More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2150 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2150  glycosyl transferase  100 
 
 		 237 aa  456  1e-127  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0824  glycosyl transferase family protein  95.71 
 
 		 234 aa  426  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.216941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3618  hypothetical protein  60.54 
 
 		 240 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07780  glycosyl transferase family 2  35.61 
 
 		 209 aa  117  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1438  glycosyl transferase family 2  35.21 
 
 		 213 aa  114  8.999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.192606  normal  0.0852028 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1807  glycosyl transferase family 2  34.93 
 
 		 222 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1651  glycosyl transferase family protein  33.98 
 
 		 206 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0453  LmbE-like protein  36.14 
 
 		 693 aa  99.8  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1041  glycosyl transferase family protein  36.06 
 
 		 222 aa  97.1  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0213116 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1549  glycosyl transferase family protein  34.04 
 
 		 228 aa  94.7  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1959  glycosyl transferase family 2  37.98 
 
 		 212 aa  92  7e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.597827  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1787  family 2 glycosyl transferase  37.56 
 
 		 210 aa  89  5e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.350467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0298  glycosyl transferase family 2  32.04 
 
 		 217 aa  89.4  5e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00219104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1389  glycosyl transferase family 2  37.17 
 
 		 226 aa  86.7  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1090  glycosyl transferase family protein  32.82 
 
 		 236 aa  82  0.000000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.11948  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6919  glycosyl transferase family 2  34.27 
 
 		 241 aa  81.6  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00000675814  hitchhiker  0.000119796 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0136  dolichyl-phosphate mannose synthase  43.97 
 
 		 226 aa  78.2  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.908094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1685  glycosyl transferase family 2  28.65 
 
 		 231 aa  77.8  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.908588  hitchhiker  0.00379696 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4987  glycosyl transferase family protein  37.12 
 
 		 235 aa  77.8  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278061  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5098  glycosyl transferase family protein  46.97 
 
 		 336 aa  78.2  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0752  glycosyl transferase family protein  45.61 
 
 		 243 aa  77  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000917436  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4474  glycosyl transferase family protein  37.12 
 
 		 235 aa  77  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0455914 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4853  glycosyl transferase family 2  36.36 
 
 		 227 aa  73.2  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0488  glycosyl transferase family protein  40.87 
 
 		 362 aa  72.4  0.000000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.814661  hitchhiker  0.0000013139 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2933  glycosyl transferase family 2  41.35 
 
 		 355 aa  71.6  0.000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.175593 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1612  glycosyl transferase family protein  44.74 
 
 		 231 aa  71.6  0.000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2044  glycosyl transferase family 2  38.39 
 
 		 230 aa  71.2  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.462866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01630  glycosyl transferase  43.8 
 
 		 285 aa  71.2  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.76765 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2961  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  39.82 
 
 		 334 aa  69.3  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.720485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0396  glycosyl transferase family protein  34.23 
 
 		 229 aa  68.6  0.00000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.54121  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0260  glycosyl transferase family 2  42.15 
 
 		 273 aa  67.4  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.306809  normal  0.712495 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1164  glycosyl transferase family protein  48.91 
 
 		 320 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.164128  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2355  glycosyl transferase family 2  46.07 
 
 		 250 aa  66.6  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.024577  hitchhiker  0.0000348766 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  43.96 
 
 		 752 aa  66.6  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  35.95 
 
 		 1099 aa  65.9  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3189  glycosyl transferase family 2  41.67 
 
 		 279 aa  66.2  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.343721  normal  0.0208978 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  31.01 
 
 		 461 aa  65.5  0.0000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3136  glycosyl transferase family protein  37.93 
 
 		 305 aa  65.5  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12873  glycosyltransferase  29.17 
 
 		 238 aa  65.5  0.0000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.514986  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0794  glycosyl transferase family 2  36.21 
 
 		 291 aa  64.7  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3099  glycosyl transferase family protein  33.09 
 
 		 232 aa  65.1  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000071788  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0506  glycosyl transferase  32 
 
 		 332 aa  63.9  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641026  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2755  glycosyl transferase family protein  40.35 
 
 		 224 aa  64.3  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0370264  hitchhiker  0.00782478 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4198  glycosyl transferase family protein  35.43 
 
 		 358 aa  63.2  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.797946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1305  glycosyl transferase family protein  32.17 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  38.71 
 
 		 337 aa  62.8  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0596  dolichol-phosphate mannosyltransferase  35.34 
 
 		 305 aa  62  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5302  glycosyl transferase family protein  45.65 
 
 		 380 aa  62  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157801  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  43.01 
 
 		 428 aa  61.6  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3118  glycosyl transferase family protein  35.25 
 
 		 235 aa  61.6  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000616031  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0429  glycosyl transferase  35.29 
 
 		 328 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.541189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1526  glycosyl transferase family 2  41.24 
 
 		 334 aa  61.2  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0593  glycosyl transferase family protein  50 
 
 		 268 aa  61.6  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0581  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 		 228 aa  61.2  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.529493  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0170  glycosyl transferase family 2  42.74 
 
 		 250 aa  60.5  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.121302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1366  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 		 228 aa  61.2  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000927738 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1577  glycosyl transferase family 2  35.5 
 
 		 238 aa  60.8  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.469655 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0165  glycosyl transferase family protein  31.93 
 
 		 321 aa  60.5  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000128177 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0400  glycosyl transferase family protein  39.47 
 
 		 344 aa  60.8  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156434  normal  0.0492083 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0146  glycosyl transferase family protein  42.11 
 
 		 336 aa  60.8  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.90394 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0837  glycosyl transferase family 2  39.02 
 
 		 253 aa  60.8  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02310  glycosyl transferase  35.14 
 
 		 354 aa  60.1  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0589  glycosyl transferase family protein  30.34 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0471  glycosyl transferase family 2  47.78 
 
 		 246 aa  60.1  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1627  glycosyl transferase family protein  31.15 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0667673  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3771  glycosyl transferase family protein  34.19 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0464  glycosyl transferase  37.23 
 
 		 310 aa  59.3  0.00000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0763  glycosyl transferase family 2  41.59 
 
 		 250 aa  59.3  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.855183  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0771  glycosyl transferase family protein  42.71 
 
 		 339 aa  59.3  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.417869  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001053  glycosyltransferase  27.4 
 
 		 333 aa  59.3  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.110978  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0532  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 		 315 aa  58.9  0.00000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.356755  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0034  family 2 glycosyl transferase  35.71 
 
 		 246 aa  59.3  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0087  glycosyl transferase family 2  32.95 
 
 		 450 aa  58.9  0.00000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0083  glycosyltransferase  31.06 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.413849  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1081  glycosyl transferase family protein  41.76 
 
 		 324 aa  58.9  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0364187  normal  0.921384 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04060  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  40 
 
 		 274 aa  58.9  0.00000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0635  glycosyl transferase family 2  35.42 
 
 		 310 aa  58.5  0.00000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1767  glycosyl transferase family 2  32.26 
 
 		 331 aa  58.5  0.00000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.969271  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0599  glycosyl transferase family protein  35.71 
 
 		 343 aa  58.5  0.00000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1442  glycosyl transferase family protein  28.03 
 
 		 312 aa  57.8  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1158  glycosyl transferase family 2  32.95 
 
 		 324 aa  58.2  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0715  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.79 
 
 		 334 aa  58.2  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.887983  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2410  glycosyl transferase family 2  33.67 
 
 		 331 aa  58.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.488157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1232  glycosyl transferase family protein  41.11 
 
 		 481 aa  58.2  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06620  glycosyl transferase family 2  34.26 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.74936e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5303  glycosyl transferase family protein  38 
 
 		 339 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00285782 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3898  glycosyl transferase family 2  39.39 
 
 		 285 aa  57.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1142  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  33.58 
 
 		 321 aa  57.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  29.58 
 
 		 509 aa  57  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0339  glycosyl transferase family protein  29.02 
 
 		 320 aa  57.4  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0298954 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1816  glycosyl transferase family 2  30.34 
 
 		 333 aa  57.4  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1110  glycosyl transferase family 2  27.74 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0704361  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3947  glycosyl transferase family 2  30 
 
 		 445 aa  57.4  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1880  glycosyl transferase family 2  30.08 
 
 		 325 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00309208 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3622  glycosyl transferase family protein  32.89 
 
 		 398 aa  57.4  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00095064 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13662  glycosyltransferase  35.59 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0122731 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2284  glycosyl transferase family protein  35.96 
 
 		 334 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.911482 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1049  glycosyl transferase family 2  35.79 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17011  glycosyl transferase family protein  33.68 
 
 		 320 aa  57  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.553457  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3168  glycosyl transferase family 2  34.58 
 
 		 299 aa  57  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.912354  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>