18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1300 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1300  hypothetical protein  100 
 
 		 312 aa  637    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2959  phosphoesterase, PA-phosphatase related  99.04 
 
 		 310 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2732  phosphoesterase, PA-phosphatase related  86.22 
 
 		 310 aa  503  1e-141  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5022  phosphoesterase PA-phosphatase related  54.91 
 
 		 342 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0363817  normal  0.508261 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0869  hypothetical protein  46.35 
 
 		 296 aa  171  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4217  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33 
 
 		 384 aa  62.8  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3529  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.8 
 
 		 361 aa  57.8  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.938289  normal  0.0139793 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1577  hypothetical protein  29.92 
 
 		 392 aa  57.4  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.353635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05520  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.93 
 
 		 308 aa  54.3  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000494508  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1136  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.93 
 
 		 273 aa  52.8  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0282  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.92 
 
 		 246 aa  52  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0187484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5780  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.33 
 
 		 430 aa  49.3  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.313383  normal  0.564601 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28361  hypothetical protein  31.03 
 
 		 245 aa  47  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.647337 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0773  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.93 
 
 		 252 aa  46.2  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0824  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.93 
 
 		 241 aa  45.4  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2785  bacitracin transport permease  33.78 
 
 		 199 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0349348  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15070  PAP2 superfamily protein  30.77 
 
 		 198 aa  43.1  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.872818 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0111  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.98 
 
 		 174 aa  42.7  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>