12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1939 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1939  hypothetical protein  100 
 
 		 302 aa  590  1e-168  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0577581  normal  0.305533 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3520  hypothetical protein  64.56 
 
 		 313 aa  320  3e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.936766  normal  0.749977 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2056  hypothetical protein  53.27 
 
 		 292 aa  256  4e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2628  hypothetical protein  41.74 
 
 		 305 aa  202  8e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.460391  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1773  hypothetical protein  41.81 
 
 		 334 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.185989  decreased coverage  0.00548408 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3041  hypothetical protein  39.8 
 
 		 321 aa  139  4.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2228  hypothetical protein  36.47 
 
 		 274 aa  138  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00178512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3320  hypothetical protein  67.44 
 
 		 263 aa  70.9  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1675  hypothetical protein  24.4 
 
 		 333 aa  45.4  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.243785 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5904  hypothetical protein  42.86 
 
 		 287 aa  44.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.188041  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5306  hypothetical protein  38.89 
 
 		 268 aa  43.5  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0325155 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1645  hypothetical protein  34.72 
 
 		 393 aa  43.5  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.46786 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>