2 
 
 
252 aa  169  4e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0185  ABC transporter related  38.06 
 
 
268 aa  169  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1085  ABC transporter related  37.74 
 
 
277 aa  169  6e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0894019  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2064  ABC transporter related  35.63 
 
 
260 aa  168  7e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0656  ABC transporter related  36.14 
 
 
250 aa  168  9e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.561275  normal  0.139906 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1176  ABC transporter related  38.19 
 
 
252 aa  168  9e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0938  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  38.06 
 
 
255 aa  168  9e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.248089  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2234  ABC transporter related  37.35 
 
 
249 aa  168  9e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.886454  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1985  ABC transporter related  36.44 
 
 
255 aa  168  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.356154  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0330  ABC transporter related  35.57 
 
 
292 aa  167  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3675  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  36 
 
 
632 aa  167  1e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>