More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3949 on replicon NC_007488
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007488  RSP_3949  asparaginase/glutaminase  100 
 
 
332 aa  654    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3643  hypothetical protein  77.37 
 
 
331 aa  462  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.10298  normal  0.0694182 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0303  Asparaginase/glutaminase  43.03 
 
 
333 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.203906  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4029  asparaginase  43.6 
 
 
338 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.404026 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2302  asparaginase  43.6 
 
 
333 aa  189  4e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0172769 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1819  L-asparaginases, type II  41.9 
 
 
340 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.498334  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1791  L-asparaginase, type II  41.59 
 
 
340 aa  186  5e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5182  L-asparaginase, type II  40.95 
 
 
340 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.699287  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1392  L-asparaginase, type II  40.37 
 
 
340 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6197  L-asparaginases, type II  40.63 
 
 
365 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.329515  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1905  L-asparaginase, type II  40.63 
 
 
340 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000217284 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1882  L-asparaginases, type II  40.63 
 
 
365 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1145  L-asparaginase, type II  39.64 
 
 
339 aa  178  1e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.209792  normal  0.423972 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1624  L-asparaginase, type II  36.9 
 
 
355 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.53483 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1413  asparaginase family protein  39.32 
 
 
347 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0424299  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2428  asparaginase family protein  39.32 
 
 
396 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1175  asparaginase family protein  39.32 
 
 
347 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.120195  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1902  asparaginase family protein  39.32 
 
 
347 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3402  asparaginase family protein  39.32 
 
 
347 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.432934  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2265  L-asparaginase, type II  39.32 
 
 
347 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.609083  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2305  L-asparaginase, type II  39.32 
 
 
347 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.820101  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2166  asparaginase family protein  40.06 
 
 
347 aa  171  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.559992  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2464  L-asparaginase, type II  38.44 
 
 
346 aa  169  5e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.232555  normal  0.387168 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0080  L-asparaginase  32.42 
 
 
348 aa  161  1e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1362  L-asparaginase II  34.85 
 
 
348 aa  162  1e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000230453  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1778  L-asparaginase, type II  37.13 
 
 
338 aa  160  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.116458  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3745  L-asparaginase, type II  33.64 
 
 
356 aa  160  3e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.148156  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0641  L-asparaginase, type II  33.64 
 
 
352 aa  160  4e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0646  L-asparaginase, type II  33.64 
 
 
352 aa  160  4e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0056  L-asparaginase  32.62 
 
 
348 aa  160  4e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0619  L-asparaginase, type II  33.64 
 
 
352 aa  159  5e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1025  L-asparaginase II  36.3 
 
 
347 aa  159  6e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000214281  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000646  L-asparaginase  31.14 
 
 
354 aa  159  6e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0031  L-asparaginase  32.42 
 
 
348 aa  158  1e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2586  L-asparaginase II  37.17 
 
 
345 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2674  L-asparaginase II  37.17 
 
 
345 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07280  L-asparaginase, type II  38.75 
 
 
362 aa  155  6e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.706918  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2449  asparaginase  36.74 
 
 
327 aa  155  1e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06515  L-asparaginase II  31.23 
 
 
338 aa  154  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0029  L-asparaginase  34.03 
 
 
338 aa  154  2e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.304062  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1949  L-asparaginase II  36.8 
 
 
345 aa  153  2.9999999999999998e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0010291  normal  0.072144 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3916  L-asparaginase, type II  33.43 
 
 
349 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.823534  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00150  L-asparaginase type II family protein  35.76 
 
 
328 aa  153  5e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.589872 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0029  L-asparaginase  31.53 
 
 
331 aa  152  8.999999999999999e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.51172  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1812  L-asparaginase, type II  34.77 
 
 
374 aa  151  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0266176  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1306  L-asparaginase II precursor signal peptide protein  34.37 
 
 
367 aa  149  7e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1583  asparaginase  34.78 
 
 
375 aa  149  7e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000246256  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0013  putative phage integrase  32.32 
 
 
344 aa  148  1.0000000000000001e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2132  asparaginase  35.64 
 
 
330 aa  147  3e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1178  L-asparaginase, type II  29.91 
 
 
347 aa  147  3e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4228  L-asparaginase, type II  41.38 
 
 
330 aa  146  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.965091  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1705  L-asparaginase II  36.53 
 
 
348 aa  146  6e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.108514  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3280  L-asparaginase II  32.78 
 
 
348 aa  145  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0792755 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3345  L-asparaginase II  32.78 
 
 
348 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.52837  normal  0.418181 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3449  L-asparaginase II  32.78 
 
 
348 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.65351  normal  0.38324 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3353  L-asparaginase II  32.78 
 
 
348 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.529278 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3269  L-asparaginase II  32.78 
 
 
348 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2006  L-asparaginase, type II  30.7 
 
 
348 aa  145  1e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.602671  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00300  asparaginase, aspartic hydroxamate res. (Eurofung)  31.31 
 
 
378 aa  144  2e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0205708  normal  0.375032 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1242  Asparaginase  33.53 
 
 
330 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0987888  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39982  predicted protein  31.41 
 
 
398 aa  144  2e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.551295 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3792  L-asparaginase  32.34 
 
 
347 aa  143  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0751735  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4260  L-asparaginase II  34.32 
 
 
348 aa  143  4e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02787  periplasmic L-asparaginase II  34.32 
 
 
348 aa  142  6e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00534571  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02750  hypothetical protein  34.32 
 
 
348 aa  142  6e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00507808  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4951  L-asparaginase, type II  34.94 
 
 
323 aa  142  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2689  L-asparaginase, type II  36.29 
 
 
356 aa  142  9e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.373089 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3870  L-asparaginase  32.34 
 
 
347 aa  142  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3804  L-asparaginase  32.34 
 
 
347 aa  142  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1118  L-asparaginase II  33.95 
 
 
348 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.881329 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0738  L-asparaginase, type II  33.95 
 
 
348 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3117  L-asparaginase II  33.95 
 
 
348 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3389  L-asparaginase II  33.95 
 
 
348 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3099  L-asparaginase II  33.95 
 
 
348 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149168 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3301  L-asparaginase II  33.95 
 
 
348 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3973  L-asparaginase  32.04 
 
 
347 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3912  L-asparaginase  32.04 
 
 
347 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.278506  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0757  L-asparaginase II  33.95 
 
 
348 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00188173 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2339  Asparaginase  36.54 
 
 
352 aa  140  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2492  putative asparaginase/glutaminase  43.38 
 
 
347 aa  140  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1657  L-asparaginase II  30.42 
 
 
348 aa  139  4.999999999999999e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1980  asparaginase  35.48 
 
 
333 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1181  Asparaginase  34.13 
 
 
330 aa  138  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.177192  normal  0.183755 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1955  L-asparaginase, type II  33.59 
 
 
362 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00433508 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3493  L-asparaginase, type II  33.2 
 
 
362 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.821405 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2453  L-asparaginase, type II  33.59 
 
 
362 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.620188 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3237  L-asparaginase, type II  33.2 
 
 
362 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.764535  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3136  L-asparaginase, type II  31.14 
 
 
373 aa  135  8e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.239344  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3863  L-asparaginases, type II  31.14 
 
 
366 aa  135  8e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.354581 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1606  L-asparaginase, type II  30.42 
 
 
352 aa  135  9.999999999999999e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.57786  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2924  L-asparaginase, type II  31.34 
 
 
348 aa  134  3e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3114  L-asparaginase, type II  33.94 
 
 
348 aa  134  3e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.526818  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1913  glutaminase-(asparagin-)ase  34.5 
 
 
363 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.252419  normal  0.323954 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1917  L-asparaginase, type II  31.66 
 
 
362 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.155631  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3314  L-asparaginase, type II  32.42 
 
 
346 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1550  Asparaginase  38.02 
 
 
323 aa  130  3e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.429076  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0996  L-asparaginase, type II  33.03 
 
 
346 aa  130  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.396669  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2309  asparaginase  37.04 
 
 
323 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00324768  normal  0.172792 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1337  asparaginase/glutaminase  28.92 
 
 
349 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.498063  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2007  L-asparaginase, type II  35.16 
 
 
378 aa  127  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.354174  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>