190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3382 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_3382  diacylglycerol kinase  100 
 
 
117 aa  226  7e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00149641  normal  0.0769936 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2198  diacylglycerol kinase  89.74 
 
 
117 aa  186  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2059  diacylglycerol kinase  85.47 
 
 
120 aa  171  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.283342 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3494  diacylglycerol kinase  69.83 
 
 
117 aa  141  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.769643 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2081  diacylglycerol kinase  80.17 
 
 
117 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.363199 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1484  diacylglycerol kinase  74.36 
 
 
117 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.208624  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0531  diacylglycerol kinase  46.85 
 
 
128 aa  97.8  4e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000113671  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0628  diacylglycerol kinase  45.87 
 
 
115 aa  97.1  8e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.440789 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02047  Diacylglycerol kinase  47.62 
 
 
117 aa  93.6  8e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0216471  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1586  diacylglycerol kinase  44.44 
 
 
123 aa  88.6  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.117839  normal  0.376831 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2929  diacylglycerol kinase  44.12 
 
 
123 aa  87.8  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.479907  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2512  diacylglycerol kinase  46.15 
 
 
123 aa  87  9e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.361912  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1587  diacylglycerol kinase  41.35 
 
 
134 aa  84.7  4e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.882311  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1747  diacylglycerol kinase  42.86 
 
 
123 aa  83.6  8e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00663  diacylglycerol kinase  46.3 
 
 
134 aa  82  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2640  diacylglycerol kinase  42.34 
 
 
123 aa  82  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.185704  normal  0.0499107 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2029  diacylglycerol kinase  43.64 
 
 
175 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0748724  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4461  diacylglycerol kinase  45.28 
 
 
122 aa  81.3  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03914  diacylglycerol kinase  43.36 
 
 
122 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.299817  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3951  diacylglycerol kinase  43.36 
 
 
122 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3986  diacylglycerol kinase  43.36 
 
 
122 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.345004 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5523  diacylglycerol kinase  43.36 
 
 
122 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.351191  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4595  diacylglycerol kinase  43.36 
 
 
122 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4282  diacylglycerol kinase  43.36 
 
 
122 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03874  hypothetical protein  43.36 
 
 
122 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.223434  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4555  diacylglycerol kinase  43.36 
 
 
122 aa  80.9  0.000000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4504  diacylglycerol kinase  43.36 
 
 
122 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001810  diacylglycerol kinase  50.45 
 
 
135 aa  80.9  0.000000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2308  diacylglycerol kinase  40.87 
 
 
126 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00356562  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2402  diacylglycerol kinase  42.59 
 
 
123 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.802663  normal  0.923325 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1851  diacylglycerol kinase  41.28 
 
 
123 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000916296  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1885  diacylglycerol kinase  41.28 
 
 
170 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00308001  normal  0.576975 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1837  diacylglycerol kinase  41.28 
 
 
123 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000673614  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2203  diacylglycerol kinase  42.31 
 
 
134 aa  79  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1483  diacylglycerol kinase  41.35 
 
 
123 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0058197  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1989  diacylglycerol kinase  38.74 
 
 
123 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00452736 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2192  diacylglycerol kinase  41.67 
 
 
123 aa  77  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0610811  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2269  diacylglycerol kinase  41.67 
 
 
123 aa  77  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0513  diacylglycerol kinase  42.45 
 
 
121 aa  77  0.00000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0732  diacylglycerol kinase  42.45 
 
 
121 aa  76.6  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.241329  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1996  diacylglycerol kinase  40.95 
 
 
123 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00102792  normal  0.342733 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0020  diacylglycerol kinase  47.22 
 
 
127 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4428  diacylglycerol kinase  41.35 
 
 
122 aa  75.1  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000195927 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4630  diacylglycerol kinase  41.35 
 
 
122 aa  75.1  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.312152 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4578  diacylglycerol kinase  41.35 
 
 
122 aa  75.1  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4493  diacylglycerol kinase  41.35 
 
 
122 aa  75.1  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4579  diacylglycerol kinase  41.35 
 
 
122 aa  75.1  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.795309  normal  0.304118 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1317  diacylglycerol kinase  39.42 
 
 
119 aa  74.3  0.0000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05290  diacylglycerol kinase  43.27 
 
 
118 aa  73.9  0.0000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0048  diacylglycerol kinase  40.74 
 
 
120 aa  73.6  0.0000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2363  diacylglycerol kinase  42.86 
 
 
135 aa  73.6  0.0000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2898  diacylglycerol kinase  42.2 
 
 
126 aa  72.8  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0284047 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2290  diacylglycerol kinase  35.65 
 
 
123 aa  72.4  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.213941  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04654  diacylglycerol kinase  40.18 
 
 
126 aa  72.4  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0592128  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17675  diacylglycerol kinase  40.38 
 
 
123 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1538  diacylglycerol kinase  40.38 
 
 
123 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0788  diacylglycerol kinase  42.31 
 
 
122 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000267959 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0903  diacylglycerol kinase  44.34 
 
 
144 aa  70.9  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0193  diacylglycerol kinase  41.24 
 
 
118 aa  70.5  0.000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19800  Prokaryotic diacylglycerol kinase  42.31 
 
 
127 aa  70.1  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1183  diacylglycerol kinase  37.5 
 
 
120 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.182376 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3525  diacylglycerol kinase  41.35 
 
 
121 aa  68.6  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0246  diacylglycerol kinase  44.76 
 
 
122 aa  68.2  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.105689  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1636  diacylglycerol kinase  37.5 
 
 
121 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1238  diacylglycerol kinase  37.5 
 
 
121 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000273829 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0096  diacylglycerol kinase  42.31 
 
 
118 aa  67.8  0.00000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.960764  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4081  diacylglycerol kinase  37.5 
 
 
121 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4234  diacylglycerol kinase  38.89 
 
 
120 aa  67.8  0.00000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000825064  hitchhiker  0.000000879187 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2262  diacylglycerol kinase  36.54 
 
 
130 aa  67.4  0.00000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1725  diacylglycerol kinase  44.23 
 
 
119 aa  67.4  0.00000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1712  diacylglycerol kinase  42.48 
 
 
137 aa  67.4  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.554217  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1106  diacylglycerol kinase  41.44 
 
 
156 aa  67  0.00000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0760  diacylglycerol kinase  41.44 
 
 
156 aa  67  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0389  diacylglycerol kinase  41.44 
 
 
156 aa  67  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1411  diacylglycerol kinase  41.44 
 
 
181 aa  67  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.078925  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1038  diacylglycerol kinase  41.44 
 
 
181 aa  66.6  0.00000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.228272  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4023  diacylglycerol kinase  37.5 
 
 
120 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000116505 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1266  diacylglycerol kinase  41.44 
 
 
181 aa  67  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2973  diacylglycerol kinase  41.35 
 
 
117 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0808149 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3399  diacylglycerol kinase  42.86 
 
 
121 aa  66.6  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1856  diacylglycerol kinase  41.44 
 
 
181 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0939  diacylglycerol kinase  36.61 
 
 
161 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.793375  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1273  diacylglycerol kinase  41.44 
 
 
181 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.924748  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2312  diacylglycerol kinase  41.96 
 
 
148 aa  65.5  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1506  diacylglycerol kinase  39.29 
 
 
126 aa  66.2  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.72408  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1451  diacylglycerol kinase  39.29 
 
 
126 aa  65.5  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3408  diacylglycerol kinase  42.11 
 
 
114 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1163  diacylglycerol kinase  32.73 
 
 
116 aa  65.1  0.0000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0347313  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0318  diacylglycerol kinase  27.68 
 
 
119 aa  65.1  0.0000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1251  diacylglycerol kinase  39.58 
 
 
124 aa  65.1  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0195918  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0678  diacylglycerol kinase  33.96 
 
 
140 aa  65.1  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3213  diacylglycerol kinase  43.86 
 
 
114 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3117  diacylglycerol kinase  40.18 
 
 
161 aa  64.7  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00354589  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2704  diacylglycerol kinase  39.47 
 
 
140 aa  64.3  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0801  diacylglycerol kinase  32.38 
 
 
124 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1014  diacylglycerol kinase  32.41 
 
 
116 aa  63.2  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3537  diacylglycerol kinase  42.98 
 
 
114 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.592449  normal  0.293542 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0655  diacylglycerol kinase  36.61 
 
 
131 aa  63.2  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.655442  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00377  putative diacylglycerol kinase (DAGK)  38.94 
 
 
136 aa  63.2  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2096  diacylglycerol kinase  30.36 
 
 
116 aa  63.2  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.579179  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>