87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1055 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



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Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1055  Na+-transporting methylmalonyl-CoA/oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  100 
 
 		 404 aa  800    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007778  RPB_3300  Na+-transporting methylmalonyl-CoA/oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  93.32 
 
 		 404 aa  729    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.568287  normal  0.687597 
 
 
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NC_007643  Rru_A1320  Na+-transporting methylmalonyl-CoA/oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  76.37 
 
 		 403 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3311  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  48.19 
 
 		 419 aa  328  1.0000000000000001e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.524718  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0064  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  32.29 
 
 		 458 aa  176  7e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000825924  n/a   
 
 
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NC_010003  Pmob_1666  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  30.5 
 
 		 378 aa  173  5.999999999999999e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010320  Teth514_1850  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  30.81 
 
 		 371 aa  169  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013926  Aboo_1366  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  31.2 
 
 		 371 aa  162  9e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0970763  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2282  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  32.08 
 
 		 376 aa  162  9e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2892  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  32.38 
 
 		 378 aa  162  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0351319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1492  glutaconyl-CoA decarboxylase beta subunit  31.02 
 
 		 370 aa  160  3e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0159163 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0047  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  30.63 
 
 		 374 aa  159  7e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3375  oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  29.95 
 
 		 376 aa  158  2e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009718  Fnod_1310  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  30.1 
 
 		 383 aa  158  2e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010483  TRQ2_0047  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  30.13 
 
 		 374 aa  157  3e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007512  Plut_1434  Na+-transporting methylmalonyl-CoA/oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  30.87 
 
 		 378 aa  156  5.0000000000000005e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.896881 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0382  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  30.77 
 
 		 385 aa  155  8e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.159911  normal  0.654104 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1898  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  29.1 
 
 		 378 aa  155  9e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007512  Plut_1266  Na+-transporting methylmalonyl-CoA/oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  29.47 
 
 		 516 aa  155  1e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010001  Cphy_2434  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  31.18 
 
 		 360 aa  155  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.13524  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0605  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  29.84 
 
 		 436 aa  153  5e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0086  oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  28.32 
 
 		 376 aa  153  5e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.923092  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0886  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  28.46 
 
 		 378 aa  152  1e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3585  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  29.7 
 
 		 379 aa  152  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.330233  normal  0.310791 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0640  oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  29.34 
 
 		 376 aa  151  2e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011059  Paes_0917  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  28.83 
 
 		 519 aa  150  4e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.507038 
 
 
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NC_009523  RoseRS_3692  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  33.33 
 
 		 376 aa  150  5e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0136998 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02840  oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  29.87 
 
 		 376 aa  150  5e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010803  Clim_0809  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  28.42 
 
 		 516 aa  149  8e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.61044  n/a   
 
 
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NC_009767  Rcas_0953  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  33.22 
 
 		 376 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.126318 
 
 
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NC_003910  CPS_1050  oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  28.98 
 
 		 377 aa  148  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009718  Fnod_1275  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  28.08 
 
 		 376 aa  147  2.0000000000000003e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010831  Cphamn1_1201  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  28.68 
 
 		 516 aa  147  3e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.644428 
 
 
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NC_007575  Suden_1258  pyruvate carboxylase/oxaloacetate decarboxylase biotin carboxyl carrier subunit alpha  29.92 
 
 		 443 aa  147  3e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.913134  n/a   
 
 
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NC_011060  Ppha_0944  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  29.55 
 
 		 374 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008228  Patl_3011  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  29.29 
 
 		 376 aa  146  8.000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03490  oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  28.2 
 
 		 376 aa  143  5e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_010655  Amuc_0204  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  31.83 
 
 		 554 aa  142  9.999999999999999e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.928975 
 
 
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NC_013456  VEA_002526  oxaloacetate decarboxylase beta chain  28.12 
 
 		 376 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3314  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  33.1 
 
 		 416 aa  140  4.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_3622  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  31.79 
 
 		 390 aa  138  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000349445  hitchhiker  0.000000446411 
 
 
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NC_009012  Cthe_0509  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  27.95 
 
 		 359 aa  138  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010814  Glov_1820  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  30.13 
 
 		 376 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008700  Sama_1053  oxaloacetate decarboxylase  29.62 
 
 		 376 aa  133  6e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.24493 
 
 
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NC_009438  Sputcn32_1031  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  30.2 
 
 		 376 aa  132  9e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.634771  n/a   
 
 
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NC_013522  Taci_0294  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  29.54 
 
 		 374 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009665  Shew185_1093  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  30.46 
 
 		 376 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007643  Rru_A3673  glutaconyl-CoA decarboxylase  29.77 
 
 		 376 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.523011  n/a   
 
 
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NC_008740  Maqu_0972  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  29.18 
 
 		 444 aa  130  4.0000000000000003e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.377854  n/a   
 
 
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NC_011831  Cagg_0996  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  28.87 
 
 		 388 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_002950  PG1608  methylmalonyl-CoA decarboxylase, beta subunit  29.07 
 
 		 383 aa  130  6e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_007912  Sde_1307  oxaloacetate decarboxylase  30.86 
 
 		 420 aa  129  6e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0998305  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1127  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  30.2 
 
 		 376 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009052  Sbal_1026  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  30.2 
 
 		 376 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2985  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  30.23 
 
 		 376 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.733812 
 
 
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NC_008322  Shewmr7_3067  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  30.23 
 
 		 376 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.738311 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3197  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  30.16 
 
 		 379 aa  128  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3265  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  29.95 
 
 		 376 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.109963 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3164  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  29.97 
 
 		 376 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1741  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  29.68 
 
 		 376 aa  127  5e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.353254 
 
 
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NC_010506  Swoo_3335  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  28.43 
 
 		 376 aa  124  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107525 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2479  oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  30.79 
 
 		 375 aa  123  7e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.231927  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1322  glutaconyl-CoA decarboxylase  28.65 
 
 		 376 aa  122  8e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0119077 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1200  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  28.79 
 
 		 376 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0241  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  26.09 
 
 		 382 aa  120  3e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.140679  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1067  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  28.53 
 
 		 376 aa  121  3e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1221  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  29.53 
 
 		 377 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.949455  normal  1 
 
 
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NC_010001  Cphy_1925  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  24.8 
 
 		 380 aa  119  7e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1756  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  27.42 
 
 		 375 aa  119  9.999999999999999e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0694  oxaloacetate decarboxylase  25.8 
 
 		 440 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00230113  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3542  oxaloacetate decarboxylase beta chain  34.87 
 
 		 433 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.069232  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0319  oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  28.43 
 
 		 433 aa  112  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0059  oxaloacetate decarboxylase beta chain  34.54 
 
 		 433 aa  111  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.242955  normal  0.132607 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3711  oxaloacetate decarboxylase beta chain  34.54 
 
 		 433 aa  110  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011080  SNSL254_A0059  oxaloacetate decarboxylase beta chain  34.54 
 
 		 433 aa  109  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.566525 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0060  oxaloacetate decarboxylase beta chain  34.54 
 
 		 433 aa  109  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0895  oxaloacetate decarboxylase subunit beta  34.54 
 
 		 433 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0832  oxaloacetate decarboxylase beta chain  34.54 
 
 		 433 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0058  oxaloacetate decarboxylase subunit beta  34.21 
 
 		 433 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0452958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0061  oxaloacetate decarboxylase beta chain  34.54 
 
 		 433 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3649  oxaloacetate decarboxylase subunit beta  34.21 
 
 		 433 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3614  oxaloacetate decarboxylase beta chain  34.21 
 
 		 433 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0863  oxaloacetate decarboxylase beta chain  34.54 
 
 		 433 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3543  oxaloacetate decarboxylase beta chain  34.21 
 
 		 433 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0804  oxaloacetate decarboxylase beta chain  34.21 
 
 		 433 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0203  oxaloacetate decarboxylase beta subunit  33.33 
 
 		 421 aa  103  6e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2305  pyruvate carboxyltransferase  42.25 
 
 		 216 aa  62.8  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.160585  n/a   
 
 
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