11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1996 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1996  hypothetical protein  100 
 
 		 77 aa  158  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1306  transposase IS3/IS911  46.81 
 
 		 100 aa  48.9  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.273765 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1654  transposase IS3/IS911  46.81 
 
 		 100 aa  48.9  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1712  transposase IS3/IS911  46.81 
 
 		 100 aa  48.9  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2284  transposase IS3/IS911  46.81 
 
 		 100 aa  48.9  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4204  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 		 102 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6609  transposase and inactivated derivatives  40 
 
 		 63 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.580446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4376  transposase IS3/IS911  41.07 
 
 		 103 aa  43.9  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4500  transposase IS3/IS911 family protein  41.07 
 
 		 103 aa  43.9  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5937  transposase IS3/IS911  40.82 
 
 		 102 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.653759  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1736  transposase  38 
 
 		 102 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.642298 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>