17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3286 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3286  hypothetical protein  100 
 
 		 150 aa  306  5.9999999999999995e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.598655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1069  hypothetical protein  83.57 
 
 		 163 aa  246  9e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1318  hypothetical protein  48.55 
 
 		 138 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.710106  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1060  HutP family protein  32.06 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3355  anti-terminator HutP  29.25 
 
 		 146 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000111995  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2313  anti-terminator HutP  28.57 
 
 		 146 aa  44.3  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000572214  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3443  anti-terminator HutP  28.57 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000872997  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18970  HutP family protein  26.52 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1555  anti-terminator HutP  28.57 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000172152  hitchhiker  0.00598863 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3761  anti-terminator HutP  28.57 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000136863  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3686  anti-terminator HutP  28.57 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000655713  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3340  anti-terminator HutP  28.57 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000591225  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3713  anti-terminator HutP  28.57 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000173303  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3406  anti-terminator HutP  28.57 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.30847e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3681  anti-terminator HutP  28.57 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000464326  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3663  anti-terminator HutP  27.89 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1264  anti-terminator HutP  29.49 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>