50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0978 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007925  RPC_0978  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
177 aa  357  5e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000606848 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0143  GCN5-related N-acetyltransferase  36.84 
 
 
221 aa  84.7  7e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0415  GCN5-related N-acetyltransferase  28.79 
 
 
173 aa  66.6  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1312  GCN5-related N-acetyltransferase  36.13 
 
 
178 aa  56.2  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.449601  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1340  GCN5-related N-acetyltransferase  36.25 
 
 
163 aa  50.1  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000436515 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2952  GCN5-related N-acetyltransferase  35.06 
 
 
206 aa  49.7  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.409535  normal  0.324969 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4677  GCN5-related N-acetyltransferase  33.77 
 
 
168 aa  49.3  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000068421 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0669  GCN5-related N-acetyltransferase  30.11 
 
 
154 aa  48.5  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06630  acetyltransferase, N-acetylglutamate synthase  41.86 
 
 
155 aa  47.8  0.00009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.300608  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2699  GCN5-related N-acetyltransferase  30.47 
 
 
165 aa  47.4  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.709564  normal  0.706077 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0280  GCN5-related N-acetyltransferase  36.49 
 
 
155 aa  47.4  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.539366  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2923  GCN5-related N-acetyltransferase  30.49 
 
 
156 aa  46.2  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00551848  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0731  Carbonate dehydratase  35.42 
 
 
380 aa  47  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0840  hypothetical protein  39.34 
 
 
161 aa  46.6  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000581009  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0544  GCN5-related N-acetyltransferase  37.14 
 
 
146 aa  45.8  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0176  GCN5-related N-acetyltransferase  34.31 
 
 
295 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07320  acetyltransferase  32.85 
 
 
190 aa  45.1  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2063  GCN5-related N-acetyltransferase  27.64 
 
 
168 aa  45.1  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.227468 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00969  GNAT family N-acetyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01380)  35.23 
 
 
238 aa  44.7  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1507  GCN5-related N-acetyltransferase  35.06 
 
 
210 aa  45.1  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1897  putative acetyltransferase protein  35.79 
 
 
187 aa  44.7  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.385143  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2895  GCN5-related N-acetyltransferase  36.05 
 
 
281 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.446946  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2851  GCN5-related N-acetyltransferase  36.05 
 
 
281 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.672251  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1401  acetyltransferase  35.79 
 
 
187 aa  44.7  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.277124  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1811  acetyltransferase  35.79 
 
 
169 aa  44.7  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0205  acetyltransferase  35.79 
 
 
187 aa  44.7  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2882  GCN5-related N-acetyltransferase  36.05 
 
 
281 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0899618  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0940  acetyltransferase  35.79 
 
 
169 aa  44.3  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0356  acetyltransferase  32.23 
 
 
169 aa  44.7  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2822  GCN5-related N-acetyltransferase  48.28 
 
 
169 aa  43.9  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0282  GCN5-related N-acetyltransferase  34.34 
 
 
245 aa  43.9  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06850  acetyltransferase  34.92 
 
 
154 aa  43.9  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3318  GCN5-related N-acetyltransferase  29.67 
 
 
157 aa  43.9  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0859673 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0442  acetyltransferase  35.79 
 
 
169 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1564  GCN5-related N-acetyltransferase  31.73 
 
 
179 aa  43.1  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000684291  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0091  GCN5-related N-acetyltransferase  26.97 
 
 
164 aa  43.5  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1468  GCN5-related N-acetyltransferase  31.71 
 
 
202 aa  42.7  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3407  GCN5-related N-acetyltransferase  21.55 
 
 
165 aa  42.7  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.204713  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3831  GCN5-related N-acetyltransferase  29.07 
 
 
167 aa  42.4  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6930  GCN5-related N-acetyltransferase  33.67 
 
 
184 aa  42.4  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0014  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  37.33 
 
 
147 aa  42  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00268172  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2066  GCN5-related N-acetyltransferase  35.44 
 
 
156 aa  42.4  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.445128 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01970  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  32.47 
 
 
151 aa  42  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.638695  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08700  acetyltransferase  38.2 
 
 
166 aa  42  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1054  putative acetyltransferase  26.92 
 
 
164 aa  41.6  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2284  acetyltransferase  25.56 
 
 
157 aa  41.6  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.786273  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1745  MarR family transcriptional regulator  31.18 
 
 
291 aa  41.2  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.550965  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0718  GCN5-related N-acetyltransferase  43.1 
 
 
149 aa  40.8  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34210  acetyltransferase  28.92 
 
 
179 aa  41.2  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1879  GCN5-related N-acetyltransferase  35 
 
 
199 aa  40.8  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.369324 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>