More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_4119 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_4119  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 347 aa  702    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.527545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1844  glycosyl transferase family protein  88.18 
 
 		 347 aa  627  1e-179  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000858357 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1339  glycosyl transferase family 2  83.33 
 
 		 347 aa  586  1e-166  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1679  glycosyl transferase family protein  76.52 
 
 		 347 aa  536  1e-151  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4719  glycosyl transferase family protein  78.9 
 
 		 346 aa  529  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.19129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2567  glycosyl transferase family protein  74.14 
 
 		 348 aa  503  1e-141  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3189  glycosyl transferase family protein  75.57 
 
 		 348 aa  502  1e-141  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2352  glycosyl transferase family protein  59.02 
 
 		 363 aa  379  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0302049  normal  0.854444 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02791  hypothetical protein  44.58 
 
 		 346 aa  285  7e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1377  glycosyl transferase family protein  42.27 
 
 		 323 aa  272  8.000000000000001e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0520964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6128  glycosyltransferase  44.79 
 
 		 367 aa  270  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.286179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4251  glycosyl transferase family protein  42.81 
 
 		 339 aa  268  8.999999999999999e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0532513  unclonable  0.0000000143866 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0132  glycosyl transferase family protein  45.72 
 
 		 383 aa  268  1e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0409142  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0149  glycosyl transferase  45.39 
 
 		 337 aa  266  4e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.70371  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0713  glycosyl transferase  41.99 
 
 		 343 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0273832 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0135  glycosyl transferases-like  43.46 
 
 		 319 aa  264  2e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0498044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4438  glycosyl transferase family 2  42.81 
 
 		 330 aa  263  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4457  glycosyl transferase family 2  42.99 
 
 		 335 aa  263  3e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4500  glycosyl transferase family 2  43.14 
 
 		 330 aa  263  3e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.12555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01670  SfII prophage-derived bactoprenol glucosyl transferase  43.32 
 
 		 348 aa  259  5.0000000000000005e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0722504  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2174  glycosyl transferase family 2  40 
 
 		 350 aa  255  7e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0771  glycosyl transferase family protein  42.21 
 
 		 339 aa  255  8e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.417869  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3629  glycosyl transferase family protein  42.46 
 
 		 345 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2876  glycosyl transferase family protein  45.66 
 
 		 334 aa  253  5.000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0399631 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0724  glycosyl transferase family protein  43.46 
 
 		 347 aa  251  2e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.54019  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5968  glycosyltransferase  43.56 
 
 		 373 aa  250  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0337928  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1751  glycosyl transferase family 2  43.56 
 
 		 373 aa  250  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.357367 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3057  glycosyl transferase family 2  42.76 
 
 		 339 aa  249  3e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.187191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5303  glycosyl transferase family protein  46.91 
 
 		 339 aa  246  3e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00285782 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1863  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.24 
 
 		 332 aa  246  4e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0609042  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1452  glycosyl transferase family 2  43.93 
 
 		 334 aa  246  4.9999999999999997e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.411296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1776  glycosyl transferase  43.08 
 
 		 320 aa  246  4.9999999999999997e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1650  glycosyl transferase family protein  42.81 
 
 		 331 aa  245  9.999999999999999e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.402224  normal  0.30355 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2219  glycosyl transferase family 2  41.96 
 
 		 327 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.660827  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0561  glycosyl transferase family protein  44.52 
 
 		 334 aa  243  3e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0656  glycosyl transferase family protein  42.95 
 
 		 338 aa  243  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.453348 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1526  glycosyl transferase family 2  43.32 
 
 		 334 aa  242  7.999999999999999e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2398  hypothetical protein  41.56 
 
 		 319 aa  241  1e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2876  glycosyl transferase family 2  38.36 
 
 		 320 aa  241  1e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2635  glycosyl transferase family protein  43.75 
 
 		 340 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5901  glycosyl transferase family 2  44.95 
 
 		 339 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.389873  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1246  glycosyl transferase family protein  42.99 
 
 		 342 aa  238  8e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000114042  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2543  hypothetical protein  40.91 
 
 		 319 aa  237  2e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0373  glycosyl transferase family 2  41.39 
 
 		 332 aa  236  3e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.249101 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0539  glycosyl transferase family 2  42.68 
 
 		 357 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.150486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1685  glycosyl transferase family protein  42.11 
 
 		 360 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.543739 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3950  glycosyl transferase family protein  41.1 
 
 		 312 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0599  glycosyl transferase family protein  41.97 
 
 		 343 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1173  glycosyl transferase family 2  42.27 
 
 		 319 aa  233  3e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000473476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1379  glycosyl transferase family protein  39.51 
 
 		 340 aa  232  6e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.603449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0800  glycosyl transferase family protein  40.79 
 
 		 366 aa  231  1e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.985817 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0124  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.37 
 
 		 326 aa  231  1e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.854442  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5572  glycosyl transferase family 2  43.09 
 
 		 340 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00642792  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5394  bactoprenol glucosyl transferase  39.87 
 
 		 312 aa  231  2e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0668  bactoprenol glucosyl transferase  41.29 
 
 		 308 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0212  glycosyl transferase family 2  38.84 
 
 		 331 aa  230  2e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.921554  normal  0.557032 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0135  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.18 
 
 		 326 aa  230  3e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00814446  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0724  bactoprenol glucosyl transferase  41.03 
 
 		 306 aa  229  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.459902 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0603  bactoprenol glucosyl transferase  41.04 
 
 		 308 aa  229  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.607961  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4447  glycosyl transferase family protein  41.03 
 
 		 364 aa  229  5e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0659  bactoprenol glucosyl transferase  40.97 
 
 		 308 aa  229  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0655  bactoprenol glucosyl transferase  41.78 
 
 		 310 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0863  ribonuclease III  40.46 
 
 		 312 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0415  bactoprenol glucosyl transferase  41.45 
 
 		 310 aa  227  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.81511  hitchhiker  0.00033312 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3637  glycosyl transferase family 2  39.94 
 
 		 336 aa  227  3e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0288  glycosyl transferase family protein  42.36 
 
 		 335 aa  227  3e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0334  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.57 
 
 		 319 aa  226  6e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.954695 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2778  glycosyl transferase family protein  42.16 
 
 		 333 aa  224  1e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.2611  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1307  glycosyl transferase family 2  35.83 
 
 		 321 aa  224  1e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.235499  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2576  glycosyl transferase family 2  39.17 
 
 		 356 aa  224  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2949  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.79 
 
 		 353 aa  223  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1303  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.79 
 
 		 353 aa  223  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3075  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.79 
 
 		 353 aa  223  3e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.34037  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1943  glycosyl transferase family 2  37.14 
 
 		 322 aa  223  3e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  0.190394 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0385  glycosyl transferase family 2  36.16 
 
 		 311 aa  223  4e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0394  glycosyl transferase family 2  36.16 
 
 		 311 aa  223  4e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0608  glycosyl transferase  40.52 
 
 		 306 aa  222  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.163631 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2662  glycosyl transferase family protein  36.79 
 
 		 341 aa  222  7e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.562323  normal  0.531483 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1307  Ribonuclease III  39.47 
 
 		 306 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00145921  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2681  b-glycosyltransferase, glycosyltransferase family 2 protein  36.04 
 
 		 312 aa  221  9.999999999999999e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2260  bactoprenol glucosyl transferase  40.13 
 
 		 353 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5555  bactoprenol glucosyl transferase  40.45 
 
 		 312 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1485  polyprenyl-phosphate beta-D-glucosyltransferase  37.58 
 
 		 324 aa  219  3.9999999999999997e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.376864  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2047  glycosyl transferase family protein  37.65 
 
 		 359 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0225457  normal  0.0522256 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0600  glycosyl transferase family 2  42.76 
 
 		 337 aa  218  8.999999999999998e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.755696 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0692  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.25 
 
 		 324 aa  218  1e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.58802  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3431  glycosyl transferase family protein  38.05 
 
 		 358 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.411933  normal  0.446131 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3938  ribonuclease III  38.05 
 
 		 358 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.243257 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2872  glycosyl transferase family 2  34.92 
 
 		 336 aa  218  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5528  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.71 
 
 		 323 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5287  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.71 
 
 		 323 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5112  glycosyltransferase, group 2 family protein  35.71 
 
 		 323 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2759  glycosyl transferase family protein  37.06 
 
 		 362 aa  217  2.9999999999999998e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4133  glycosyl transferase family 2  33.44 
 
 		 310 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000533827 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5684  group 2 family glycosyl transferase  35.71 
 
 		 323 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3225  glycosyl transferase family protein  37.91 
 
 		 312 aa  216  2.9999999999999998e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.163276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0350  glycosyl transferase family protein  35.69 
 
 		 333 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.319839  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4342  glycosyl transferase family protein  36.7 
 
 		 365 aa  216  5e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.106417  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4024  glycosyl transferase family protein  36.7 
 
 		 365 aa  216  5e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0272264  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5129  glycosyltransferase, group 2 family protein  35.71 
 
 		 323 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>