13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3796 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3796  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  328  2e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.199128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1675  hypothetical protein  85.71 
 
 		 161 aa  259  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.026823 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4434  hypothetical protein  78.66 
 
 		 163 aa  256  1e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1495  hypothetical protein  71.83 
 
 		 163 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.126254 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1109  hypothetical protein  68.92 
 
 		 163 aa  211  2.9999999999999995e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.199159  normal  0.198527 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1342  hypothetical protein  66.04 
 
 		 163 aa  203  1e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5522  hypothetical protein  66.41 
 
 		 161 aa  186  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4704  hypothetical protein  36.48 
 
 		 157 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00344811  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4188  hypothetical protein  38.99 
 
 		 157 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3043  hypothetical protein  35.37 
 
 		 159 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.56 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3267  hypothetical protein  35.37 
 
 		 159 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3240  hypothetical protein  34.87 
 
 		 159 aa  67.4  0.00000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5548  hypothetical protein  29.94 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.863043 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>