More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0134 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0134  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 386 aa  786    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3596  glycosyl transferase group 1  28.46 
 
 		 393 aa  122  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  22.36 
 
 		 390 aa  98.2  2e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  23.13 
 
 		 391 aa  89.7  8e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  24.32 
 
 		 395 aa  89.4  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  25.81 
 
 		 419 aa  84  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  23.44 
 
 		 398 aa  83.6  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0853  glycosyl transferase, group 1  23.59 
 
 		 398 aa  82.4  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0682 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0395  glycosyl transferase, group 1  22.93 
 
 		 396 aa  82.8  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.288047  normal  0.0226805 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  27.55 
 
 		 422 aa  81.3  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4921  group 1 glycosyl transferase  24.39 
 
 		 391 aa  80.9  0.00000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.509527  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  23.13 
 
 		 391 aa  81.3  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  23.46 
 
 		 391 aa  80.5  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2858  group 1 glycosyl transferase  24.75 
 
 		 393 aa  80.1  0.00000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  22.61 
 
 		 388 aa  79  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  24.44 
 
 		 408 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4231  glycogen synthase  27.78 
 
 		 382 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.294207 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21730  glycogen synthase  26.65 
 
 		 404 aa  77  0.0000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  25.25 
 
 		 415 aa  77  0.0000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  25.25 
 
 		 435 aa  76.6  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4001  glycogen synthase  27.51 
 
 		 382 aa  76.6  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0312479  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4075  glycogen synthase  27.51 
 
 		 382 aa  76.6  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1909  glycosyl transferase group 1  27.13 
 
 		 386 aa  75.9  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.653406  hitchhiker  0.000425018 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  19.55 
 
 		 387 aa  75.9  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  24.64 
 
 		 536 aa  75.9  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0840  glycosyl transferase group 1  30.42 
 
 		 398 aa  75.9  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.755568 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3306  glycogen synthase  27.91 
 
 		 384 aa  75.1  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1514  glycosyl transferase group 1  24.57 
 
 		 396 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.426668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2957  glycosyl transferase group 1  31.22 
 
 		 395 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000652955 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0483  glycosyl transferase, group 1  25.95 
 
 		 370 aa  75.5  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1421  glycogen synthase  26.72 
 
 		 431 aa  74.7  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0504  glycosyl transferase group 1  23.94 
 
 		 391 aa  74.7  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1174  glycogen synthase  28.57 
 
 		 387 aa  74.3  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3184  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  26.38 
 
 		 404 aa  74.3  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2101  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  27.1 
 
 		 379 aa  73.6  0.000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.445016  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1486  glycosyl transferase group 1  24.32 
 
 		 396 aa  73.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4083  glycosyl transferase group 1  24.32 
 
 		 399 aa  72.8  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  24.73 
 
 		 380 aa  72.8  0.000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  26.6 
 
 		 351 aa  72.8  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0793  glycogen synthase  26.23 
 
 		 395 aa  72.4  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  22.75 
 
 		 423 aa  72.4  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  23.38 
 
 		 672 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0428  glycogen synthase  25.57 
 
 		 404 aa  71.2  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.743156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  26.49 
 
 		 439 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  26.49 
 
 		 439 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4504  glycogen synthase  27.91 
 
 		 387 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.746384 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  26.49 
 
 		 439 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2191  glycogen synthase  26.79 
 
 		 382 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5195  glycosyl transferase group 1  25.37 
 
 		 396 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.3048e-16 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2093  glycogen synthase  28.19 
 
 		 395 aa  70.5  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2873  group 1 glycosyl transferase  23.09 
 
 		 421 aa  70.9  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8230  glycosyl transferase group 1  23.11 
 
 		 414 aa  70.5  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  24.67 
 
 		 374 aa  70.5  0.00000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  24 
 
 		 424 aa  70.1  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0898  hypothetical protein  28.17 
 
 		 407 aa  69.7  0.00000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3592  glycosyl transferase group 1  24.69 
 
 		 367 aa  69.7  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0837  glycosyl transferase, group 1  25.45 
 
 		 379 aa  69.7  0.00000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120693  normal  0.126015 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0740  putative glycosyl transferase  24.5 
 
 		 442 aa  69.3  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.053122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1524  glycosyl transferase, group 1  24.8 
 
 		 379 aa  68.9  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.986628  normal  0.661565 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  27.81 
 
 		 414 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1523  glycosyl transferase, group 1  24.28 
 
 		 413 aa  68.9  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.429358 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  26.75 
 
 		 438 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3661  glycosyl transferase group 1  24.69 
 
 		 367 aa  69.3  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  26.75 
 
 		 438 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1918  glycosyl transferase, group 1  27.93 
 
 		 388 aa  69.3  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.257338 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  24.18 
 
 		 421 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  24.45 
 
 		 422 aa  68.6  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03650  glycosyltransferase  25.13 
 
 		 413 aa  68.6  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.736839  normal  0.451667 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  26.33 
 
 		 650 aa  67.8  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5686  glycosyl transferase group 1  26.45 
 
 		 1080 aa  67.8  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6395  glycosyl transferase group 1  25.81 
 
 		 390 aa  67.8  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.229647 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  25.94 
 
 		 423 aa  67.8  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.44 
 
 		 443 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3504  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  24.07 
 
 		 367 aa  67.4  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1592  glycosyl transferase, group 1  29.05 
 
 		 414 aa  67.4  0.0000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0955331  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  24.88 
 
 		 395 aa  67.4  0.0000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3157  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.44 
 
 		 443 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3028  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.19 
 
 		 498 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  24.45 
 
 		 417 aa  67  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1032  glycosyl transferase, group 1  25.32 
 
 		 384 aa  67  0.0000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2606  glycosyl transferase group 1  26.02 
 
 		 398 aa  67  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3447  group 1 glycosyl transferase  24.5 
 
 		 395 aa  67  0.0000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  21.03 
 
 		 378 aa  66.6  0.0000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4609  UDP-N-acetylglucosamine  27.49 
 
 		 450 aa  67  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6261  putative glycosyl transferase  25.4 
 
 		 392 aa  66.6  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204873  normal  0.0540655 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  25.25 
 
 		 419 aa  66.2  0.0000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6732  glycosyl transferase group 1  28.36 
 
 		 394 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1551  glycosyl transferase, group 1  24.34 
 
 		 407 aa  66.2  0.0000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2348  glycosyl transferase, group 1  33.14 
 
 		 411 aa  66.2  0.0000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0363579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1055  glycosyl transferase group 1  26.77 
 
 		 372 aa  65.9  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  25.98 
 
 		 396 aa  65.5  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1496  glycosyl transferase, group 1  23.03 
 
 		 374 aa  66.2  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4006  glycosyl transferase, group 1  21.85 
 
 		 394 aa  66.2  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.927279  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0624  glycosyl transferase group 1  27.92 
 
 		 379 aa  66.2  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.225322 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0821  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  25.54 
 
 		 401 aa  65.9  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0720659  normal  0.0739715 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  23.44 
 
 		 426 aa  65.9  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  25.69 
 
 		 438 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  21.53 
 
 		 410 aa  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5022  glycosyl transferase group 1  25.31 
 
 		 395 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5094  glycosyl transferase group 1  21.45 
 
 		 382 aa  65.1  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>