12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3472 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007494  RSP_3472  hypothetical protein  100 
 
 
132 aa  248  3e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3117  hypothetical protein  96.97 
 
 
132 aa  242  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.100633  normal  0.0374199 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01170  hypothetical protein  45 
 
 
149 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.283554  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0170  hypothetical protein  45 
 
 
149 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0537  hypothetical protein  37.3 
 
 
160 aa  73.2  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2434  hypothetical protein  41.27 
 
 
138 aa  72.4  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.137351  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2333  hypothetical protein  42.06 
 
 
144 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00580597  hitchhiker  0.00510153 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4079  hypothetical protein  45.68 
 
 
163 aa  72  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000241871 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3179  hypothetical protein  50 
 
 
81 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2825  hypothetical protein  32.11 
 
 
141 aa  44.3  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0286  Rhs element Vgr protein:Gp5-like  26.27 
 
 
709 aa  43.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.856224 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0265  Rhs element Vgr protein  46.34 
 
 
731 aa  41.2  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>