243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4583 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4583  CBS  100 
 
 		 419 aa  837    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2396  CBS domain-containing protein  26.51 
 
 		 425 aa  140  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1436  MgtE intracellular region  25.96 
 
 		 425 aa  132  7.999999999999999e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00000684076  decreased coverage  0.0000760195 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0092  MgtE intracellular region  25.82 
 
 		 425 aa  125  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0286357 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1642  magnesium transporter  29.22 
 
 		 462 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1669  magnesium transporter  29.22 
 
 		 462 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1471  magnesium transporter  27.23 
 
 		 449 aa  89  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2291  magnesium transporter  27.73 
 
 		 449 aa  86.3  8e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2831  magnesium transporter  26.96 
 
 		 458 aa  85.1  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2600  magnesium transporter  26.94 
 
 		 463 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1323  CBS domain-containing protein  23.38 
 
 		 423 aa  84.3  0.000000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000111673  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0267  magnesium transporter  26.03 
 
 		 456 aa  84.3  0.000000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000106938  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3016  magnesium transporter  25.81 
 
 		 443 aa  83.6  0.000000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000242012  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1530  CBS domain-containing protein  23.08 
 
 		 423 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000568419  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0824  magnesium transporter  29.17 
 
 		 454 aa  82.8  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18191  Mg2+ transporter  24.69 
 
 		 469 aa  80.1  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0656  MgtE intracellular region  22.17 
 
 		 417 aa  80.1  0.00000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000076098  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0481  magnesium transporter  30.18 
 
 		 450 aa  79.3  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000026878  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1172  divalent cation transporter  25.89 
 
 		 450 aa  78.6  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000987618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0138  divalent cation transporter  29.17 
 
 		 486 aa  78.2  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17571  Mg2+ transporter  28.24 
 
 		 471 aa  78.2  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.161452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4217  magnesium transporter  29.3 
 
 		 452 aa  77.8  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1588  response regulator receiver protein  23.77 
 
 		 446 aa  77.4  0.0000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01631  Mg2+ transporter  27.44 
 
 		 473 aa  77.8  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0092  magnesium transporter  27.44 
 
 		 486 aa  77.4  0.0000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1723  Mg2+ transporter  24.28 
 
 		 468 aa  77.4  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.20289  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0076  MgtE intracellular region  21.33 
 
 		 459 aa  77  0.0000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.740588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18401  Mg2+ transporter  24.28 
 
 		 468 aa  77.4  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.297681  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1654  response regulator receiver protein  24.18 
 
 		 446 aa  77  0.0000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.399924  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1939  magnesium transporter  23.29 
 
 		 444 aa  76.3  0.0000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0382273  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0714  magnesium transporter  27.73 
 
 		 449 aa  75.9  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1208  Mg2+ transporter  28.24 
 
 		 469 aa  74.3  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20831  Mg2+ transporter  28.24 
 
 		 469 aa  74.3  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1689  magnesium transporter  24.49 
 
 		 449 aa  73.9  0.000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1738  MgtE intracellular region  25.65 
 
 		 430 aa  73.2  0.000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18221  Mg2+ transporter  23.46 
 
 		 468 aa  73.2  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2656  Mg/Co/Ni transporter MgtE  29.36 
 
 		 412 aa  72.8  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2430  divalent cation transporter  25.09 
 
 		 466 aa  72  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0143004 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2089  magnesium transporter  23.01 
 
 		 460 aa  71.6  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1523  magnesium transporter  24.77 
 
 		 447 aa  71.2  0.00000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2338  MgtE intracellular region  24.53 
 
 		 421 aa  70.9  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2168  magnesium transporter  26.82 
 
 		 453 aa  70.5  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.571792  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1269  magnesium transporter  27.52 
 
 		 465 aa  70.5  0.00000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0779643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3240  MgtE intracellular region  20.88 
 
 		 433 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0412  magnesium transporter  32.77 
 
 		 461 aa  69.3  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2718  magnesium transporter  22.83 
 
 		 452 aa  68.6  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1890  magnesium transporter  22.59 
 
 		 460 aa  68.2  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0471  magnesium transporter  26.51 
 
 		 482 aa  68.9  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.963916 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25770  Mg2+ transporter MgtE  27.65 
 
 		 462 aa  68.2  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1158  MgtE intracellular region  23.28 
 
 		 420 aa  68.2  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3316  magnesium transporter  24.41 
 
 		 473 aa  67.4  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.685446  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2352  magnesium transporter  23.85 
 
 		 468 aa  67  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.814401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2041  MgtE intracellular region  23.18 
 
 		 426 aa  67  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000239361  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1722  magnesium transporter  25.68 
 
 		 462 aa  66.6  0.0000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0069  MgtE intracellular region  23.1 
 
 		 625 aa  66.2  0.0000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3240  magnesium transporter  26.76 
 
 		 451 aa  66.2  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0666949 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0696  magnesium transporter  28.57 
 
 		 470 aa  65.9  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10367  Mg2+ transport transmembrane protein mgtE  28.27 
 
 		 460 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.54721 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0809  magnesium transporter  25.57 
 
 		 542 aa  65.1  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2520  magnesium transporter  28.02 
 
 		 454 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.624288 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0320  divalent cation transporter  22.59 
 
 		 460 aa  63.9  0.000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0139413 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0108  magnesium transporter  24.63 
 
 		 481 aa  63.5  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0891  magnesium transporter  25.35 
 
 		 449 aa  63.9  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00182098 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03755  magnesium transporter  25.91 
 
 		 449 aa  63.2  0.000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.578894  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl217  Mg/Co/Ni transporter  21 
 
 		 468 aa  62.8  0.00000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.153216  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2441  magnesium transporter  23.05 
 
 		 460 aa  62.8  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1461  magnesium transporter  25.47 
 
 		 463 aa  62.8  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00122115  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2058  magnesium transporter  23.87 
 
 		 460 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2879  magnesium transporter  24.42 
 
 		 451 aa  61.6  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2786  magnesium transporter  25.93 
 
 		 463 aa  61.6  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12500  magnesium transporter  20.89 
 
 		 442 aa  61.2  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2199  divalent cation transporter  25.4 
 
 		 465 aa  61.2  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1703  magnesium transporter  27.23 
 
 		 445 aa  60.8  0.00000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2099  magnesium transporter  23.46 
 
 		 460 aa  60.8  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.168721  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2000  magnesium transporter  24.09 
 
 		 454 aa  60.5  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0596  magnesium transporter  23.72 
 
 		 451 aa  60.5  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000141787  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2282  magnesium transporter  26.32 
 
 		 453 aa  59.7  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0198685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0760  magnesium transporter  16.36 
 
 		 467 aa  59.3  0.0000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.076755  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2363  magnesium transporter  21.76 
 
 		 454 aa  59.3  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4791  putative magnesium transporter MgtE-like (divalent cation transporter Mg2+/Ni2+/Co2+)  26.82 
 
 		 472 aa  59.7  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2510  MgtE intracellular region  26.92 
 
 		 427 aa  58.9  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000104929 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1125  magnesium transporter  26.82 
 
 		 444 aa  58.5  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1159  magnesium transporter  28.44 
 
 		 450 aa  58.5  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1801  divalent cation transporter  22.59 
 
 		 460 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3944  magnesium transporter  25.7 
 
 		 441 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33110  Mg2+ transporter MgtE  26.15 
 
 		 446 aa  58.9  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.237395  normal  0.754036 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1026  magnesium transporter  21.33 
 
 		 461 aa  58.2  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000394015  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6729  magnesium transporter  27.31 
 
 		 463 aa  58.2  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.143213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1007  magnesium transporter  21.33 
 
 		 461 aa  58.2  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00155557  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1619  magnesium transporter  26.96 
 
 		 481 aa  58.2  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00438274  normal  0.116909 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1327  magnesium transporter  24.11 
 
 		 492 aa  57.8  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0134  magnesium transporter  31.25 
 
 		 450 aa  57.8  0.0000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.149732 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0382  magnesium transporter  22.33 
 
 		 454 aa  57.8  0.0000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3682  magnesium transporter  22.78 
 
 		 480 aa  57.4  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1342  divalent cation transporter  23.08 
 
 		 447 aa  57.4  0.0000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.09733  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3340  magnesium transporter  26.22 
 
 		 473 aa  57  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0306  magnesium transporter  22.79 
 
 		 479 aa  57  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.13146  hitchhiker  0.00174841 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2801  divalent cation transporter  22.9 
 
 		 452 aa  56.6  0.0000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1864  MgtE intracellular region  24.89 
 
 		 438 aa  56.6  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1980  magnesium transporter  21.27 
 
 		 451 aa  56.2  0.0000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>