11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1340 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1340  hypothetical protein  100 
 
 		 203 aa  400  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.431234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0661  hypothetical protein  55.38 
 
 		 198 aa  198  5e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0568  hypothetical protein  50.26 
 
 		 198 aa  187  1e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00869432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4918  hypothetical protein  52.22 
 
 		 194 aa  184  6e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596261  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4090  hypothetical protein  48.74 
 
 		 193 aa  177  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4240  hypothetical protein  44.83 
 
 		 199 aa  161  7e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.354915 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1200  hypothetical protein  51.38 
 
 		 197 aa  154  7e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3614  hypothetical protein  45.77 
 
 		 202 aa  124  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0507032 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3421  hypothetical protein  45.89 
 
 		 195 aa  118  7e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00392236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3730  hypothetical protein  44.52 
 
 		 195 aa  115  6e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.342678 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5802  hypothetical protein  31.75 
 
 		 194 aa  90.9  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.749179  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>