9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1712 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1712  hypothetical protein  100 
 
 		 235 aa  462  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4395  NHL repeat containing protein  55.45 
 
 		 236 aa  221  7e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.332855  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1535  hypothetical protein  53.3 
 
 		 242 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0321654  normal  0.49585 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0747  hypothetical protein  38.27 
 
 		 1241 aa  52.8  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0450  protease  33.98 
 
 		 1207 aa  46.2  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.470359 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0459  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.21 
 
 		 1193 aa  44.3  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.245222  normal  0.621321 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2290  YD repeat protein  32.34 
 
 		 6272 aa  43.5  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0593  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  38.17 
 
 		 1383 aa  42.7  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0312409 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1001  C-type lectin domain-containing protein  32.5 
 
 		 3325 aa  41.6  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>