10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0092 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0092  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  310  3.9999999999999997e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.921002 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0711  hypothetical protein  91.89 
 
 		 172 aa  266  8.999999999999999e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.950138 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0399  hypothetical protein  81.69 
 
 		 166 aa  234  3e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0033  hypothetical protein  73.94 
 
 		 157 aa  214  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2805  hypothetical protein  69.44 
 
 		 158 aa  202  2e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0240  hypothetical protein  69.44 
 
 		 161 aa  198  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3625  hypothetical protein  70.83 
 
 		 158 aa  185  2e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.977353  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0076  hypothetical protein  43.37 
 
 		 167 aa  55.5  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0075  hypothetical protein  43.37 
 
 		 167 aa  55.5  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0089  hypothetical protein  33.12 
 
 		 167 aa  52  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>