284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2070 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007925  RPC_2070  transposase, IS4  100 
 
 
369 aa  760    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.361734 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5670  transposase ISAs1 family protein  32.24 
 
 
393 aa  216  7e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3781  transposase IS4 family protein  37.05 
 
 
372 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0486  transposase IS4 family protein  36.87 
 
 
372 aa  212  7.999999999999999e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3151  transposase IS4 family protein  36.87 
 
 
372 aa  212  7.999999999999999e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.683111  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3805  transposase IS4 family protein  37.22 
 
 
372 aa  212  9e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01923  transposase  36.99 
 
 
367 aa  201  1.9999999999999998e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0336  transposase IS4 family protein  37.13 
 
 
388 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.401127  normal  0.821515 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1781  transposase IS4 family protein  37.13 
 
 
388 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.638522  normal  0.800258 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2179  transposase IS4 family protein  37.13 
 
 
388 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3914  transposase IS4 family protein  37.13 
 
 
388 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.435359 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3776  transposase IS4 family protein  37.13 
 
 
388 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.146379  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0083  transposase IS4 family protein  37.13 
 
 
388 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.0627718 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5084  transposase IS4 family protein  37.13 
 
 
388 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0282093 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4269  transposase IS4 family protein  35.88 
 
 
342 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5832  transposase ISAs1 family protein  32.61 
 
 
377 aa  196  7e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5401  transposase ISAs1 family protein  32.61 
 
 
377 aa  196  7e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3911  transposase ISAs1 family protein  32.61 
 
 
377 aa  196  7e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5630  transposase ISAs1 family protein  32.61 
 
 
377 aa  196  7e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000338804 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5649  transposase ISAs1 family protein  32.61 
 
 
377 aa  196  7e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.345672 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5528  transposase ISAs1 family protein  32.61 
 
 
377 aa  196  7e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0898729 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5802  transposase ISAs1 family protein  32.61 
 
 
377 aa  196  7e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5660  transposase ISAs1 family protein  32.45 
 
 
333 aa  193  5e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.315532 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0786  transposase, IS4 family protein  32.46 
 
 
374 aa  192  5e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0609195  hitchhiker  0.00199568 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0805  transposase, IS4 family protein  32.46 
 
 
374 aa  193  5e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0028853 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0767  transposase, IS4 family protein  32.46 
 
 
374 aa  192  8e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.179756 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0793  transposase, IS4 family protein  32.17 
 
 
374 aa  188  1e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.980671  hitchhiker  0.00200934 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01670  hypothetical protein  32.6 
 
 
373 aa  184  3e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2703  transposase IS4 family protein  36.16 
 
 
381 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0027  transposase IS4 family protein  36.16 
 
 
381 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2901  transposase IS4 family protein  36.16 
 
 
381 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.180142  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3482  transposase, IS4 family protein  34.7 
 
 
327 aa  180  4e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.249116  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0583  ISEc3, transposase  29.38 
 
 
378 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0257  ISEc3, transposase  28.92 
 
 
378 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.893846 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3399  transposase IS4 family protein  30.47 
 
 
377 aa  172  6.999999999999999e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0182881  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2187  transposase IS4 family protein  29.72 
 
 
378 aa  172  1e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00361348  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2203  transposase IS4 family protein  29.11 
 
 
378 aa  172  1e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000366545  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2950  transposase IS4 family protein  29.11 
 
 
378 aa  172  1e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.179437  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1061  ISPg6, transposase  31.52 
 
 
362 aa  171  2e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.179104 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0643  ISEc4, transposase  28.76 
 
 
378 aa  171  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.688283  normal  0.852316 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00213  predicted transposase  29.03 
 
 
378 aa  170  4e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3396  transposase IS4 family protein  30.47 
 
 
377 aa  170  4e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0513234  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00217  hypothetical protein  29.03 
 
 
378 aa  170  4e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3009  transposase  31.34 
 
 
370 aa  170  4e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0796  ISEc4, transposase  28.38 
 
 
378 aa  170  4e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.699242  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1741  IS4 family transposase  29.35 
 
 
381 aa  169  6e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03334  predicted transposase  28.57 
 
 
378 aa  168  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0230  transposase IS4 family protein  28.57 
 
 
378 aa  168  1e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03286  hypothetical protein  28.57 
 
 
378 aa  168  1e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0598  transposase, IS4  30.52 
 
 
374 aa  167  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0779  IS4 family transposase  29.08 
 
 
381 aa  166  4e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.44414  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1672  IS4 family transposase  29.08 
 
 
381 aa  166  4e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.56828  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0477  transposase, IS4  29.97 
 
 
374 aa  167  4e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1172  transposase, IS4  29.97 
 
 
374 aa  167  4e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2439  transposase, IS4  30.25 
 
 
374 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3082  transposase IS4 family protein  28.57 
 
 
378 aa  162  6e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2129  transposase, putative  30.45 
 
 
373 aa  159  7e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0262  putative transposase, IS4 family  32.65 
 
 
390 aa  158  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.400165  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3592  transposase IS4 family protein  30.17 
 
 
369 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4106  transposase IS4 family protein  30.17 
 
 
369 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0589  transposase IS4 family protein  30.17 
 
 
369 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.900163 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4396  transposase IS4 family protein  30.17 
 
 
369 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000348998  normal  0.0139807 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3256  transposase IS4 family protein  30.17 
 
 
369 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0156341 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0170  transposase IS4 family protein  30.17 
 
 
369 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0630  transposase IS4 family protein  30.17 
 
 
369 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0101  transposase IS4 family protein  30.17 
 
 
369 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0766  transposase IS4 family protein  30.17 
 
 
369 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.799607  normal  0.310535 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0643  transposase IS4 family protein  30.17 
 
 
369 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0994  transposase IS4 family protein  30.17 
 
 
369 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.416705  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4087  transposase IS4 family protein  30.17 
 
 
369 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0548  transposase IS4 family protein  30.17 
 
 
369 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1228  transposase IS4 family protein  30.17 
 
 
369 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000142924 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0098  transposase IS4 family protein  30.17 
 
 
369 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1271  transposase IS4 family protein  30.17 
 
 
369 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00393062 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1300  transposase IS4 family protein  30.17 
 
 
369 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.406544  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2564  transposase IS4 family protein  30.17 
 
 
369 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000012164  hitchhiker  0.000000684165 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2329  transposase IS4 family protein  30.17 
 
 
369 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0102713  hitchhiker  0.000965394 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1398  transposase IS4 family protein  30.17 
 
 
369 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2609  transposase IS4 family protein  30.17 
 
 
369 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.720943  hitchhiker  0.00290124 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3014  transposase IS4 family protein  30.17 
 
 
369 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.137978 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2785  transposase IS4 family protein  30.17 
 
 
369 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.738177  normal  0.743727 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3606  transposase IS4 family protein  30.17 
 
 
369 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3220  transposase IS4 family protein  30.17 
 
 
369 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0595  transposase IS4 family protein  30.17 
 
 
369 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0172  transposase IS4 family protein  30.17 
 
 
369 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3394  transposase IS4 family protein  30.17 
 
 
369 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.750621  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4172  transposase IS4 family protein  30.17 
 
 
369 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0564  transposase IS4 family protein  30.17 
 
 
369 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.561014  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3866  transposase IS4 family protein  29.89 
 
 
369 aa  149  7e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000448202 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0597  transposase IS4 family protein  29.89 
 
 
369 aa  149  7e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.818291 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0603  transposase IS4 family protein  29.89 
 
 
369 aa  149  7e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0246  transposase, IS4 family protein  29.01 
 
 
367 aa  149  7e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0296  transposase IS4 family protein  29.89 
 
 
369 aa  149  7e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0443  transposase IS4 family protein  29.89 
 
 
369 aa  149  7e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0569  transposase IS4 family protein  29.89 
 
 
369 aa  149  7e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.228181  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0572  transposase IS4 family protein  29.89 
 
 
369 aa  149  7e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3614  transposase IS4 family protein  29.81 
 
 
366 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1595  transposase IS4 family protein  29.81 
 
 
366 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.137693 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0594  transposase IS4 family protein  29.81 
 
 
366 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4156  transposase IS4 family protein  29.81 
 
 
366 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>