175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS03743 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003296  RS03743  cobalt-precorrin-6Y C(5)-methyltransferase  100 
 
 
235 aa  483  1e-136  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.929331  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2361  cobalt-precorrin-6Y C(5)-methyltransferase  67.25 
 
 
228 aa  321  6e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1857  cobalt-precorrin-6Y C(5)-methyltransferase  37.99 
 
 
252 aa  142  5e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.323877 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3459  cobalt-precorrin-6Y C(5)-methyltransferase  37.12 
 
 
262 aa  135  5e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1003  precorrin-6y C5,15-methyltransferase (decarboxylating), CbiE subunit  35.15 
 
 
269 aa  129  6e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0005  precorrin-6y C5,15-methyltransferase subunit CbiE  30.49 
 
 
238 aa  107  1e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0112  precorrin-6y C5,15-methyltransferase (decarboxylating), CbiE subunit  27.68 
 
 
227 aa  96.3  4e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0874  cobalt-precorrin-6Y C(5)-methyltransferase  25.25 
 
 
206 aa  77.8  0.0000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_68  cobalamin-binding protein  28.05 
 
 
517 aa  67.8  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1446  cobalt-precorrin-6Y C(5)-methyltransferase  23.62 
 
 
208 aa  65.9  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0473  cobalt-precorrin-6Y C(5)-methyltransferase  24.62 
 
 
208 aa  66.2  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.871662  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1528  cobalt-precorrin-6Y C(5)-methyltransferase  30.14 
 
 
211 aa  63.2  0.000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00214205 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0364  cobalt-precorrin-6Y C(5)-methyltransferase  24.12 
 
 
208 aa  62.8  0.000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0392216  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0572  precorrin-3B C17-methyltransferase  33.6 
 
 
800 aa  62.8  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1300  precorrin-3B C17-methyltransferase  31.36 
 
 
253 aa  59.7  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0315  precorrin-3B C17-methyltransferase  25.64 
 
 
243 aa  58.5  0.00000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1223  cobalt-precorrin-6Y C(5)-methyltransferase  32.58 
 
 
203 aa  58.2  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.849201  normal  0.519405 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1233  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.74 
 
 
254 aa  56.2  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.323489  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2373  precorrin-6Y C5,15-methyltransferase, putative  27.7 
 
 
199 aa  54.7  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000521714  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3107  cobalt-factor II C20-methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase  30.06 
 
 
239 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1492  cobalt-precorrin-6Y C(5)-methyltransferase  27.27 
 
 
195 aa  53.5  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0558  precorrin-6y C5,15-methyltransferase (decarboxylating), CbiE subunit  30.36 
 
 
761 aa  53.1  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.409078  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1264  precorrin-3B C17-methyltransferase  30.33 
 
 
778 aa  53.5  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2713  precorrin-6y C5,15-methyltransferase (decarboxylating), CbiE subunit  27.11 
 
 
208 aa  53.1  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00369831  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1433  precorrin-6y C5,15-methyltransferase (decarboxylating)  22.62 
 
 
203 aa  52.4  0.000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0756043  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3216  cobalt-precorrin-6Y C(5)-methyltransferase  27.48 
 
 
193 aa  52  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0442  precorrin-6Y C5-methyltransferase  26.24 
 
 
446 aa  52  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0477  precorrin-6Y C5,15-methyltransferase (decarboxylating)  26.24 
 
 
446 aa  52  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1549  precorrin-3B C17-methyltransferase  27.83 
 
 
520 aa  52  0.000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121512  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1012  precorrin-3B C17-methyltransferase  30.25 
 
 
472 aa  52  0.000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0296  precorrin-6Y C5,15-methyltransferase, putative  32.28 
 
 
166 aa  51.6  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.368136  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2864  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.36 
 
 
510 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.29074  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1239  precorrin-6y C5,15-methyltransferase (decarboxylating)  22.17 
 
 
203 aa  51.2  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.112336  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4060  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  31.84 
 
 
265 aa  51.6  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1077  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.9 
 
 
490 aa  51.2  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0490237  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0623  precorrin-3B C17-methyltransferase  23.48 
 
 
240 aa  50.8  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0224111  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1440  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  34.78 
 
 
215 aa  50.8  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.294168 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0540  cobalt-precorrin-6Y C(5)-methyltransferase  21.4 
 
 
228 aa  50.8  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2616  precorrin-3B C17-methyltransferase  25.22 
 
 
596 aa  50.4  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17171  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  23.28 
 
 
600 aa  50.1  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17291  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  24.14 
 
 
600 aa  49.7  0.00004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.792145  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0704  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  23.48 
 
 
235 aa  49.7  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0319  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.55 
 
 
497 aa  49.3  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0637  precorrin-3B C17-methyltransferase  28.46 
 
 
837 aa  49.3  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.647433 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2296  precorrin-6Y C5,15-methyltransferase (decarboxylating)  26.91 
 
 
427 aa  48.9  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.784802  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0147  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  25.18 
 
 
202 aa  49.3  0.00006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.110313  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0626  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  32.39 
 
 
202 aa  48.5  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4366  precorrin-3 methyltransferase  29.84 
 
 
663 aa  48.5  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.216409 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2355  precorrin-3B C17-methyltransferase  31.67 
 
 
512 aa  48.5  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0146728  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0861  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.97 
 
 
472 aa  48.1  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.402872  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17041  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  22.41 
 
 
604 aa  48.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0447  precorrin-3 C-17 methylase  28.1 
 
 
329 aa  47.8  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.980014  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0482  precorrin-3 C-17 methylase  28.1 
 
 
329 aa  47.8  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2359  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  32.85 
 
 
203 aa  47.8  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5891  siroheme synthase  26.99 
 
 
493 aa  47.4  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06660  putative uroporphyrin-III c-methyltransferase  28.86 
 
 
279 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.253082  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0611  putative uroporphyrin-III c-methyltransferase  28.86 
 
 
279 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.33315  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2235  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.13 
 
 
470 aa  47.4  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1428  precorrin-3B C17-methyltransferase  26.13 
 
 
240 aa  47  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0114869  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1234  precorrin-3B C17-methyltransferase  26.13 
 
 
240 aa  46.6  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0777573  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3128  precorrin-3 methyltransferase  26.45 
 
 
423 aa  46.6  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2492  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.99 
 
 
272 aa  47  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1714  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.24 
 
 
236 aa  47  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0817  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.97 
 
 
476 aa  47  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.994278 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0662  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.19 
 
 
271 aa  46.6  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2313  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.28 
 
 
502 aa  46.2  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3154  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  31.03 
 
 
449 aa  46.2  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0503959  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1546  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.87 
 
 
283 aa  46.6  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.402925  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2314  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.14 
 
 
256 aa  46.2  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.144109 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1343  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.22 
 
 
484 aa  46.2  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2296  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.03 
 
 
490 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.12544  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0787  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.69 
 
 
273 aa  46.6  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.464331  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0803  precorrin-6Y C5,15-methyltransferase (decarboxylating)  28.05 
 
 
403 aa  45.8  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3744  siroheme synthase  31.93 
 
 
457 aa  45.8  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1015  precorrin-3B C17-methyltransferase  24.77 
 
 
240 aa  46.2  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3539  cobyric acid synthase CobQ  26.4 
 
 
776 aa  45.8  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3519  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.87 
 
 
480 aa  45.8  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.605082  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03219  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase/uroporphyrinogen methyltransferase  31.93 
 
 
457 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0344  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.93 
 
 
457 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3650  siroheme synthase  31.93 
 
 
457 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000355794 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4048  siroheme synthase  34.17 
 
 
459 aa  45.8  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0232  siroheme synthase  31.93 
 
 
473 aa  45.8  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0344  siroheme synthase  31.93 
 
 
457 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.898093 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2728  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.47 
 
 
277 aa  45.8  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03171  hypothetical protein  31.93 
 
 
457 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4679  siroheme synthase  31.93 
 
 
457 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.839222 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3959  siroheme synthase  31.93 
 
 
473 aa  45.8  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2375  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.38 
 
 
507 aa  45.8  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.656731 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3564  siroheme synthase  31.93 
 
 
457 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3838  siroheme synthase  31.93 
 
 
457 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3345  uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.33 
 
 
449 aa  45.4  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0672  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.69 
 
 
273 aa  45.4  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00608831 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3719  siroheme synthase  31.93 
 
 
470 aa  45.4  0.0007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.411824  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0931  cobalamin biosynthesis protein CbiD  25.63 
 
 
576 aa  45.4  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.738737  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3362  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.2 
 
 
480 aa  45.4  0.0008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3581  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  29.93 
 
 
464 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249196  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1880  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.51 
 
 
255 aa  45.4  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1500  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.32 
 
 
259 aa  45.4  0.0008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0795  siroheme synthase (Includes: Uroporphyrin-III C-methyltransferase, Precorrin-2 dehydrogenase,Sirohydrochlorin ferrochelatase)  25.82 
 
 
275 aa  45.4  0.0008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.751719  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0428  uroporphyrinogen III synthase HEM4  34.92 
 
 
526 aa  45.4  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.256746  hitchhiker  0.000733658 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>