More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS03086 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0430  acriflavin resistance protein  42.67 
 
 		 1031 aa  727    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.31117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4543  acriflavin resistance protein  53.52 
 
 		 1033 aa  1049    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.266065 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3300  acriflavin resistance protein  39.43 
 
 		 1108 aa  697    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.992116  normal  0.412729 
 
 
-
 
NC_003296  RS01779  transporter lipoprotein transmembrane  54.58 
 
 		 1405 aa  1054    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03086  transporter transmembrane protein  100 
 
 		 1034 aa  2075    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.43508  normal  0.286784 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3825  acriflavin resistance protein  44.12 
 
 		 1036 aa  785    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1374  acriflavin resistance protein  43.47 
 
 		 1028 aa  734    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.244767  decreased coverage  0.0000403817 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1148  acriflavin resistance protein  44 
 
 		 1048 aa  821    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.356784  normal  0.75467 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3964  acriflavin resistance protein  55.41 
 
 		 1035 aa  1099    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000156628 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2622  acriflavin resistance protein  61 
 
 		 1014 aa  1190    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2083  RND superfamily multidrug efflux system protein  47.01 
 
 		 1036 aa  897    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.334854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0459  acriflavin resistance protein  53.44 
 
 		 1027 aa  1082    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3045  acriflavin resistance protein  39.64 
 
 		 1108 aa  703    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1892  acriflavin resistance protein  41.36 
 
 		 1031 aa  757    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2375  acriflavin resistance protein  41.82 
 
 		 1103 aa  751    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.296544 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3031  acriflavin resistance protein  41.94 
 
 		 1042 aa  773    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4744  acriflavin resistance protein  40.88 
 
 		 1028 aa  726    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.277916 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3922  acriflavin resistance protein  42.31 
 
 		 1046 aa  748    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.081539 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2855  cation efflux transporter  40.42 
 
 		 1088 aa  752    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.478721  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5161  acriflavin resistance protein  42.43 
 
 		 1050 aa  778    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.938326  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3464  Acr family transporter  40.23 
 
 		 1101 aa  725    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1280  acriflavin resistance protein  43.39 
 
 		 1037 aa  776    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0345102 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2927  acriflavin resistance protein  42.65 
 
 		 1009 aa  775    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.310729  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4290  acriflavin resistance protein  42.21 
 
 		 1046 aa  746    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0982359  normal  0.0358979 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0894  acriflavin resistance protein  41.62 
 
 		 1060 aa  780    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1338  acriflavin resistance protein  40.75 
 
 		 1044 aa  744    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0039  acriflavin resistance protein  40.06 
 
 		 1060 aa  681    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5613  acriflavin resistance protein  63.18 
 
 		 1050 aa  1262    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4104  acriflavin resistance protein  53.63 
 
 		 1031 aa  1084    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0885  acriflavin resistance protein  41.54 
 
 		 1053 aa  756    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4034  acriflavin resistance protein  42.9 
 
 		 1037 aa  771    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0427  acriflavin resistance protein  43.92 
 
 		 1039 aa  801    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.513566  normal  0.0142489 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3023  acriflavin resistance protein  45.21 
 
 		 1027 aa  803    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.904124 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5103  acriflavin resistance protein  42.65 
 
 		 1044 aa  769    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.869946 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4395  acriflavin resistance protein  42.35 
 
 		 1047 aa  748    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.882422 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1006  acriflavin resistance protein  40.97 
 
 		 1058 aa  777    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00411218  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3373  acriflavin resistance protein  53.6 
 
 		 1031 aa  1049    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.306386  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3610  acriflavin resistance protein  41.3 
 
 		 1040 aa  761    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35819  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2399  acriflavin resistance protein  46.43 
 
 		 1032 aa  888    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.774253  normal  0.772443 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5659  acriflavin resistance protein  60.8 
 
 		 1022 aa  1189    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.891494  normal  0.720908 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0806  acriflavin resistance protein  40.02 
 
 		 1042 aa  749    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.326964 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7483  Acr family transporter  62.45 
 
 		 1027 aa  1245    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.10196  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0466  acriflavin resistance protein  41.88 
 
 		 1031 aa  739    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0468485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7283  Acr family transporter  59.49 
 
 		 1018 aa  1112    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2378  acriflavin resistance protein  39.33 
 
 		 1044 aa  702    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.856569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0557  AcrB/AcrD/AcrF family mulitdrug efflux protein  41.76 
 
 		 1046 aa  747    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.644093  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1667  acriflavin resistance protein  42.9 
 
 		 1037 aa  797    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.29656  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2410  acriflavin resistance protein  54.06 
 
 		 1036 aa  1098    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.904497  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3889  acriflavin resistance protein  43.39 
 
 		 1018 aa  772    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0552128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2354  acriflavin resistance protein  45.4 
 
 		 1027 aa  887    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3471  acriflavin resistance protein  53.52 
 
 		 1033 aa  1049    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0282385  normal  0.0800862 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0907  acriflavin resistance protein  41.22 
 
 		 1043 aa  740    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.582716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4664  acriflavin resistance protein  53.5 
 
 		 1025 aa  1034    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2967  acriflavin resistance protein  72.6 
 
 		 1032 aa  1458    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.510734  normal  0.0225941 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3902  acriflavin resistance protein  55.18 
 
 		 1044 aa  1105    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.263563  normal  0.110043 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4023  acriflavin resistance protein  53.6 
 
 		 1031 aa  1050    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.349324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4834  acriflavin resistance protein  51.8 
 
 		 1083 aa  1032    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4107  AcrB/AcrD/AcrF family mulitdrug efflux protein  43.65 
 
 		 1067 aa  787    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.666055  normal  0.120279 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0397  acriflavin resistance protein  42.67 
 
 		 1031 aa  728    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.675147 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2137  putative transporter lipoprotein transmembrane  56.06 
 
 		 1028 aa  1121    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.379778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1438  acriflavin resistance protein  40.51 
 
 		 1088 aa  753    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.539754  normal  0.0180094 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1505  acriflavin resistance protein  40.61 
 
 		 1088 aa  741    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0176509 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  32.83 
 
 		 1496 aa  536  1e-151  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  30.67 
 
 		 1032 aa  535  1e-150  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0238  acriflavin resistance protein  34.05 
 
 		 1067 aa  525  1e-147  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  32.39 
 
 		 1095 aa  526  1e-147  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  31.78 
 
 		 1070 aa  521  1e-146  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0237  acriflavin resistance protein  33.97 
 
 		 1054 aa  517  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  31.9 
 
 		 1036 aa  515  1e-144  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0248  acriflavin resistance protein  33.97 
 
 		 1054 aa  516  1e-144  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  32.42 
 
 		 1039 aa  515  1e-144  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  31.3 
 
 		 1038 aa  514  1e-144  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  32.56 
 
 		 1069 aa  514  1e-144  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  31.99 
 
 		 1041 aa  512  1e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0226  acriflavin resistance protein  33.97 
 
 		 1054 aa  512  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.38584  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  32.5 
 
 		 1470 aa  513  1e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  33.08 
 
 		 1071 aa  508  9.999999999999999e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  34.82 
 
 		 1055 aa  504  1e-141  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  32.49 
 
 		 1065 aa  498  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2601  acriflavin resistance protein  32.09 
 
 		 1066 aa  484  1e-135  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  30.86 
 
 		 1058 aa  478  1e-133  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3955  acriflavin resistance protein  31.38 
 
 		 1075 aa  471  1.0000000000000001e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542775  normal  0.203686 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0451  acriflavin resistance protein  31.5 
 
 		 1055 aa  470  1.0000000000000001e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.931818 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  34.89 
 
 		 1028 aa  467  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1006  acriflavin resistance plasma membrane protein  30.16 
 
 		 1040 aa  467  9.999999999999999e-131  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.236802  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0063  acriflavin resistance protein  30.93 
 
 		 1033 aa  465  1e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  30.01 
 
 		 1034 aa  464  1e-129  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1515  acriflavin resistance protein  31.5 
 
 		 1038 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  31.32 
 
 		 1043 aa  460  9.999999999999999e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0160  acriflavin resistance protein  33.3 
 
 		 1033 aa  456  1e-127  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2498  acriflavin resistance protein  31.27 
 
 		 1041 aa  458  1e-127  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  34.69 
 
 		 1028 aa  454  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2982  acriflavin resistance protein  33.11 
 
 		 1028 aa  450  1e-125  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  29.01 
 
 		 1043 aa  450  1e-125  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  29.09 
 
 		 1059 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2371  acriflavin resistance protein  30.27 
 
 		 1035 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.916635  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0979  acriflavin resistance protein  29.77 
 
 		 1009 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.650548  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1652  acriflavin resistance protein  30.45 
 
 		 1037 aa  444  1e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.257724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2022  acriflavin resistance protein  32.34 
 
 		 1041 aa  446  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.625222  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0960  acriflavin resistance protein  32.24 
 
 		 1047 aa  444  1e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>