46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS03138 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS03138  proline rich transmembrane protein  100 
 
 		 142 aa  276  5e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.497108  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4299  protein of unknown function DUF333  60.67 
 
 		 145 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4187  protein of unknown function DUF333  60.67 
 
 		 145 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2198  protein of unknown function DUF333  50 
 
 		 501 aa  65.9  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0706  hypothetical protein  50 
 
 		 201 aa  57.8  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3072  hypothetical protein  40 
 
 		 512 aa  57.4  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00570768  hitchhiker  0.00425561 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2222  hypothetical protein  45.45 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0898  hypothetical protein  49.09 
 
 		 84 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.966435 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0124  hypothetical protein  52.27 
 
 		 160 aa  52  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0979  protein of unknown function DUF333  39.22 
 
 		 81 aa  50.8  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00603291  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4771  hypothetical protein  50 
 
 		 249 aa  49.7  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000131093 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0128  hypothetical protein  37.14 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000259025 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0135  hemolysin protein, putative  43.33 
 
 		 96 aa  50.1  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0123  hypothetical protein  34.29 
 
 		 98 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0162016 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0221  hypothetical protein  45.1 
 
 		 124 aa  48.9  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0538  hemolysin  43.48 
 
 		 93 aa  48.5  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2271  hypothetical protein  42.42 
 
 		 85 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.523223  normal  0.11814 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0128  hypothetical protein  46 
 
 		 85 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4226  hypothetical protein  46 
 
 		 82 aa  47.8  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.998691  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0129  hypothetical protein  32.86 
 
 		 98 aa  47.4  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000902821 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0133  hypothetical protein  46 
 
 		 85 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4072  hypothetical protein  48.94 
 
 		 83 aa  47  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0719802 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1379  hypothetical protein  43.55 
 
 		 97 aa  47  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0132  protein of unknown function DUF333  46 
 
 		 85 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2321  hypothetical protein  37.97 
 
 		 93 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.552946  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2199  hypothetical protein  37.97 
 
 		 93 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1879  putative lipoprotein  42.86 
 
 		 84 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1850  protein of unknown function DUF333  42.86 
 
 		 84 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1840  hypothetical protein  42.86 
 
 		 84 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.310442  normal  0.289479 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2517  putative lipoprotein  42.86 
 
 		 84 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.678196 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01762  conserved outer membrane protein  42.86 
 
 		 84 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.566585  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01750  hypothetical protein  42.86 
 
 		 84 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.428407  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2046  putative lipoprotein  42.86 
 
 		 84 aa  45.1  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1398  putative lipoprotein  44.07 
 
 		 84 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.115884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2017  putative lipoprotein  44.07 
 
 		 84 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00047259  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1777  protein of unknown function DUF333  35.71 
 
 		 92 aa  43.5  0.0009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0995  hypothetical protein  37.04 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.512791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0995  hypothetical protein  39.13 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5610  hypothetical protein  45.65 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0668347  normal  0.937642 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1961  hypothetical protein  41.86 
 
 		 93 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.426504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000746  hemolysin  36.96 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1671  hypothetical protein  47.73 
 
 		 93 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0833154  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2306  hypothetical protein  47.73 
 
 		 93 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2283  hypothetical protein  47.73 
 
 		 93 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.395959  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1660  hypothetical protein  38.98 
 
 		 80 aa  40.4  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1871  hypothetical protein  45.45 
 
 		 213 aa  40  0.01  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.764601  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>