More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0042 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0042  chemotaxis histidine protein kinase, CheA3  100 
 
 		 1095 aa  2119    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1630  putative CheA signal transduction histidine kinase  76.02 
 
 		 1059 aa  1169    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.571724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1677  putative CheA signal transduction histidine kinases  97.99 
 
 		 1095 aa  1815    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0952257  hitchhiker  0.00934326 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1418  CheA signal transduction histidine kinase  23.94 
 
 		 713 aa  90.5  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.224123 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1637  putative CheA signal transduction histidine kinase  33.55 
 
 		 399 aa  75.1  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22610  CheA signal transduction histidine kinase  20.59 
 
 		 699 aa  74.7  0.000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3064  CheA signal transduction histidine kinase  26.77 
 
 		 710 aa  74.3  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3790  CheA signal transduction histidine kinases  26.77 
 
 		 710 aa  73.6  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0567  CheA signal transduction histidine kinases  22.74 
 
 		 729 aa  72.8  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176437  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0258  putative two-component sensor  25.51 
 
 		 625 aa  73.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.678329  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0585  chemotaxis protein histidine kinase  23.82 
 
 		 719 aa  72.8  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.648466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2487  CheA signal transduction histidine kinase  28.74 
 
 		 725 aa  72.4  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0430185  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02250  putative two-component sensor  25.22 
 
 		 639 aa  72.4  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.108586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2583  CheA signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 711 aa  71.6  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1852  CheA signal transduction histidine kinase  26.51 
 
 		 664 aa  71.2  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.758409  normal  0.445859 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0656  CheA signal transduction histidine kinase  22.06 
 
 		 871 aa  70.9  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.552424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00032  chemotaxis protein CheA  26.85 
 
 		 669 aa  71.2  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.814284  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0505  chemotaxis sensor histidine kinase, putative  32.69 
 
 		 832 aa  71.2  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.391708  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1336  CheA signal transduction histidine kinase  22.87 
 
 		 657 aa  71.2  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.280744  normal  0.428976 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3815  CheA signal transduction histidine kinase  23.95 
 
 		 766 aa  70.5  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1370  CheA signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 		 687 aa  70.1  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0938961  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2841  CheA signal transduction histidine kinases  26.63 
 
 		 748 aa  70.1  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.922689  normal  0.260415 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0220  CheA signal transduction histidine kinase  24.83 
 
 		 957 aa  70.1  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0106413  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1792  CheA signal transduction histidine kinase  23.01 
 
 		 701 aa  70.1  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0810  CheA signal transduction histidine kinases  19 
 
 		 715 aa  70.5  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2004  CheA signal transduction histidine kinase  31.72 
 
 		 796 aa  69.7  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.370377  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0221  putative chemotaxis sensor histidine kinase  31.41 
 
 		 864 aa  69.7  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1402  putative chemotaxis sensor histidine kinase  31.41 
 
 		 864 aa  69.7  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1599  putative chemotaxis sensor histidine kinase  31.41 
 
 		 864 aa  69.7  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0258  putative chemotaxis sensor histidine kinase  31.41 
 
 		 864 aa  69.7  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.334424  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0726  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  22.47 
 
 		 784 aa  68.9  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.550154 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0964  chemotaxis histidine kinase  31.41 
 
 		 1079 aa  69.3  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0049  chemotaxis histidine protein kinase, CheA4  32 
 
 		 399 aa  69.3  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2683  chemotaxis histidine kinase/response regulator  31.41 
 
 		 864 aa  69.3  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2538  chemotaxis histidine kinase/response regulator  31.41 
 
 		 864 aa  69.3  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1684  putative CheA signal transduction histidine kinases  32 
 
 		 399 aa  69.3  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.300413  hitchhiker  0.0019378 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  20.96 
 
 		 770 aa  68.9  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1612  CheA signal transduction histidine kinase  22.16 
 
 		 694 aa  68.9  0.0000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0166152  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1524  CheA signal transduction histidine kinases  32.24 
 
 		 766 aa  68.6  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.82922 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0658  CheA signal transduction histidine kinases  25.45 
 
 		 928 aa  68.2  0.0000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.231862  normal  0.831096 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1599  CheA signal transduction histidine kinase  24.42 
 
 		 722 aa  67.8  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00193702 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0734  CheA signal transduction histidine kinase  25.81 
 
 		 920 aa  67.4  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.424907  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2161  putative CheA signal transduction histidine kinases  22.7 
 
 		 767 aa  67.4  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2359  CheA signal transduction histidine kinase  23.15 
 
 		 756 aa  67.8  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1446  CheA signal transduction histidine kinase  25.06 
 
 		 760 aa  67.4  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0655  CheA signal transduction histidine kinase  25.85 
 
 		 732 aa  67  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.666621 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  22.61 
 
 		 681 aa  67  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3425  CheA signal transduction histidine kinase  21.88 
 
 		 745 aa  66.6  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.630026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0148  chemotaxis protein CheA  23.51 
 
 		 720 aa  67  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0119  CheA Signal transduction histidine Kinases(STHK)  23.65 
 
 		 766 aa  67  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2985  chemotaxis protein CheA  22.42 
 
 		 655 aa  67.4  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2285  CheA signal transduction histidine kinases  34.29 
 
 		 584 aa  66.6  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3296  CheW-like protein  27.1 
 
 		 733 aa  66.6  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3376  CheA signal transduction histidine kinase  31.47 
 
 		 911 aa  66.2  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.163998  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2176  CheA signal transduction histidine kinases  25.23 
 
 		 709 aa  65.9  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1624  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  23.24 
 
 		 691 aa  65.9  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.885628  normal  0.805041 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4224  CheA signal transduction histidine kinases  25.12 
 
 		 801 aa  65.9  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.424073  normal  0.980488 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4378  CheA signal transduction histidine kinase  26.96 
 
 		 725 aa  65.9  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2974  CheA signal transduction histidine kinase  23.65 
 
 		 772 aa  65.9  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000131554 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0036  CheA signal transduction histidine kinase  31.29 
 
 		 742 aa  65.5  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0228  CheA signal transduction histidine kinase  21.89 
 
 		 671 aa  65.1  0.000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1512  chemotaxis protein CheA  23.93 
 
 		 681 aa  65.1  0.000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0308171  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  19.66 
 
 		 803 aa  64.7  0.000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2736  CheA signal transduction histidine kinase  25.76 
 
 		 687 aa  64.7  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1855  chemotaxis protein CheA  23.65 
 
 		 662 aa  64.7  0.000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.110168  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2611  chemotaxis protein CheA  23.36 
 
 		 669 aa  63.9  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.561376  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0958  CheA signal transduction histidine kinase  22.46 
 
 		 1286 aa  64.3  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0238  CheA signal transduction histidine kinases  24.92 
 
 		 764 aa  64.3  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3196  CheA signal transduction histidine kinase  22.92 
 
 		 542 aa  64.3  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0636  CheA signal transduction histidine kinase  23.19 
 
 		 544 aa  64.3  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.83539e-26 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4048  CheA signal transduction histidine kinase  24.36 
 
 		 724 aa  63.5  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.507068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0868  CheA signal transduction histidine kinase  34.91 
 
 		 1063 aa  63.9  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4160  CheA signal transduction histidine kinase  24.36 
 
 		 724 aa  63.5  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1577  CheA signal transduction histidine kinase  32.46 
 
 		 954 aa  63.9  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.199949  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1872  CheA signal transduction histidine kinase  29.31 
 
 		 937 aa  63.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134352  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1383  CheA signal transduction histidine kinase  20.97 
 
 		 1031 aa  63.9  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1728  CheA signal transduction histidine kinase  21.49 
 
 		 919 aa  63.5  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1178  CheA signal transduction histidine kinase  21.88 
 
 		 715 aa  63.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.72434  normal  0.652884 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2466  chemotaxis protein CheA  22.61 
 
 		 674 aa  63.5  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.406126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0174  CheA signal transduction histidine kinase  28.85 
 
 		 919 aa  63.9  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00798527  normal  0.714787 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0296  chemotaxis protein CheA, putative  22.54 
 
 		 610 aa  63.2  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0505  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  30.93 
 
 		 2325 aa  63.2  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.806325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0622  CheA signal transduction histidine kinase  23.19 
 
 		 543 aa  62.8  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3563  CheA signal transduction histidine kinase  21.85 
 
 		 679 aa  62.8  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0974951 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0774  CheA signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 1030 aa  63.2  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.142014 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3299  CheA signal transduction histidine kinase  21.24 
 
 		 671 aa  62.8  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1408  chemotaxis sensor histidine kinase transcription regulator protein  24.26 
 
 		 726 aa  62.8  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.146245 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0186  CheA signal transduction histidine kinase  22.6 
 
 		 688 aa  62.8  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0165  CheA signal transduction histidine kinase  23.81 
 
 		 761 aa  62.4  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.690811 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1482  CheA signal transduction histidine kinases  27.13 
 
 		 734 aa  62.8  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181827 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0907  CheA signal transduction histidine kinase  31.68 
 
 		 911 aa  62.4  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0908129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1936  CheA signal transduction histidine kinases  23.53 
 
 		 783 aa  62.4  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.163875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2027  CheA signal transduction histidine kinase  20.92 
 
 		 691 aa  62  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0417  CheA signal transduction histidine kinase  26.01 
 
 		 896 aa  61.6  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0485913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1197  chemotaxis protein histidine kinase  21.71 
 
 		 887 aa  62  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0132818  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1491  chemotaxis protein CheA  27.33 
 
 		 801 aa  61.6  0.00000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0407  CheA signal transduction histidine kinase  26.01 
 
 		 896 aa  61.6  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0655  CheA signal transduction histidine kinase  21.45 
 
 		 695 aa  61.6  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000249153 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1540  chemotaxis protein CheA  23.36 
 
 		 672 aa  61.6  0.00000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0565086  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1817  CheA signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 937 aa  61.2  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>