101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1064 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1064  hypothetical protein  100 
 
 		 126 aa  249  9.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.581294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0852  Secreted repeat of unknown function  62.99 
 
 		 130 aa  160  4.0000000000000004e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5259  hypothetical protein  76.53 
 
 		 127 aa  157  7e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.189638  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4610  hypothetical protein  62.18 
 
 		 126 aa  150  5e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1476  hypothetical protein  62.18 
 
 		 126 aa  150  5e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.640223  normal  0.869499 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1744  Secreted repeat of unknown function  58.54 
 
 		 134 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0155  hypothetical protein  68.48 
 
 		 123 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.70289 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2915  Secreted repeat of unknown function  66.67 
 
 		 142 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282236 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3262  Secreted repeat of unknown function  64.52 
 
 		 142 aa  127  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.448223  normal  0.363807 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5319  secreted repeat of unknown function  56.91 
 
 		 138 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0220667 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5366  hypothetical protein  55.74 
 
 		 114 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.965277  normal  0.371852 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5368  Secreted repeat of unknown function  53.54 
 
 		 120 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.80855 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2984  hypothetical protein  64.52 
 
 		 148 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5227  hypothetical protein  57.72 
 
 		 123 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.423904 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0520  hypothetical protein  56.9 
 
 		 128 aa  124  4.0000000000000003e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1655  transmembrane protein  62.77 
 
 		 125 aa  124  5e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000107151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5217  Secreted repeat of unknown function  52.85 
 
 		 123 aa  122  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0830561 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3003  hypothetical protein  52.42 
 
 		 138 aa  120  4e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0100135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3281  hypothetical protein  59.14 
 
 		 141 aa  120  7e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70740  hypothetical protein  60.87 
 
 		 151 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5605  hypothetical protein  62.22 
 
 		 127 aa  118  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.682246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6136  hypothetical protein  60.87 
 
 		 127 aa  118  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3144  hypothetical protein  58.51 
 
 		 147 aa  117  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.302781  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3731  hypothetical protein  49.61 
 
 		 124 aa  116  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4205  hypothetical protein  49.61 
 
 		 124 aa  116  9e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.616061  normal  0.266344 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3375  hypothetical protein  59.14 
 
 		 127 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.770936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1653  hypothetical protein  60.42 
 
 		 123 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2753  Secreted repeat of unknown function  57.45 
 
 		 131 aa  115  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3787  hypothetical protein  63.83 
 
 		 129 aa  114  3.9999999999999997e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0589  hypothetical protein  59.38 
 
 		 123 aa  114  5e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.614178  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2323  hypothetical protein  59.38 
 
 		 123 aa  114  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0880  hypothetical protein  59.38 
 
 		 123 aa  114  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1103  hypothetical protein  59.38 
 
 		 123 aa  114  5e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1017  hypothetical protein  59.38 
 
 		 123 aa  114  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1847  hypothetical protein  59.38 
 
 		 123 aa  114  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.155582  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2756  Secreted repeat of unknown function  62.24 
 
 		 126 aa  113  8.999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3396  hypothetical protein  53.4 
 
 		 126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2547  hypothetical protein  52 
 
 		 161 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.178689  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3202  hypothetical protein  56.99 
 
 		 124 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2521  Secreted repeat of unknown function  52.94 
 
 		 126 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4051  hypothetical protein  56.99 
 
 		 124 aa  107  5e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4315  hypothetical protein  56.99 
 
 		 124 aa  107  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4292  hypothetical protein  58.06 
 
 		 124 aa  106  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.608026 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0732  hypothetical protein  50.39 
 
 		 119 aa  105  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1696  hypothetical protein  54.26 
 
 		 124 aa  103  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0969  putative lipoprotein  48.36 
 
 		 119 aa  101  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.464868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0017  putative lipoprotein  47.41 
 
 		 119 aa  100  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.318965  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1416  hypothetical protein  47.41 
 
 		 119 aa  100  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237046  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1996  hypothetical protein  46.77 
 
 		 124 aa  100  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.500109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2553  hypothetical protein  57.45 
 
 		 121 aa  99.4  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424797 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1255  Secreted repeat of unknown function  57.45 
 
 		 121 aa  99.8  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0504542  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1503  ATP/GTP binding protein  46.55 
 
 		 119 aa  99  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.061401  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3018  Secreted repeat of unknown function  47.54 
 
 		 119 aa  99  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.085278  normal  0.0254984 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3032  Secreted repeat of unknown function  41.54 
 
 		 135 aa  99  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000392899  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2780  Secreted repeat of unknown function  53.92 
 
 		 126 aa  98.6  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.725586 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1184  hypothetical protein  46.55 
 
 		 119 aa  97.4  5e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.274213  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0371  hypothetical protein  47.5 
 
 		 119 aa  97.4  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0898922  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0853  hypothetical protein  47.5 
 
 		 119 aa  97.4  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.634738  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0143  hypothetical protein  46.55 
 
 		 119 aa  97.4  5e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0425687  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0422  hypothetical protein  46.55 
 
 		 119 aa  97.4  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.388111  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1157  hypothetical protein  46.55 
 
 		 119 aa  97.4  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1384  hypothetical protein  49.48 
 
 		 119 aa  96.3  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00275643  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3942  hypothetical protein  45.61 
 
 		 119 aa  94.4  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00611037  normal  0.0334852 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0824  hypothetical protein  45.83 
 
 		 119 aa  94.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.011265  hitchhiker  0.00036805 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0743  hypothetical protein  52.75 
 
 		 119 aa  91.7  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0135792 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0147  hypothetical protein  54.46 
 
 		 128 aa  90.5  7e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.129961  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0726  hypothetical protein  50.55 
 
 		 141 aa  88.6  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0234947  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2535  hypothetical protein  49.45 
 
 		 116 aa  89  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.492129  normal  0.124515 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3263  hypothetical protein  45.83 
 
 		 126 aa  89.4  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.745389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00555  hypothetical protein  39.02 
 
 		 244 aa  88.2  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2316  hypothetical protein  47.37 
 
 		 132 aa  87.8  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.546748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2739  Secreted repeat of unknown function  40.31 
 
 		 191 aa  88.2  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0867098  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6204  hypothetical protein  47.31 
 
 		 164 aa  85.5  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0594792  normal  0.0269002 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0647  Secreted repeat of unknown function  41.07 
 
 		 295 aa  83.2  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.824327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2209  hypothetical protein  43.96 
 
 		 144 aa  82.4  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1918  hypothetical protein  45.05 
 
 		 144 aa  82  0.000000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00969066  hitchhiker  0.000868214 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4389  hypothetical protein  39.81 
 
 		 161 aa  80.9  0.000000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1489  hypothetical protein  47.62 
 
 		 144 aa  80.9  0.000000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.092152 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3790  hypothetical protein  40.17 
 
 		 175 aa  80.1  0.000000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2027  Secreted repeat of unknown function  35.48 
 
 		 143 aa  75.5  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2096  Secreted repeat of unknown function  34.09 
 
 		 195 aa  75.5  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.251561  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0398  Secreted repeat of unknown function  42.71 
 
 		 186 aa  72.8  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.473291  normal  0.144879 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3511  Secreted repeat of unknown function  41.59 
 
 		 182 aa  72.4  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00420858 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3290  Secreted repeat of unknown function  38.18 
 
 		 165 aa  72  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1505  hypothetical protein  39.18 
 
 		 298 aa  71.6  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0162675 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0027  hypothetical protein  39.29 
 
 		 200 aa  71.2  0.000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0456  hypothetical protein  32.35 
 
 		 141 aa  71.6  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5354  hypothetical protein  35.34 
 
 		 196 aa  70.9  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.531773  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4095  Secreted repeat of unknown function  37.61 
 
 		 169 aa  68.6  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.170148  normal  0.698481 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5084  secreted repeat of unknown function  40 
 
 		 292 aa  68.2  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.182852  normal  0.686692 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3360  Secreted repeat of unknown function  36.7 
 
 		 189 aa  64.7  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3560  Secreted repeat of unknown function  36.7 
 
 		 277 aa  64.3  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.166475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0063  hypothetical protein  34 
 
 		 155 aa  64.3  0.0000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0083  secreted repeat of unknown function  35 
 
 		 175 aa  63.9  0.0000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4888  Secreted repeat of unknown function  37.86 
 
 		 281 aa  62  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1439  Secreted repeat of unknown function  30.77 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2962  hypothetical protein  31.63 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00331599  normal  0.281874 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0163  hypothetical protein  36.29 
 
 		 300 aa  57  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2165  secreted repeat of unknown function  34.78 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0050  secreted repeat of unknown function  31.58 
 
 		 221 aa  52.4  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>