More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3030 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007494  RSP_3030  ABC peptide/opine transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
314 aa  600  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  99.36 
 
 
332 aa  598  1e-170  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2637  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.23 
 
 
315 aa  238  6.999999999999999e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2626  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.56 
 
 
318 aa  231  2e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1409  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.23 
 
 
313 aa  216  4e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0709141  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.59 
 
 
313 aa  208  8e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.932563 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4455  opine ABC transporter, periplasmic binding protein, putative  38.26 
 
 
313 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000539356 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1224  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.26 
 
 
313 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.46 
 
 
313 aa  206  6e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.348462  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2404  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.7 
 
 
308 aa  204  1e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311261  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4340  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.98 
 
 
313 aa  203  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.465915  normal  0.951896 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5762  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.98 
 
 
313 aa  203  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000799384  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.3 
 
 
313 aa  202  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000789572  normal  0.0157107 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1190  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.84 
 
 
345 aa  202  6e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.16813  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0311  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.56 
 
 
313 aa  201  9.999999999999999e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5082  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.45 
 
 
314 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0845824 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.14 
 
 
334 aa  200  1.9999999999999998e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3774  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.51 
 
 
320 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542684  normal  0.67395 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0113  nickel-transporting ATPase  34.64 
 
 
336 aa  199  3e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2471  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.1 
 
 
313 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.78 
 
 
306 aa  199  3.9999999999999996e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.45 
 
 
308 aa  199  6e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.452226  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5256  putative ABC transporter (permease protein)  36.66 
 
 
313 aa  199  7e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.173409  normal  0.132635 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6675  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
306 aa  199  7e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.432582  normal  0.593084 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2003  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.22 
 
 
315 aa  198  9e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.872908 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.05 
 
 
334 aa  198  1.0000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000955673 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.89 
 
 
313 aa  198  1.0000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00112579 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0933  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.54 
 
 
313 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1197  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.66 
 
 
313 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.98 
 
 
314 aa  198  1.0000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.87 
 
 
322 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3392  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.87 
 
 
322 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.87 
 
 
322 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0476049  normal  0.20897 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0221  dipeptide ABC transporter, permease protein  35.63 
 
 
336 aa  195  7e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.74 
 
 
334 aa  195  8.000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.33 
 
 
336 aa  195  9e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.33 
 
 
336 aa  195  9e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3846  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.23 
 
 
307 aa  195  9e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.089816 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0980  glutathione ABC transporter permease  34.73 
 
 
306 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3989  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.98 
 
 
306 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0951  glutathione ABC transporter permease  34.73 
 
 
306 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.258662  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8180  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  37.06 
 
 
313 aa  194  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.119694  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00798  predicted peptide transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  34.73 
 
 
306 aa  194  2e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.472093  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2811  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.73 
 
 
306 aa  194  2e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.473558  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0856  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  34.73 
 
 
306 aa  194  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.46 
 
 
308 aa  194  2e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0918  inner membrane ABC transporter permease protein YddR  34.73 
 
 
306 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.145156  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0889  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  34.73 
 
 
306 aa  194  2e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.952014  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00815  hypothetical protein  34.73 
 
 
306 aa  194  2e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.558182  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1001  glutathione ABC transporter permease  34.95 
 
 
306 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3257  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  36.98 
 
 
306 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4120  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.8 
 
 
338 aa  193  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0727691 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0891  glutathione ABC transporter, permease protein  34.95 
 
 
306 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.976092  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0902  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  34.73 
 
 
306 aa  194  2e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2813  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.73 
 
 
306 aa  194  2e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2348  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.93 
 
 
338 aa  194  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0644  oligopeptide ABC transporter, permease protein  35.2 
 
 
314 aa  193  3e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0982  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  34.95 
 
 
306 aa  193  3e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5088  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  37.3 
 
 
313 aa  193  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1251  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.09 
 
 
313 aa  192  4e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0714175 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2357  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.63 
 
 
336 aa  193  4e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0452163  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.54 
 
 
313 aa  192  5e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.18227  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.92 
 
 
324 aa  192  6e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1552  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.84 
 
 
306 aa  192  7e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3063  alkaline phosphatase  35.03 
 
 
336 aa  192  7e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.273839 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0395  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.35 
 
 
334 aa  192  8e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2517  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  34.41 
 
 
306 aa  191  1e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.503163  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6391  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, inner membrane subunit  34.73 
 
 
336 aa  191  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314486  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.27 
 
 
336 aa  190  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3276  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.98 
 
 
306 aa  190  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.819891  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1409  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.84 
 
 
306 aa  191  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14841  normal  0.0482429 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.91 
 
 
316 aa  190  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.33 
 
 
336 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2955  alkaline phosphatase  35.33 
 
 
336 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5358  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  35.58 
 
 
315 aa  191  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1662  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.72 
 
 
314 aa  189  4e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.409377 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2973  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.48 
 
 
306 aa  189  4e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.628351  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1187  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.94 
 
 
304 aa  189  5e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.127096  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2848  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.49 
 
 
314 aa  189  5e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.965219  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0859  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.42 
 
 
333 aa  189  5e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000322853  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3039  nickel-transporting ATPase  34.73 
 
 
336 aa  189  5e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.408808 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0386  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.08 
 
 
312 aa  189  8e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3004  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.87 
 
 
306 aa  188  8e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3132  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.08 
 
 
326 aa  188  8e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.467018  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.75 
 
 
321 aa  187  1e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1620  peptide ABC transporter, permease protein  33.44 
 
 
321 aa  187  1e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.911317 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.9 
 
 
311 aa  187  1e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.642024 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.87 
 
 
306 aa  188  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.740963 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5290  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  35.37 
 
 
307 aa  187  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.728282  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.72 
 
 
314 aa  187  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4367  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.54 
 
 
313 aa  187  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.380096  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0984  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.18 
 
 
313 aa  187  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.422815  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.55 
 
 
306 aa  187  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3753  Alkaline phosphatase  34.43 
 
 
336 aa  187  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.634321 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2812  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.13 
 
 
336 aa  187  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532586  normal  0.117752 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2762  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.81 
 
 
322 aa  187  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.3137  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4284  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.72 
 
 
323 aa  187  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.181861  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1080  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.94 
 
 
307 aa  187  3e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.810626  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1510  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.12 
 
 
341 aa  186  3e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000209407  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1752  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.37 
 
 
306 aa  186  4e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0655426  normal  0.0792402 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>