More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0056 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0056  flagellum-specific ATPase FliI  100 
 
 		 442 aa  873    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.155055  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1644  FliI/YscN family ATPase  93.21 
 
 		 442 aa  803    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0546828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1691  FliI/YscN family ATPase  99.32 
 
 		 442 aa  867    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.000838765  hitchhiker  0.000219126 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1290  FliI/YscN family ATPase  55.34 
 
 		 432 aa  417  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.490407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2933  ATPase FliI/YscN  54.89 
 
 		 443 aa  413  1e-114  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2532  flagellum-specific ATP synthase  49.55 
 
 		 456 aa  400  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.634395 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2578  flagellum-specific ATP synthase  51.18 
 
 		 456 aa  392  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.21202  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2188  flagellum-specific ATP synthase  51.66 
 
 		 456 aa  395  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.559151 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0436  flagellar protein export ATPase FliI  52.28 
 
 		 465 aa  393  1e-108  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00154444  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2135  flagellum-specific ATP synthase  51.66 
 
 		 456 aa  395  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000819921 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2130  flagellum-specific ATP synthase  51.66 
 
 		 456 aa  395  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.150864 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1147  flagellum-specific ATP synthase  51.66 
 
 		 456 aa  395  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1270  flagellum-specific ATP synthase  51.66 
 
 		 456 aa  395  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.855799 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1888  flagellum-specific ATP synthase  50.95 
 
 		 456 aa  390  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1161  flagellar protein export ATPase FliI  49.09 
 
 		 458 aa  386  1e-106  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.489016  normal  0.0133257 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1966  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway ATPase, FliI/YscN  53.16 
 
 		 460 aa  385  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.302767  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1877  ATPase, FliI/YscN family  52.93 
 
 		 461 aa  388  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.23531  normal  0.467079 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3445  flagellar protein export ATPase FliI  48.39 
 
 		 443 aa  384  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1543  ATPase, FliI/YscN family  49.76 
 
 		 454 aa  383  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2903  ATPase, FliI/YscN family  49.32 
 
 		 464 aa  385  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1185  flagellum-specific ATP synthase  49.89 
 
 		 446 aa  382  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1707  ATPase, FliI/YscN family  50.69 
 
 		 457 aa  380  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.883446  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2717  flagellum-specific ATP synthase  50.69 
 
 		 457 aa  380  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.920357  normal  0.437776 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2356  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway ATPase, FliI/YscN  52.35 
 
 		 480 aa  379  1e-104  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.721701  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1243  flagellum-specific ATP synthase  50.69 
 
 		 457 aa  380  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2041  flagellum-specific ATP synthase  50.69 
 
 		 457 aa  380  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1327  flagellum-specific ATP synthase  50.47 
 
 		 446 aa  379  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2174  flagellum-specific ATP synthase  50.69 
 
 		 457 aa  380  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.136515  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1701  flagellum-specific ATP synthase  50.69 
 
 		 457 aa  380  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0163805 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3225  flagellum-specific ATP synthase  49.21 
 
 		 445 aa  377  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6416  ATPase FliI/YscN  50.24 
 
 		 519 aa  375  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.853929 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1573  flagellum-specific ATP synthase  51.42 
 
 		 456 aa  377  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1440  flagellum-specific ATP synthase  49.21 
 
 		 445 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3086  flagellar protein export ATPase FliI  49.77 
 
 		 514 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0810317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3065  flagellum-specific ATP synthase  49.21 
 
 		 445 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.65037 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0163  ATPase FliI/YscN  49.17 
 
 		 552 aa  377  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2933  flagellum-specific ATP synthase  49.21 
 
 		 445 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2923  flagellum-specific ATP synthase  49.21 
 
 		 445 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2453  flagellar protein export ATPase FliI  49.77 
 
 		 513 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0279683  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3044  flagellum-specific ATP synthase  49.65 
 
 		 444 aa  378  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1285  flagellum-specific ATP synthase  49.43 
 
 		 445 aa  377  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1352  flagellum-specific ATP synthase  49.43 
 
 		 445 aa  377  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0849869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0712  flagellar protein export ATPase FliI  50.6 
 
 		 458 aa  377  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.564841 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3064  flagellar protein export ATPase FliI  49.55 
 
 		 524 aa  375  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00978  flagellum-specific ATP synthase  51.71 
 
 		 458 aa  376  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.17913  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50100  flagellum-specific ATP synthase  49.29 
 
 		 451 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0131838 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3067  flagellar protein export ATPase FliI  49.77 
 
 		 513 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0128753  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1345  flagellum-specific ATP synthase  49.43 
 
 		 445 aa  378  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.446012 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1369  flagellum-specific ATP synthase  49.21 
 
 		 446 aa  377  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1994  flagellum-specific ATP synthase  49.51 
 
 		 463 aa  376  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06188  flagellum-specific ATP synthase  51.71 
 
 		 458 aa  376  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0195618  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3773  flagellar protein export ATPase FliI  49.17 
 
 		 549 aa  375  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.542284 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2934  FliI/YscN family ATPase  48.61 
 
 		 547 aa  375  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4171  ATPase, FliI/YscN family  50.23 
 
 		 478 aa  372  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.763526  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2573  flagellum-specific ATP synthase  48.31 
 
 		 445 aa  372  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1603  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway ATPase FliI  50.11 
 
 		 468 aa  373  1e-102  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.111585 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2011  flagellum-specific ATP synthase  50.11 
 
 		 484 aa  372  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3691  flagellum-specific ATP synthase  49.16 
 
 		 452 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.625099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4267  flagellum-specific ATP synthase  49.29 
 
 		 451 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.540128  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0197  flagellum-specific ATP synthase FliI  50.24 
 
 		 509 aa  374  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2394  flagellum-specific ATP synthase  50.11 
 
 		 472 aa  373  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.159626  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1975  ATPase FliI/YscN  48.86 
 
 		 472 aa  373  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2293  flagellum-specific ATP synthase  49.89 
 
 		 472 aa  372  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.673762  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5264  flagellum-specific ATP synthase  48.64 
 
 		 486 aa  374  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.553459  normal  0.0874558 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2978  flagellar protein export ATPase FliI  49.09 
 
 		 513 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.728984 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4366  flagellum-specific ATP synthase  47.92 
 
 		 451 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.821632  normal  0.648773 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3063  flagellum-specific ATP synthase  48.3 
 
 		 446 aa  371  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1621  flagellum-specific ATP synthase  49.77 
 
 		 446 aa  370  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3278  flagellum-specific ATP synthase FliI  49.88 
 
 		 523 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.313514  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1721  flagellum-specific ATP synthase FliI  47.8 
 
 		 449 aa  371  1e-101  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1721  flagellum-specific ATP synthase FliI  48.17 
 
 		 449 aa  370  1e-101  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0770  ATPase FliI/YscN  47.59 
 
 		 472 aa  371  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.127902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1501  flagellum-specific ATP synthase  47.92 
 
 		 451 aa  368  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.351897 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0414  flagellar protein export ATPase FliI  49.88 
 
 		 526 aa  371  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.26287  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2950  flagellum-specific ATP synthase  50.93 
 
 		 453 aa  369  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24200  Flagellum-specific ATPase  49.11 
 
 		 459 aa  371  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00829367  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3403  flagellum-specific ATP synthase FliI  49.88 
 
 		 523 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3112  flagellar protein export ATPase FliI  49.53 
 
 		 513 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.547472  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0231  flagellar protein export ATPase FliI  49.88 
 
 		 523 aa  371  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0228517  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2145  flagellum-specific ATP synthase FliI  49.88 
 
 		 523 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.741139  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0219  flagellar protein export ATPase FliI  49.88 
 
 		 523 aa  371  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.114937  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04976  flagellum-specific ATP synthase  48.05 
 
 		 450 aa  369  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2943  flagellum-specific ATP synthase FliI  49.88 
 
 		 523 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.136999  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0393  flagellum-specific ATP synthase  49.32 
 
 		 481 aa  367  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.948849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4728  flagellar protein export ATPase FliI  49.32 
 
 		 479 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.696414  normal  0.0278522 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3927  flagellum-specific ATP synthase  48.69 
 
 		 451 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.84184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1958  ATPase FliI/YscN  51.06 
 
 		 468 aa  367  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.191624  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2822  flagellum-specific ATP synthase  48.35 
 
 		 448 aa  365  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0128266 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2294  flagellum-specific ATP synthase  51.07 
 
 		 446 aa  367  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3651  ATPase, FliI/YscN family  49.32 
 
 		 479 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.801513 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0568  flagellar biosynthesis ATPase  49.21 
 
 		 487 aa  364  2e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.722995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001189  flagellum-specific ATP synthase FliI  47.14 
 
 		 448 aa  364  2e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3454  flagellum-specific ATP synthase  47.81 
 
 		 452 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0495  flagellar protein export ATPase FliI  50.11 
 
 		 449 aa  361  1e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2185  flagellum-specific ATP synthase  47.63 
 
 		 458 aa  361  1e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1961  flagellum-specific ATP synthase FliI  48.81 
 
 		 452 aa  360  2e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.341576  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5100  ATPase FliI/YscN  47.79 
 
 		 488 aa  361  2e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.956813  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1348  ATPase FliI/YscN  46.87 
 
 		 470 aa  361  2e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1364  flagellum-specific ATP synthase  47.72 
 
 		 446 aa  360  2e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0080  FliI/YscN family ATPase  46.41 
 
 		 445 aa  361  2e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>