148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3485 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3485  hypothetical protein  100 
 
 		 442 aa  865    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.778826  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3129  hypothetical protein  99.77 
 
 		 442 aa  863    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.000877531  normal  0.24855 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2451  hypothetical protein  71.43 
 
 		 444 aa  596  1e-169  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0187575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2090  hypothetical protein  35.51 
 
 		 443 aa  229  1e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.612247  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00940  hypothetical protein  35.19 
 
 		 444 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0112579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0150  hypothetical protein  34.72 
 
 		 444 aa  225  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0112018  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0052  hypothetical protein  34.34 
 
 		 445 aa  216  7e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.808473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2318  hypothetical protein  33.1 
 
 		 444 aa  209  6e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0487552  hitchhiker  0.00103904 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3726  hypothetical protein  31.16 
 
 		 444 aa  209  8e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.529361  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1524  hypothetical protein  30.72 
 
 		 445 aa  205  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0393  type VI secretion protein  29.84 
 
 		 448 aa  201  3e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0320  hypothetical protein  29.84 
 
 		 448 aa  201  3e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1675  type VI secretion protein, VC_A0114 family  35.59 
 
 		 447 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.88528  hitchhiker  0.0077822 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1203  hypothetical protein  28.21 
 
 		 444 aa  197  3e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.816844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2522  type VI secretion protein  27.78 
 
 		 444 aa  194  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.711445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1471  hypothetical protein  33.48 
 
 		 444 aa  194  3e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0560986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3844  type VI secretion protein  31.91 
 
 		 444 aa  191  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0110826  normal  0.484763 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0936  type VI secretion protein, VC_A0114 family  33.1 
 
 		 447 aa  189  9e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3033  hypothetical protein  33.33 
 
 		 443 aa  187  3e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0153643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00252  ImpJ  32.32 
 
 		 445 aa  179  1e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6110  type VI secretion protein  30.57 
 
 		 448 aa  179  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.396717 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0231  hypothetical protein  27.4 
 
 		 443 aa  178  1e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0239  hypothetical protein  27.17 
 
 		 443 aa  177  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.892408 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6043  hypothetical protein  31.34 
 
 		 446 aa  177  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0233  hypothetical protein  27.4 
 
 		 443 aa  178  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3231  type VI secretion protein  28.87 
 
 		 445 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1483  type VI secretion protein  30.87 
 
 		 449 aa  175  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2875  hypothetical protein  30.87 
 
 		 449 aa  175  1.9999999999999998e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1371  hypothetical protein  30.87 
 
 		 449 aa  175  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0514  type VI secretion protein, VC_A0114 family  31.25 
 
 		 443 aa  173  5e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1223  hypothetical protein  28.15 
 
 		 443 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.629455 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1104  hypothetical protein  28.15 
 
 		 443 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1608  hypothetical protein  32.13 
 
 		 480 aa  169  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.25923  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0161  hypothetical protein  32.13 
 
 		 449 aa  169  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0138  hypothetical protein  32.13 
 
 		 452 aa  169  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0125  hypothetical protein  31.9 
 
 		 480 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3478  hypothetical protein  31.81 
 
 		 447 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.486884 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0984  hypothetical protein  29.75 
 
 		 448 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3024  type VI secretion protein  30.91 
 
 		 449 aa  164  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6677  type VI secretion protein  30.91 
 
 		 449 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0102  hypothetical protein  29.25 
 
 		 443 aa  163  6e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4080  hypothetical protein  30.02 
 
 		 445 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365614  hitchhiker  0.000139294 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3248  type VI secretion protein, VC_A0114 family  28.99 
 
 		 445 aa  161  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0238  hypothetical protein  30.8 
 
 		 448 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2617  hypothetical protein  30.02 
 
 		 445 aa  161  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.500578  normal  0.0201893 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26730  hypothetical protein  31.93 
 
 		 455 aa  161  3e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1913  hypothetical protein  30.8 
 
 		 448 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1691  hypothetical protein  30.8 
 
 		 448 aa  161  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.802444  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0926  hypothetical protein  30.8 
 
 		 448 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1213  hypothetical protein  30.8 
 
 		 448 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0329  hypothetical protein  30.8 
 
 		 448 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2188  hypothetical protein  30.8 
 
 		 448 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05852  hypothetical protein  27.31 
 
 		 441 aa  160  4e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2089  putative temperature-dependent protein secretion, ImpJ  32.04 
 
 		 448 aa  160  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2120  hypothetical protein  30.02 
 
 		 445 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1077  type VI secretion protein, VC_A0114 family  28.99 
 
 		 445 aa  158  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.414986  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000430  uncharacterized protein ImpJ/VasE  25.93 
 
 		 441 aa  157  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.959162  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0211  type VI secretion protein, VC_A0114 family  29.22 
 
 		 458 aa  158  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4055  type VI secretion protein  31.64 
 
 		 445 aa  157  3e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000569036 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2800  type VI secretion protein, VC_A0114 family  28.6 
 
 		 445 aa  157  5.0000000000000005e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42920  hypothetical protein  28.83 
 
 		 443 aa  156  8e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.227035 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3605  hypothetical protein  28.83 
 
 		 443 aa  156  8e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0397  hypothetical protein  31.6 
 
 		 467 aa  155  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0991372  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1207  ImpJ  31.6 
 
 		 454 aa  155  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.740729  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1591  hypothetical protein  31.6 
 
 		 467 aa  155  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1776  hypothetical protein  31.6 
 
 		 467 aa  155  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364892  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2967  hypothetical protein  31.6 
 
 		 467 aa  155  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0446  hypothetical protein  31.6 
 
 		 467 aa  155  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1115  putative type VI secretion protein VasE  25.65 
 
 		 440 aa  154  4e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2842  hypothetical protein  31.38 
 
 		 467 aa  154  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0252  hypothetical protein  31.53 
 
 		 468 aa  152  8e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3046  type VI secretion protein, VC_A0114 family  29.93 
 
 		 445 aa  152  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00998983  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1594  hypothetical protein  30.09 
 
 		 472 aa  151  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12244  normal  0.339701 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5579  hypothetical protein  27 
 
 		 443 aa  150  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2375  hypothetical protein  25.79 
 
 		 442 aa  149  8e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5420  hypothetical protein  27.33 
 
 		 443 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.957862  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000014  uncharacterized protein ImpJ/VasE  24.82 
 
 		 429 aa  143  5e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0399  type VI secretion protein  30.44 
 
 		 448 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.66694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2933  type VI secretion protein  30.44 
 
 		 448 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.159534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0307  type VI secretion protein  27.35 
 
 		 447 aa  139  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.300554  normal  0.0525484 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0319  type VI secretion protein, family  27.35 
 
 		 447 aa  139  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.329314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0302  hypothetical protein  27.35 
 
 		 447 aa  139  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.392469  normal  0.385972 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2642  hypothetical protein  30.44 
 
 		 448 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0464  hypothetical protein  30.44 
 
 		 448 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0442  type VI secretion protein  30.44 
 
 		 448 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.236466  normal  0.429573 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0378  hypothetical protein  30.21 
 
 		 448 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.493285  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3552  type VI secretion protein  28.7 
 
 		 451 aa  139  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0196523  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0313  type VI secretion protein, family  27.35 
 
 		 447 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.471816 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3423  hypothetical protein  28.7 
 
 		 451 aa  139  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2354  type VI secretion protein, VC_A0114 family  29 
 
 		 446 aa  138  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.401785 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3556  hypothetical protein  29.98 
 
 		 448 aa  137  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0420358  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3913  type VI secretion protein  28.75 
 
 		 416 aa  136  8e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2998  hypothetical protein  26.87 
 
 		 448 aa  135  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5264  hypothetical protein  29.57 
 
 		 448 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4910  type VI secretion protein, VC_A0114 family  27.21 
 
 		 448 aa  134  5e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000188253  hitchhiker  0.00743846 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2967  hypothetical protein  27.8 
 
 		 448 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4960  hypothetical protein  27.57 
 
 		 447 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.286001  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01968  hypothetical protein  27.07 
 
 		 448 aa  127  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.326987 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2771  type VI secretion protein  28.37 
 
 		 447 aa  127  5e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.171251  normal  0.625099 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3093  hypothetical protein  28.37 
 
 		 447 aa  126  6e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.131309  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>