194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2059 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007958  RPD_2059  diacylglycerol kinase  100 
 
 
120 aa  233  6e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.283342 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3382  diacylglycerol kinase  85.47 
 
 
117 aa  181  3e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00149641  normal  0.0769936 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2198  diacylglycerol kinase  84.62 
 
 
117 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3494  diacylglycerol kinase  75.86 
 
 
117 aa  152  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.769643 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2081  diacylglycerol kinase  87.07 
 
 
117 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.363199 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1484  diacylglycerol kinase  72.65 
 
 
117 aa  121  4e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.208624  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02047  Diacylglycerol kinase  50.48 
 
 
117 aa  98.2  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0216471  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0531  diacylglycerol kinase  44.14 
 
 
128 aa  94  7e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000113671  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2512  diacylglycerol kinase  48.08 
 
 
123 aa  89.4  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.361912  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0628  diacylglycerol kinase  44.95 
 
 
115 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.440789 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1586  diacylglycerol kinase  44.44 
 
 
123 aa  88.2  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.117839  normal  0.376831 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2308  diacylglycerol kinase  40.87 
 
 
126 aa  85.1  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00356562  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1747  diacylglycerol kinase  42.86 
 
 
123 aa  84  7e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2929  diacylglycerol kinase  41.74 
 
 
123 aa  83.2  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.479907  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2640  diacylglycerol kinase  42.15 
 
 
123 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.185704  normal  0.0499107 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1587  diacylglycerol kinase  41.67 
 
 
134 aa  83.2  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.882311  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00663  diacylglycerol kinase  47.27 
 
 
134 aa  82  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2402  diacylglycerol kinase  43.52 
 
 
123 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.802663  normal  0.923325 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1989  diacylglycerol kinase  41.44 
 
 
123 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00452736 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2203  diacylglycerol kinase  43.27 
 
 
134 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1483  diacylglycerol kinase  40.35 
 
 
123 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0058197  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001810  diacylglycerol kinase  49.56 
 
 
135 aa  79  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1885  diacylglycerol kinase  42.2 
 
 
170 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00308001  normal  0.576975 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2192  diacylglycerol kinase  42.59 
 
 
123 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0610811  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2269  diacylglycerol kinase  42.59 
 
 
123 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4461  diacylglycerol kinase  42.45 
 
 
122 aa  79  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1851  diacylglycerol kinase  42.2 
 
 
123 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000916296  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1837  diacylglycerol kinase  42.2 
 
 
123 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000673614  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2029  diacylglycerol kinase  41.59 
 
 
175 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0748724  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2262  diacylglycerol kinase  41.35 
 
 
130 aa  77  0.00000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1996  diacylglycerol kinase  40.95 
 
 
123 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00102792  normal  0.342733 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03914  diacylglycerol kinase  40.71 
 
 
122 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.299817  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3951  diacylglycerol kinase  40.71 
 
 
122 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03874  hypothetical protein  40.71 
 
 
122 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.223434  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5523  diacylglycerol kinase  40.71 
 
 
122 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.351191  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4504  diacylglycerol kinase  40.71 
 
 
122 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3986  diacylglycerol kinase  40.71 
 
 
122 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.345004 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4595  diacylglycerol kinase  40.71 
 
 
122 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4282  diacylglycerol kinase  40.71 
 
 
122 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2363  diacylglycerol kinase  43.36 
 
 
135 aa  74.3  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0020  diacylglycerol kinase  47 
 
 
127 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4555  diacylglycerol kinase  40.71 
 
 
122 aa  74.3  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0513  diacylglycerol kinase  42.31 
 
 
121 aa  73.6  0.0000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0048  diacylglycerol kinase  39.82 
 
 
120 aa  73.2  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0732  diacylglycerol kinase  42.31 
 
 
121 aa  73.2  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.241329  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05290  diacylglycerol kinase  40.38 
 
 
118 aa  71.2  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0193  diacylglycerol kinase  38.14 
 
 
118 aa  70.5  0.000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0939  diacylglycerol kinase  38.79 
 
 
161 aa  70.5  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.793375  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17675  diacylglycerol kinase  40.57 
 
 
123 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0653  diacylglycerol kinase  41.9 
 
 
118 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.815774  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1317  diacylglycerol kinase  37.5 
 
 
119 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1538  diacylglycerol kinase  40.57 
 
 
123 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0788  diacylglycerol kinase  38.68 
 
 
122 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000267959 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0903  diacylglycerol kinase  44.44 
 
 
144 aa  69.3  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1712  diacylglycerol kinase  42.74 
 
 
137 aa  68.6  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.554217  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3117  diacylglycerol kinase  41.38 
 
 
161 aa  67.8  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00354589  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3399  diacylglycerol kinase  41.9 
 
 
121 aa  68.2  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0472  diacylglycerol kinase  40.18 
 
 
124 aa  67.8  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.888904  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19800  Prokaryotic diacylglycerol kinase  40.38 
 
 
127 aa  67.8  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1636  diacylglycerol kinase  37.74 
 
 
121 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1238  diacylglycerol kinase  37.74 
 
 
121 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000273829 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4023  diacylglycerol kinase  37.74 
 
 
120 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000116505 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4081  diacylglycerol kinase  37.74 
 
 
121 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4630  diacylglycerol kinase  39.6 
 
 
122 aa  67  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.312152 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1183  diacylglycerol kinase  36.79 
 
 
120 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.182376 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1038  diacylglycerol kinase  43.36 
 
 
181 aa  67  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.228272  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1106  diacylglycerol kinase  43.36 
 
 
156 aa  67  0.00000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4493  diacylglycerol kinase  39.6 
 
 
122 aa  67  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0760  diacylglycerol kinase  43.36 
 
 
156 aa  67  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0389  diacylglycerol kinase  43.36 
 
 
156 aa  67  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4579  diacylglycerol kinase  39.6 
 
 
122 aa  67  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.795309  normal  0.304118 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4578  diacylglycerol kinase  39.6 
 
 
122 aa  67  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4428  diacylglycerol kinase  39.6 
 
 
122 aa  67  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000195927 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1856  diacylglycerol kinase  43.36 
 
 
181 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1411  diacylglycerol kinase  43.36 
 
 
181 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.078925  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2312  diacylglycerol kinase  42.24 
 
 
148 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2290  diacylglycerol kinase  36.52 
 
 
123 aa  66.6  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.213941  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1266  diacylglycerol kinase  43.36 
 
 
181 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1273  diacylglycerol kinase  43.36 
 
 
181 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.924748  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1163  diacylglycerol kinase  31.25 
 
 
116 aa  65.1  0.0000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0347313  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1725  diacylglycerol kinase  46.15 
 
 
119 aa  65.1  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3525  diacylglycerol kinase  38.46 
 
 
121 aa  65.1  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04654  diacylglycerol kinase  38.39 
 
 
126 aa  65.1  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0592128  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2898  diacylglycerol kinase  38.53 
 
 
126 aa  65.1  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0284047 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1506  diacylglycerol kinase  41.07 
 
 
126 aa  64.7  0.0000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.72408  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00377  putative diacylglycerol kinase (DAGK)  39.13 
 
 
136 aa  63.9  0.0000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0318  diacylglycerol kinase  28.45 
 
 
119 aa  63.9  0.0000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1451  diacylglycerol kinase  41.07 
 
 
126 aa  63.9  0.0000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1321  diacylglycerol kinase  44.25 
 
 
212 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.799291  normal  0.273824 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3238  diacylglycerol kinase  43.36 
 
 
176 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2085  diacylglycerol kinase transmembrane protein  41.28 
 
 
153 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.717533  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1006  diacylglycerol kinase  43.36 
 
 
178 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.222987  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1913  diacylglycerol kinase  41.28 
 
 
154 aa  62.8  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2480  diacylglycerol kinase  41.67 
 
 
128 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.927922  normal  0.381808 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2704  diacylglycerol kinase  37.93 
 
 
140 aa  63.2  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2236  diacylglycerol kinase  41.28 
 
 
154 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.320783 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5599  diacylglycerol kinase  42.98 
 
 
178 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.78403 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0801  diacylglycerol kinase  35.19 
 
 
124 aa  62  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2310  diacylglycerol kinase  42.98 
 
 
178 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.194592  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2188  diacylglycerol kinase  42.98 
 
 
178 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195128  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>