More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0049 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1684  putative CheA signal transduction histidine kinases  100 
 
 		 399 aa  786    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.300413  hitchhiker  0.0019378 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0049  chemotaxis histidine protein kinase, CheA4  100 
 
 		 399 aa  786    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1637  putative CheA signal transduction histidine kinase  86.22 
 
 		 399 aa  680    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0810  CheA signal transduction histidine kinases  39.58 
 
 		 715 aa  295  8e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1197  chemotaxis protein histidine kinase  41.91 
 
 		 887 aa  295  1e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0132818  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0585  chemotaxis protein histidine kinase  41.11 
 
 		 719 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.648466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0612  CheA signal transduction histidine kinase  41.06 
 
 		 652 aa  282  9e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02250  putative two-component sensor  40.75 
 
 		 639 aa  277  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.108586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1599  CheA signal transduction histidine kinase  39.64 
 
 		 722 aa  276  3e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00193702 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4378  CheA signal transduction histidine kinase  40.36 
 
 		 725 aa  276  3e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0611  CheA signal transduction histidine kinase  37.28 
 
 		 683 aa  276  5e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.527763 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2143  chemotaxis protein cheA  42.08 
 
 		 684 aa  276  5e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0258  putative two-component sensor  40.97 
 
 		 625 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.678329  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2315  CheA signal transduction histidine kinase  37.05 
 
 		 665 aa  275  1.0000000000000001e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1399  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  40.52 
 
 		 693 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1852  CheA signal transduction histidine kinase  41.53 
 
 		 664 aa  273  6e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.758409  normal  0.445859 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0186  CheA signal transduction histidine kinase  37.14 
 
 		 688 aa  272  8.000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0567  CheA signal transduction histidine kinases  38.68 
 
 		 729 aa  271  2e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176437  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3563  CheA signal transduction histidine kinase  41.41 
 
 		 679 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0974951 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2176  CheA signal transduction histidine kinases  39.74 
 
 		 709 aa  270  4e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3790  CheA signal transduction histidine kinases  39.02 
 
 		 710 aa  269  7e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4316  Chemotaxis protein histidine kinase  41.04 
 
 		 685 aa  268  8.999999999999999e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3064  CheA signal transduction histidine kinase  38.76 
 
 		 710 aa  268  1e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0433  CheA signal transduction histidine kinase  38.9 
 
 		 730 aa  268  1e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.645464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1936  CheA signal transduction histidine kinases  40.58 
 
 		 783 aa  268  1e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.163875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3264  CheA signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 		 679 aa  268  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.671676 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0204  chemotaxis protein CheA  39.58 
 
 		 758 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0156  chemotaxis protein CheA  39.16 
 
 		 747 aa  266  4e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.93752  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0113  CheA signal transduction histidine kinase  39.06 
 
 		 686 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0655  CheA signal transduction histidine kinase  38.52 
 
 		 732 aa  265  7e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.666621 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4160  CheA signal transduction histidine kinase  39.31 
 
 		 724 aa  265  1e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4048  CheA signal transduction histidine kinase  39.31 
 
 		 724 aa  265  1e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.507068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00032  chemotaxis protein CheA  40.74 
 
 		 669 aa  265  1e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.814284  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1408  chemotaxis sensor histidine kinase transcription regulator protein  39.05 
 
 		 726 aa  264  2e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.146245 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2098  CheA signal transduction histidine kinase  38.27 
 
 		 724 aa  264  2e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.214324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2093  CheA signal transduction histidine kinases  39.53 
 
 		 736 aa  264  2e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.768244 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1881  CheA signal transduction histidine kinases  39.53 
 
 		 736 aa  264  2e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.254979 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1533  CheA signal transduction histidine kinase  41.39 
 
 		 750 aa  263  3e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.037058 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1624  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  38.14 
 
 		 691 aa  263  6e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.885628  normal  0.805041 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2218  CheA signal transduction histidine kinases  39.27 
 
 		 704 aa  262  6e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2974  CheA signal transduction histidine kinase  38.12 
 
 		 772 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000131554 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0901  CheA signal transduction histidine kinases  38.48 
 
 		 720 aa  261  2e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3495  putative CheA signal transduction histidine kinase  38.28 
 
 		 695 aa  261  2e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2364  CheA signal transduction histidine kinase  38.22 
 
 		 724 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0219649  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2859  chemotaxis protein CheA  36.64 
 
 		 767 aa  260  3e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0786  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  38.52 
 
 		 705 aa  260  3e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.380059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0119  CheA Signal transduction histidine Kinases(STHK)  38.38 
 
 		 766 aa  260  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2247  CheA signal transduction histidine kinase  38.22 
 
 		 728 aa  260  3e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.390749  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3435  chemotaxis protein CheA  36.64 
 
 		 767 aa  260  3e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3116  chemotaxis protein CheA  36.64 
 
 		 767 aa  260  3e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1684  chemotaxis protein CheA  36.64 
 
 		 767 aa  260  3e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.41407  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3107  putative CheA signal transduction histidine kinases  36.6 
 
 		 806 aa  260  4e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0913  chemotaxis sensor histidine kinase CheA  38.24 
 
 		 700 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3815  CheA signal transduction histidine kinase  38.52 
 
 		 766 aa  259  6e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  36.01 
 
 		 660 aa  259  7e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22610  CheA signal transduction histidine kinase  34.74 
 
 		 699 aa  259  7e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2026  CheA signal transduction histidine kinase  38.5 
 
 		 666 aa  259  7e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3689  CheA signal transduction histidine kinase  37.92 
 
 		 671 aa  258  9e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.296916  normal  0.0151662 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0332  CheA signal transduction histidine kinase  38.24 
 
 		 756 aa  258  1e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1142  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  39.05 
 
 		 741 aa  258  1e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3182  chemotaxis protein CheA  37.21 
 
 		 749 aa  258  1e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.671944  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0165  CheA signal transduction histidine kinase  36.6 
 
 		 761 aa  258  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.690811 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0166  CheA signal transduction histidine kinase  36.98 
 
 		 677 aa  257  3e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2851  CheA signal transduction histidine kinases  36.34 
 
 		 756 aa  257  3e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0169  CheA signal transduction histidine kinases  36.34 
 
 		 744 aa  257  3e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.454346  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0256  CheA signal transduction histidine kinases  36.34 
 
 		 756 aa  257  3e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.228038  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0182  CheA signal transduction histidine kinase  36.34 
 
 		 743 aa  256  4e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1446  CheA signal transduction histidine kinase  38.12 
 
 		 760 aa  256  5e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0238  CheA signal transduction histidine kinase  36.34 
 
 		 750 aa  256  5e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.119172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0077  chemotaxis protein CheA  36.72 
 
 		 765 aa  256  5e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2167  CheA signal transduction histidine kinases  38.74 
 
 		 703 aa  256  5e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0949772  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3855  chemotaxis protein CheA  36.72 
 
 		 762 aa  256  6e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3936  chemotaxis protein CheA  36.72 
 
 		 765 aa  256  7e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2121  chemotaxis protein CheA  37.96 
 
 		 702 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2106  CheA signal transduction histidine kinase  38.12 
 
 		 709 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0264  CheA signal transduction histidine kinase  38.19 
 
 		 654 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.555417 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1584  chemotaxis histidine protein kinase  38.24 
 
 		 654 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.678464  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1080  CheA signal transduction histidine kinase  39.06 
 
 		 682 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000655427 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24340  Chemotaxis sensory histidine protein kinase; CheA  38.28 
 
 		 697 aa  254  2.0000000000000002e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1989  ATP-binding region ATPase domain protein  34.2 
 
 		 678 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0236  CheA signal transduction histidine kinases  38.24 
 
 		 654 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3623  CheA signal transduction histidine kinase  37.98 
 
 		 747 aa  253  3e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0124085 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3299  CheA signal transduction histidine kinase  36.55 
 
 		 671 aa  253  5.000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3358  CheA signal transduction histidine kinase  36.46 
 
 		 749 aa  253  6e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.701672  normal  0.794513 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0656  CheA signal transduction histidine kinase  36.41 
 
 		 871 aa  251  1e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.552424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0630  CheA signal transduction histidine kinase  37.66 
 
 		 702 aa  251  1e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5608  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  36.48 
 
 		 673 aa  251  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3296  CheW-like protein  37.89 
 
 		 733 aa  250  2e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1728  CheA signal transduction histidine kinase  36.39 
 
 		 919 aa  251  2e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1607  CheA signal transduction histidine kinases  39.15 
 
 		 707 aa  251  2e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0690  CheA signal transduction histidine kinase  35.51 
 
 		 673 aa  250  3e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2311  CheA signal transduction histidine kinase  38.25 
 
 		 690 aa  250  3e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0091  CheA signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 		 702 aa  250  3e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0467  CheA signal transduction histidine kinase  38.79 
 
 		 724 aa  250  3e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.31682 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0220  CheA signal transduction histidine kinase  36.8 
 
 		 957 aa  250  4e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0106413  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3215  CheA signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 684 aa  250  4e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.647718 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1134  CheA signal transduction histidine kinase  34.54 
 
 		 675 aa  249  5e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0174  CheA signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 		 919 aa  249  5e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00798527  normal  0.714787 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4420  CheA signal transduction histidine kinase  37.34 
 
 		 598 aa  249  5e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3317  CheA signal transduction histidine kinase  40.2 
 
 		 536 aa  249  6e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>