173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1525 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1525  deoxycytidine triphosphate deaminase  100 
 
 		 185 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.409036  normal  0.538496 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2794  dCTP deaminase  37.71 
 
 		 195 aa  105  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1658  deoxycytidine triphosphate deaminase  38.98 
 
 		 193 aa  102  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.190488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1763  deoxycytidine triphosphate deaminase  38.98 
 
 		 193 aa  102  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0121906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4243  deoxycytidine triphosphate deaminase  38.46 
 
 		 191 aa  103  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2616  deoxycytidine triphosphate deaminase  38.42 
 
 		 193 aa  100  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1733  deoxycytidine triphosphate deaminase  38.42 
 
 		 193 aa  100  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00151185  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3823  deoxycytidine triphosphate deaminase  38.14 
 
 		 192 aa  99.8  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18990  deoxycytidine triphosphate deaminase  39.18 
 
 		 193 aa  99.8  2e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.27567  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0147  deoxycytidine triphosphate deaminase  37.63 
 
 		 194 aa  99  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0302964 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1548  deoxycytidine triphosphate deaminase  35.59 
 
 		 194 aa  99  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.140824  hitchhiker  0.0000237389 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2217  deoxycytidine triphosphate deaminase  38.42 
 
 		 193 aa  98.6  5e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35480  dCTP deaminase  37.95 
 
 		 191 aa  98.6  5e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2046  deoxycytidine triphosphate deaminase  37.85 
 
 		 194 aa  97.8  7e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.416857  normal  0.66664 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01987  deoxycytidine triphosphate deaminase  36.51 
 
 		 197 aa  97.1  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.303345  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2837  deoxycytidine triphosphate deaminase  36.16 
 
 		 198 aa  96.3  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.114909  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3664  deoxycytidine triphosphate deaminase  37.11 
 
 		 191 aa  96.3  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1043  deoxycytidine triphosphate deaminase  37.85 
 
 		 207 aa  96.7  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000608448  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2156  deoxycytidine triphosphate deaminase  35.16 
 
 		 172 aa  96.3  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3877  deoxycytidine triphosphate deaminase  37.63 
 
 		 193 aa  96.3  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1576  deoxycytidine triphosphate deaminase  36.07 
 
 		 194 aa  95.1  5e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0052  deoxycytidine triphosphate deaminase  40.96 
 
 		 194 aa  95.1  6e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.767695  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2243  deoxycytidine triphosphate deaminase  37.16 
 
 		 194 aa  94.4  9e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0827  deoxycytidine triphosphate deaminase  35.71 
 
 		 180 aa  94.4  9e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000119841  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2067  deoxycytidine triphosphate deaminase  35.16 
 
 		 172 aa  94  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000164963 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25230  deoxycytidine triphosphate deaminase  35.43 
 
 		 197 aa  93.2  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.493678  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1889  deoxycytidine triphosphate deaminase  38.32 
 
 		 193 aa  93.2  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000932331  normal  0.0428491 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8794  deoxycytidine triphosphate deaminase  40.24 
 
 		 216 aa  93.2  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.022766  normal  0.413078 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2575  deoxycytidine triphosphate deaminase  38.32 
 
 		 193 aa  93.2  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.109993  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2462  deoxycytidine triphosphate deaminase  38.32 
 
 		 193 aa  93.2  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000265475  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2455  deoxycytidine triphosphate deaminase  38.32 
 
 		 193 aa  93.2  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000233187  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1478  deoxycytidine triphosphate deaminase  36.84 
 
 		 193 aa  92  4e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5912  deoxycytidine triphosphate deaminase  35.9 
 
 		 196 aa  91.7  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1348  dCTP deaminase  36.9 
 
 		 193 aa  91.3  6e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000358691 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3189  deoxycytidine triphosphate deaminase  36.6 
 
 		 191 aa  91.3  7e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0052  deoxycytidine triphosphate deaminase  35.59 
 
 		 201 aa  90.1  1e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0561  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.42 
 
 		 177 aa  90.1  1e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0430  deoxycytidine triphosphate deaminase  40.11 
 
 		 190 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0021  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.85 
 
 		 196 aa  90.5  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.324355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0440  deoxycytidine triphosphate deaminase  40.11 
 
 		 190 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0355073 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0756  deoxycytidine triphosphate deaminase  36.07 
 
 		 194 aa  90.5  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26270  deoxycytidine triphosphate deaminase  35.86 
 
 		 194 aa  90.5  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.175156 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0417  deoxycytidine triphosphate deaminase  40.11 
 
 		 190 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.429119 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0084  deoxycytidine triphosphate deaminase  37.1 
 
 		 200 aa  90.1  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1290  deoxycytidine triphosphate deaminase  36.16 
 
 		 193 aa  89.7  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4412  deoxycytidine triphosphate deaminase  35.29 
 
 		 191 aa  90.1  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.491521  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0459  deoxycytidine triphosphate deaminase  38.5 
 
 		 189 aa  89.7  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.552653  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0448  deoxycytidine triphosphate deaminase  35.57 
 
 		 191 aa  89.4  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.468429  normal  0.993437 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0589  deoxycytidine triphosphate deaminase  38.5 
 
 		 190 aa  89.4  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00611749  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01971  deoxycytidine triphosphate deaminase  35.03 
 
 		 193 aa  88.2  5e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01960  hypothetical protein  35.03 
 
 		 193 aa  88.2  5e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0995  deoxycytidine triphosphate deaminase  35.03 
 
 		 193 aa  88.2  5e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1577  deoxycytidine triphosphate deaminase  35.2 
 
 		 193 aa  88.6  5e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.600323 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3002  deoxycytidine triphosphate deaminase  35.03 
 
 		 193 aa  88.2  5e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.304986 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1167  deoxycytidine triphosphate deaminase  35.03 
 
 		 193 aa  88.2  7e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38680  deoxycytidine triphosphate deaminase  36.65 
 
 		 195 aa  88.2  7e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1576  deoxycytidine triphosphate deaminase  35.03 
 
 		 193 aa  88.2  7e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0207853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2205  deoxycytidine triphosphate deaminase  35.03 
 
 		 193 aa  88.2  7e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2358  deoxycytidine triphosphate deaminase  35.03 
 
 		 193 aa  88.2  7e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0645  deoxycytidine triphosphate deaminase  35.23 
 
 		 194 aa  87.8  9e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000193078  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1592  deoxycytidine triphosphate deaminase  35.03 
 
 		 193 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00335404  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2441  deoxycytidine triphosphate deaminase  35.2 
 
 		 194 aa  87  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.145517 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2112  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.69 
 
 		 191 aa  87.4  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.24843 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4541  deoxycytidine triphosphate deaminase  35.11 
 
 		 196 aa  87  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0291  deoxycytidine triphosphate deaminase  37.97 
 
 		 190 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18819  normal  0.0282083 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3041  deoxycytidine triphosphate deaminase  35.59 
 
 		 193 aa  87.4  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3194  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.08 
 
 		 193 aa  86.3  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.075679  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0395  2-deoxycytidine 5-triphosphate deaminase  33.33 
 
 		 193 aa  86.7  2e-16  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.610625  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2551  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.08 
 
 		 193 aa  86.3  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2452  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.08 
 
 		 193 aa  86.3  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0239  deoxycytidine triphosphate deaminase  36.51 
 
 		 201 aa  86.3  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.588762 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1899  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.88 
 
 		 199 aa  85.9  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.234563  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0244  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.69 
 
 		 191 aa  85.9  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2714  deoxycytidine triphosphate deaminase  35.32 
 
 		 195 aa  85.9  3e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4348  deoxycytidine triphosphate deaminase  35.79 
 
 		 191 aa  85.5  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00886723  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2679  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.46 
 
 		 193 aa  85.5  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.386804 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10326  deoxycytidine triphosphate deaminase  37.43 
 
 		 190 aa  85.1  5e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4811  deoxycytidine triphosphate deaminase  36.59 
 
 		 196 aa  84.7  6e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2870  deoxycytidine triphosphate deaminase  37.08 
 
 		 193 aa  84.7  7e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2412  deoxycytidine triphosphate deaminase  35.05 
 
 		 200 aa  84.3  8e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5267  deoxycytidine triphosphate deaminase  36.9 
 
 		 193 aa  84.3  8e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0993  deoxycytidine triphosphate deaminase  32 
 
 		 185 aa  84.3  9e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1198  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.46 
 
 		 194 aa  83.6  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2348  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.46 
 
 		 193 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4349  deoxycytidine triphosphate deaminase  35.2 
 
 		 199 aa  83.2  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.756279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2462  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.46 
 
 		 193 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.417752 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1470  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.54 
 
 		 199 aa  83.2  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2304  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.46 
 
 		 193 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0890  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.76 
 
 		 191 aa  83.2  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6959  deoxycytidine triphosphate deaminase  35.26 
 
 		 211 aa  82.8  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.504327  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2355  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.46 
 
 		 193 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.506622  normal  0.430961 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2248  deoxycytidine triphosphate deaminase  34.46 
 
 		 193 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2932  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.69 
 
 		 196 aa  82.4  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01700  dCTP deaminase  32.24 
 
 		 182 aa  82  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0445  deoxycytidine triphosphate deaminase  33.5 
 
 		 203 aa  82  0.000000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.272127  normal  0.513401 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1477  dCTP deaminase  31.32 
 
 		 178 aa  80.5  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1883  dCTP deaminase  34.34 
 
 		 174 aa  79.7  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.740124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1247  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.56 
 
 		 206 aa  79.3  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0198775  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0056  deoxycytidine triphosphate deaminase  35.29 
 
 		 192 aa  79  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.18705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0061  deoxycytidine triphosphate deaminase  35.29 
 
 		 192 aa  79  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.767795  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>