More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0670 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0670  hypothetical protein  100 
 
 		 329 aa  676    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.809049 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4856  hypothetical protein  34.19 
 
 		 325 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.876948  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0836  hypothetical protein  34.01 
 
 		 340 aa  170  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00999725  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1399  hypothetical protein  32.02 
 
 		 339 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0476  hypothetical protein  36.1 
 
 		 330 aa  159  7e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.211749 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0467  hypothetical protein  36.1 
 
 		 345 aa  159  7e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0242  hypothetical protein  32.28 
 
 		 325 aa  159  9e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3899  hypothetical protein  33.95 
 
 		 341 aa  158  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129071  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3124  hypothetical protein  31.43 
 
 		 340 aa  157  3e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.65371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3913  extra-cytoplasmic solute receptor  32.48 
 
 		 332 aa  157  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.107287  normal  0.463561 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  32.86 
 
 		 318 aa  156  5.0000000000000005e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  33.44 
 
 		 327 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4408  extra-cytoplasmic solute receptor  30.74 
 
 		 322 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0323746  normal  0.31096 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3550  hypothetical protein  33.56 
 
 		 326 aa  152  7e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.615423  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  32.99 
 
 		 343 aa  152  7e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4142  hypothetical protein  33.1 
 
 		 328 aa  152  8e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.627286  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0102  hypothetical protein  34.52 
 
 		 328 aa  152  8.999999999999999e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.337169 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1376  hypothetical protein  31.73 
 
 		 340 aa  151  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.537354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2535  hypothetical protein  32.31 
 
 		 324 aa  151  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.188346  normal  0.11919 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4163  hypothetical protein  31.14 
 
 		 322 aa  151  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0521612  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5492  hypothetical protein  34.01 
 
 		 329 aa  151  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0119  hypothetical protein  34.16 
 
 		 328 aa  150  3e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1722  hypothetical protein  33.1 
 
 		 338 aa  149  6e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.322135 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4309  hypothetical protein  30.56 
 
 		 336 aa  149  9e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.28876 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1676  hypothetical protein  32.07 
 
 		 327 aa  149  9e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.372386  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3657  hypothetical protein  32.48 
 
 		 322 aa  147  3e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111701  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6179  hypothetical protein  32.4 
 
 		 323 aa  147  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  33.46 
 
 		 338 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5132  hypothetical protein  34.62 
 
 		 334 aa  146  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  31.89 
 
 		 338 aa  146  4.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0638  twin-arginine translocation pathway signal  31.94 
 
 		 330 aa  146  5e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0118  hypothetical protein  31.75 
 
 		 339 aa  145  6e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0101  hypothetical protein  31.75 
 
 		 339 aa  146  6e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.344081 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3986  hypothetical protein  35.89 
 
 		 325 aa  146  6e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3910  hypothetical protein  32.97 
 
 		 332 aa  145  7.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.032337  normal  0.0571508 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  30.9 
 
 		 322 aa  145  8.000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4638  hypothetical protein  34.49 
 
 		 326 aa  145  9e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  32.19 
 
 		 332 aa  144  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2466  hypothetical protein  31 
 
 		 321 aa  145  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3894  hypothetical protein  32.19 
 
 		 327 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0367386  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3703  hypothetical protein  34.48 
 
 		 333 aa  144  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03750  extra-cytoplasmic solute receptor, Bug family  34.39 
 
 		 334 aa  144  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.549978  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  33.73 
 
 		 337 aa  144  3e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3789  extra-cytoplasmic solute receptor  31.25 
 
 		 326 aa  143  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  35.42 
 
 		 321 aa  143  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5777  hypothetical protein  35.2 
 
 		 334 aa  142  7e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1829  hypothetical protein  31.68 
 
 		 327 aa  142  9e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1767  hypothetical protein  35.06 
 
 		 304 aa  142  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  33.46 
 
 		 334 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  33.94 
 
 		 328 aa  141  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1686  hypothetical protein  35.66 
 
 		 331 aa  141  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.893749  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4626  hypothetical protein  31.75 
 
 		 318 aa  140  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.539192  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  31.94 
 
 		 318 aa  141  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  33.57 
 
 		 314 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  32.67 
 
 		 345 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  32.67 
 
 		 345 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3917  extra-cytoplasmic solute receptor  33.7 
 
 		 328 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2828  hypothetical protein  30.19 
 
 		 328 aa  140  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.384643  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  29.25 
 
 		 331 aa  140  3e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5443  hypothetical protein  32.18 
 
 		 337 aa  140  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0252  hypothetical protein  31.38 
 
 		 325 aa  140  3.9999999999999997e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  29.25 
 
 		 331 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4316  hypothetical protein  30.38 
 
 		 341 aa  140  3.9999999999999997e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.414867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1696  hypothetical protein  30.82 
 
 		 327 aa  139  3.9999999999999997e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0688  hypothetical protein  30.64 
 
 		 326 aa  139  4.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.502545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1625  hypothetical protein  31.79 
 
 		 325 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.354122  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  30.06 
 
 		 327 aa  139  4.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  32.32 
 
 		 339 aa  139  6e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4614  hypothetical protein  31.78 
 
 		 322 aa  139  6e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25356  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2249  hypothetical protein  31.79 
 
 		 325 aa  139  6e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.570594 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0309  twin-arginine translocation pathway signal  31.41 
 
 		 328 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2476  hypothetical protein  31.54 
 
 		 321 aa  138  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0303847  normal  0.0316178 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  33.45 
 
 		 351 aa  138  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3721  extra-cytoplasmic solute receptor  31.33 
 
 		 345 aa  138  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.31096 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0710  hypothetical protein  32.09 
 
 		 328 aa  137  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4289  hypothetical protein  32.28 
 
 		 322 aa  137  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  35.04 
 
 		 322 aa  137  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  31.4 
 
 		 330 aa  137  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3993  hypothetical protein  32.84 
 
 		 322 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288603 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  33.68 
 
 		 335 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  33.33 
 
 		 353 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4631  hypothetical protein  31.35 
 
 		 325 aa  137  3.0000000000000003e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4503  extra-cytoplasmic solute receptor  34.96 
 
 		 366 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.4554  normal  0.0615049 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  33.21 
 
 		 355 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4543  hypothetical protein  32.86 
 
 		 323 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00792277  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  29.1 
 
 		 332 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3678  hypothetical protein  29.41 
 
 		 327 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3470  hypothetical protein  32.11 
 
 		 330 aa  136  4e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  29.66 
 
 		 327 aa  136  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0105  hypothetical protein  28.77 
 
 		 330 aa  136  6.0000000000000005e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5203  hypothetical protein  32.39 
 
 		 332 aa  135  7.000000000000001e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3086  hypothetical protein  31.75 
 
 		 332 aa  135  7.000000000000001e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  30.07 
 
 		 335 aa  135  8e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3566  hypothetical protein  34.4 
 
 		 330 aa  135  9e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00357296  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2030  hypothetical protein  30.43 
 
 		 332 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.608213  normal  0.556518 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4931  extra-cytoplasmic solute receptor  30.14 
 
 		 330 aa  135  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1098  hypothetical protein  29.33 
 
 		 339 aa  135  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2142  hypothetical protein  35.71 
 
 		 332 aa  134  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.980907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0038  hypothetical protein  29.55 
 
 		 332 aa  135  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.914226 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0350  hypothetical protein  30.68 
 
 		 336 aa  135  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>