108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2960 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2960  hypothetical protein  100 
 
 		 136 aa  259  6.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.352558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3465  hypothetical protein  81.54 
 
 		 273 aa  193  6e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.193178  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2319  hypothetical protein  76.56 
 
 		 282 aa  176  9e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.374311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3839  hypothetical protein  67.97 
 
 		 287 aa  152  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.562242 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1600  hypothetical protein  69.53 
 
 		 292 aa  147  4e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.3941  normal  0.277358 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2121  hypothetical protein  66.93 
 
 		 273 aa  126  8.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2327  hypothetical protein  53.54 
 
 		 233 aa  113  6.9999999999999995e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.844452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1098  integral membrane protein TerC  40.15 
 
 		 224 aa  104  5e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2845  Integral membrane protein TerC  43.31 
 
 		 198 aa  104  5e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.100755 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1110  hypothetical protein  39.39 
 
 		 224 aa  103  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1086  membrane protein  38.64 
 
 		 224 aa  102  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1201  hypothetical protein  39.39 
 
 		 224 aa  103  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0242206  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0905  integral membrane protein TerC  39.39 
 
 		 224 aa  102  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6290  Integral membrane protein TerC  46.03 
 
 		 231 aa  102  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.06689  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1310  hypothetical protein  39.39 
 
 		 224 aa  102  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.869179  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1092  membrane protein  38.64 
 
 		 224 aa  102  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4045  integral membrane protein TerC  41.22 
 
 		 227 aa  102  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2326  integral membrane protein TerC  45.67 
 
 		 246 aa  102  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1243  hypothetical protein  39.39 
 
 		 224 aa  102  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1271  hypothetical protein  38.64 
 
 		 224 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3390  Integral membrane protein TerC  41.22 
 
 		 227 aa  102  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.114305  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1348  hypothetical protein  39.39 
 
 		 224 aa  102  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0643228  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4682  integral membrane protein TerC  43.85 
 
 		 228 aa  101  4e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4099  hypothetical protein  38.64 
 
 		 224 aa  100  7e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3362  integral membrane protein TerC  49.61 
 
 		 233 aa  97.8  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3951  integral membrane protein TerC  44.83 
 
 		 233 aa  97.8  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0480576 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0194  integral membrane protein TerC  40.91 
 
 		 247 aa  97.8  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0764  Integral membrane protein TerC  38.06 
 
 		 223 aa  94  6e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0070  hypothetical protein  38.64 
 
 		 234 aa  93.6  9e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.693932  normal  0.419682 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49290  hypothetical protein  44.64 
 
 		 244 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.608351  normal  0.0100371 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0867  integral membrane protein TerC  44.09 
 
 		 230 aa  93.2  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1619  Integral membrane protein TerC  38.64 
 
 		 219 aa  92  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3943  integral membrane protein TerC  38.64 
 
 		 232 aa  91.3  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.209057  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5190  Integral membrane protein TerC  45.31 
 
 		 228 aa  90.9  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4210  hypothetical protein  43.75 
 
 		 243 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2473  integral membrane protein TerC  44.09 
 
 		 243 aa  90.5  7e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0277  TerC family integral membrane protein  41.09 
 
 		 237 aa  89.4  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0978  TerC family integral membrane protein  41.09 
 
 		 270 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2694  integral membrane protein TerC  44.19 
 
 		 251 aa  90.1  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399731  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2677  TerC family integral membrane protein  41.09 
 
 		 237 aa  89.4  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.849406  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2399  TerC family integral membrane protein  41.09 
 
 		 237 aa  89.4  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.363415  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0815  TerC family integral membrane protein  41.09 
 
 		 237 aa  89.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0819  TerC family integral membrane protein  41.09 
 
 		 270 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0012  TerC family integral membrane protein  41.09 
 
 		 237 aa  89.4  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0857  integral membrane protein TerC  39.84 
 
 		 246 aa  89.7  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121563 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2568  integral membrane protein TerC  44.19 
 
 		 234 aa  89.7  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.831919  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0388  Integral membrane protein TerC  37.8 
 
 		 228 aa  89.7  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.10914  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0648  TerC family integral membrane protein  40.31 
 
 		 237 aa  87.8  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5173  Integral membrane protein TerC  40.91 
 
 		 249 aa  87.4  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1266  Integral membrane protein TerC  39.06 
 
 		 228 aa  85.5  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5974  integral membrane protein TerC  44.7 
 
 		 234 aa  84.3  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0621231 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4680  integral membrane protein TerC  40.16 
 
 		 233 aa  84  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1816  integral membrane protein TerC  39.39 
 
 		 242 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.34813  normal  0.112253 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1209  Integral membrane protein TerC  38.58 
 
 		 249 aa  83.6  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0445  integral membrane protein TerC  39.39 
 
 		 237 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.620391 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3380  Integral membrane protein TerC  39.84 
 
 		 243 aa  82  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0655  integral membrane protein TerC  44.7 
 
 		 234 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.315184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2036  integral membrane protein TerC  43.94 
 
 		 234 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2647  integral membrane protein TerC  43.94 
 
 		 234 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4030  integral membrane protein TerC  39.84 
 
 		 243 aa  80.9  0.000000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.958437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2676  integral membrane protein TerC  43.94 
 
 		 234 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0926  putative transmembrane protein  40 
 
 		 233 aa  80.5  0.000000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00232112  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3290  Integral membrane protein TerC  37.88 
 
 		 234 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0586627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4673  integral membrane protein TerC  39.06 
 
 		 250 aa  79  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0676  hypothetical protein  38.64 
 
 		 234 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.471158 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1401  Integral membrane protein TerC  43.31 
 
 		 230 aa  77.4  0.00000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0532  integral membrane protein TerC  38.64 
 
 		 231 aa  77  0.00000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.256747  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0471  integral membrane protein TerC  36.36 
 
 		 231 aa  75.5  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0476  Integral membrane protein TerC  37.12 
 
 		 231 aa  73.6  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0891  Integral membrane protein TerC  38.58 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.927999 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0820  Integral membrane protein TerC  39.37 
 
 		 230 aa  72  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3292  Integral membrane protein TerC  36.97 
 
 		 229 aa  71.2  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000553264  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0460  Integral membrane protein TerC  36.36 
 
 		 231 aa  70.5  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.356096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1829  integral membrane protein TerC  38.05 
 
 		 236 aa  68.9  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.106378  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1545  Integral membrane protein TerC  38.94 
 
 		 234 aa  68.6  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.654667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0916  integral membrane protein TerC  35.35 
 
 		 237 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.968219  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1506  integral membrane protein TerC  41.41 
 
 		 249 aa  67.4  0.00000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.110283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3371  Integral membrane protein TerC  35.29 
 
 		 233 aa  66.2  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000908977  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3386  hypothetical protein  33.09 
 
 		 346 aa  65.1  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.501698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3022  integral membrane protein TerC  35.11 
 
 		 233 aa  64.7  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3512  integral membrane protein TerC  34.65 
 
 		 251 aa  64.7  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0508752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0428  integral membrane protein TerC  38.58 
 
 		 225 aa  64.3  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000236492  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2986  hypothetical protein  34.65 
 
 		 223 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000888326  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2687  integral membrane protein  35.43 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  8.99686e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2567  integral membrane protein TerC  34.34 
 
 		 232 aa  62.4  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0398811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0805  integral membrane protein TerC  32.28 
 
 		 258 aa  62.8  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0662924  normal  0.60376 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3917  integral membrane protein TerC  35.43 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0557397  hitchhiker  0.00349463 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2290  hypothetical protein  34.65 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000535786  hitchhiker  1.74959e-24 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2736  hypothetical protein  34.65 
 
 		 223 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00167476  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2665  integral membrane protein  34.65 
 
 		 223 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.173454  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2946  hypothetical protein  34.65 
 
 		 223 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000002611  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2992  hypothetical protein  34.65 
 
 		 224 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000237739  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2945  hypothetical protein  34.65 
 
 		 223 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.89951e-53 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2950  hypothetical protein  33.86 
 
 		 224 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000304584  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4044  integral membrane protein TerC  35.43 
 
 		 239 aa  58.5  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4666  integral membrane protein TerC  35.35 
 
 		 245 aa  57.4  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.918315 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3864  integral membrane protein TerC  35.35 
 
 		 245 aa  57  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.170759  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0949  hypothetical protein  37.5 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0295104 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0556  hypothetical protein  37.72 
 
 		 232 aa  48.9  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0569  Integral membrane protein TerC  36.07 
 
 		 221 aa  48.9  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>