15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1495 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1495  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  327  3e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.126254 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3796  hypothetical protein  72.03 
 
 		 164 aa  213  7e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.199128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4434  hypothetical protein  67.97 
 
 		 163 aa  213  8e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1675  hypothetical protein  68.71 
 
 		 161 aa  210  7e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.026823 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1109  hypothetical protein  66.67 
 
 		 163 aa  208  2e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.199159  normal  0.198527 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1342  hypothetical protein  63.29 
 
 		 163 aa  200  6e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5522  hypothetical protein  69.4 
 
 		 161 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4704  hypothetical protein  36.71 
 
 		 157 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00344811  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4188  hypothetical protein  34.67 
 
 		 157 aa  65.1  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3043  hypothetical protein  29.86 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.56 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3267  hypothetical protein  29.86 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3240  hypothetical protein  30.87 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5548  hypothetical protein  27.27 
 
 		 157 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.863043 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1954  flagellar basal-body protein FlbY  25.74 
 
 		 149 aa  44.3  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2554  hypothetical protein  25 
 
 		 158 aa  43.1  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>