98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4633 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4633  hypothetical protein  100 
 
 		 134 aa  251  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.339978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0761  hypothetical protein  88.81 
 
 		 134 aa  229  9e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0842  hypothetical protein  87.88 
 
 		 141 aa  227  5e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7688  hypothetical protein  78.29 
 
 		 129 aa  197  5e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.132054 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4652  hypothetical protein  90.3 
 
 		 134 aa  196  7e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1392  hypothetical protein  58.06 
 
 		 152 aa  148  2e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.526699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1838  protein of unknown function DUF307  57.81 
 
 		 154 aa  144  3e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.554714  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1374  hypothetical protein  53.08 
 
 		 150 aa  143  7.0000000000000006e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.422006  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1504  hypothetical protein  58.78 
 
 		 134 aa  143  8.000000000000001e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.815589 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5323  hypothetical protein  52.8 
 
 		 151 aa  139  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1881  hypothetical protein  54.55 
 
 		 135 aa  136  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2330  hypothetical protein  55.3 
 
 		 135 aa  135  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2147  hypothetical protein  54.55 
 
 		 135 aa  135  2e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2641  hypothetical protein  53.79 
 
 		 135 aa  135  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1744  hypothetical protein  53.79 
 
 		 135 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.810312  hitchhiker  0.00220396 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2716  hypothetical protein  53.79 
 
 		 135 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1977  hypothetical protein  55.3 
 
 		 135 aa  134  4e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05283  hypothetical protein  52.38 
 
 		 143 aa  133  7.000000000000001e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2470  hypothetical protein  54.55 
 
 		 135 aa  133  8e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.503038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2352  hypothetical protein  54.55 
 
 		 135 aa  133  8e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.363648  normal  0.153225 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2280  hypothetical protein  53.79 
 
 		 135 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000585  hypothetical protein  50 
 
 		 143 aa  130  5e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.87989  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1940  hypothetical protein  51.52 
 
 		 135 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00153231  normal  0.0153994 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1575  hypothetical protein  52.63 
 
 		 135 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00720647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0191  hypothetical protein  52.42 
 
 		 143 aa  127  4.0000000000000003e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2681  hypothetical protein  50 
 
 		 135 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.95193  normal  0.733231 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2148  hypothetical protein  51.91 
 
 		 135 aa  126  9.000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.508072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2322  hypothetical protein  50 
 
 		 137 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.389876  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3487  hypothetical protein  53.17 
 
 		 133 aa  123  8.000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0476  protein of unknown function DUF307  51.16 
 
 		 124 aa  117  4.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.984983  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3753  hypothetical protein  48.44 
 
 		 133 aa  117  6e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2602  hypothetical protein  54.46 
 
 		 112 aa  115  3e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3373  hypothetical protein  50 
 
 		 133 aa  114  5e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8707  protein of unknown function DUF307  46.92 
 
 		 133 aa  113  8.999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.184827  normal  0.116207 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10870  predicted membrane protein  47.62 
 
 		 130 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2804  protein of unknown function DUF307  47.01 
 
 		 135 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.219169  normal  0.220669 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5046  hypothetical protein  47.66 
 
 		 136 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1882  hypothetical protein  46.21 
 
 		 135 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.792517  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2377  protein of unknown function DUF307  45.31 
 
 		 123 aa  107  4.0000000000000004e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0376  hypothetical protein  43.85 
 
 		 134 aa  107  6e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.599891 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0764  protein of unknown function DUF307  48.41 
 
 		 123 aa  107  6e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4476  hypothetical protein  44.62 
 
 		 134 aa  105  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.503682  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1698  protein of unknown function DUF307  46.09 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.888972  hitchhiker  0.00956065 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4563  hypothetical protein  44.62 
 
 		 134 aa  105  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.034177 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4859  hypothetical protein  44.62 
 
 		 134 aa  105  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.364473  normal  0.0937936 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6693  protein of unknown function DUF307  45.31 
 
 		 132 aa  105  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.175061 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34090  predicted membrane protein  42.19 
 
 		 123 aa  103  7e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.237199  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2545  hypothetical protein  43.08 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0262048  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0104  protein of unknown function DUF307  46.88 
 
 		 131 aa  102  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0766582  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10887  hypothetical protein  45.74 
 
 		 129 aa  102  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.51401e-20  normal  0.214665 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4171  protein of unknown function DUF307  44.96 
 
 		 133 aa  102  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.974051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1758  hypothetical protein  41.04 
 
 		 153 aa  101  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0330869  hitchhiker  0.000134673 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6422  hypothetical protein  41.09 
 
 		 136 aa  101  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.174241  normal  0.798196 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1934  protein of unknown function DUF307  44.09 
 
 		 129 aa  100  5e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00173836  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4052  protein of unknown function DUF307  44.96 
 
 		 135 aa  100  6e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.502353  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06560  predicted membrane protein  43.61 
 
 		 139 aa  100  7e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.289345  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1180  protein of unknown function DUF307  45.24 
 
 		 132 aa  99.8  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00716366  normal  0.222129 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2693  hypothetical protein  39.53 
 
 		 148 aa  98.2  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2854  hypothetical protein  42.64 
 
 		 148 aa  98.2  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0738745  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0514  protein of unknown function DUF307  42.86 
 
 		 140 aa  97.4  5e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00567512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0205  hypothetical protein  40.6 
 
 		 135 aa  97.4  6e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0233  hypothetical protein  41.22 
 
 		 126 aa  96.3  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1213  hypothetical protein  39.23 
 
 		 148 aa  95.9  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0042632  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1183  hypothetical protein  42.31 
 
 		 148 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1149  hypothetical protein  42.31 
 
 		 148 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1032  hypothetical protein  42.31 
 
 		 148 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00321525  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1137  hypothetical protein  42.31 
 
 		 147 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.460412  normal  0.971647 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1115  hypothetical protein  42.31 
 
 		 148 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.270927  hitchhiker  0.00000000396693 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1822  hypothetical protein  38.93 
 
 		 124 aa  94.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204433  normal  0.65949 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0457  hypothetical protein  44.72 
 
 		 120 aa  94.7  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000974641  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0680  hypothetical protein  43.75 
 
 		 120 aa  94  6e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.945663  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3318  protein of unknown function DUF307  40.77 
 
 		 123 aa  94  7e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0680  hypothetical protein  43.75 
 
 		 120 aa  93.6  9e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2158  hypothetical protein  41.54 
 
 		 148 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000573014  normal  0.508781 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00972  hypothetical protein  41.54 
 
 		 148 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.026608  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2682  protein of unknown function DUF307  41.54 
 
 		 148 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180766  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1070  hypothetical protein  41.54 
 
 		 148 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000025348  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2635  hypothetical protein  41.54 
 
 		 148 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0212303  hitchhiker  0.000000348703 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00965  conserved inner membrane protein  41.54 
 
 		 148 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0139378  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2354  hypothetical protein  41.54 
 
 		 148 aa  93.2  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.167767  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1076  hypothetical protein  41.54 
 
 		 148 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159156  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1473  hypothetical protein  39.52 
 
 		 148 aa  91.3  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0316981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1125  hypothetical protein  41.54 
 
 		 148 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00381989  normal  0.352143 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1121  hypothetical protein  40.48 
 
 		 122 aa  90.1  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1150  hypothetical protein  40.48 
 
 		 122 aa  90.1  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.452098  normal  0.540601 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0661  hypothetical protein  43.09 
 
 		 121 aa  89.4  2e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.11429  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3203  hypothetical protein  37.5 
 
 		 144 aa  88.6  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00131337  normal  0.0664467 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2626  hypothetical protein  37.21 
 
 		 148 aa  88.2  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.421081  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0662  protein of unknown function DUF307  35.88 
 
 		 135 aa  88.2  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2537  hypothetical protein  37.21 
 
 		 148 aa  88.2  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000184645  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1706  hypothetical protein  45.31 
 
 		 135 aa  87.8  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0922  hypothetical protein  36.64 
 
 		 129 aa  84.7  3e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6516  protein of unknown function DUF307  41.13 
 
 		 122 aa  83.2  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2694  protein of unknown function DUF307  36.72 
 
 		 121 aa  82.8  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2585  hypothetical protein  41.41 
 
 		 120 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000439063  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0967  protein of unknown function DUF307  38.89 
 
 		 122 aa  79.3  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0401  protein of unknown function DUF307  47.47 
 
 		 125 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0102397  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1525  protein of unknown function DUF307  34.59 
 
 		 146 aa  77.8  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>