11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_4090 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_4090  hypothetical protein  100 
 
 		 193 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4240  hypothetical protein  76.88 
 
 		 199 aa  286  1e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.354915 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4918  hypothetical protein  65.26 
 
 		 194 aa  225  3e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596261  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0661  hypothetical protein  47.45 
 
 		 198 aa  177  8e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1340  hypothetical protein  48.97 
 
 		 203 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.431234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0568  hypothetical protein  49.24 
 
 		 198 aa  169  2e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00869432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1200  hypothetical protein  53 
 
 		 197 aa  160  7e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3614  hypothetical protein  34.93 
 
 		 202 aa  94  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0507032 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3421  hypothetical protein  32.19 
 
 		 195 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00392236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3730  hypothetical protein  31.51 
 
 		 195 aa  81.3  0.000000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.342678 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5802  hypothetical protein  34.06 
 
 		 194 aa  78.2  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.749179  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>