70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4676 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0507  hypothetical protein  100 
 
 		 53 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4676  hypothetical protein  100 
 
 		 53 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00000747615  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0373  hypothetical protein  82.69 
 
 		 52 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.485112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0403  hypothetical protein  82.69 
 
 		 52 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5163  hypothetical protein  80.77 
 
 		 52 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.129995 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1072  hypothetical protein  76.92 
 
 		 57 aa  85.5  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0505681  hitchhiker  0.0000834558 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1445  hypothetical protein  78.85 
 
 		 52 aa  85.1  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.344873  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5980  stress induced protein  75 
 
 		 52 aa  80.9  0.000000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1753  Pmp3 family protein  71.15 
 
 		 52 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000804754  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3915  hypothetical protein  66.04 
 
 		 55 aa  77.8  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.932934 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1757  protein of unknown function UPF0057  67.31 
 
 		 52 aa  77  0.00000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.575281 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2519  hypothetical protein  70.59 
 
 		 52 aa  77  0.00000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0701281  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3187  hypothetical protein  65.38 
 
 		 52 aa  76.3  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00459993  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3465  hypothetical protein  69.23 
 
 		 52 aa  76.3  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0694  hypothetical protein  68.63 
 
 		 52 aa  76.3  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1940  protein of unknown function UPF0057  71.15 
 
 		 52 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0399  hypothetical protein  80.77 
 
 		 52 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.350701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4829  hypothetical protein  82.69 
 
 		 52 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.658257  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04740  hypothetical protein  80.77 
 
 		 52 aa  74.7  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3802  hypothetical protein  65.38 
 
 		 52 aa  75.5  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0952  hypothetical protein  60.38 
 
 		 53 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000215986  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4039  hypothetical protein  80.77 
 
 		 74 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.255953  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6707  protein of unknown function UPF0057  65.38 
 
 		 52 aa  74.3  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570236  normal  0.473948 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0670  hypothetical protein  80.77 
 
 		 52 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.741123  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07370  hypothetical protein  80.77 
 
 		 52 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.400909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0810  hypothetical protein  63.46 
 
 		 52 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1909  hypothetical protein  59.62 
 
 		 52 aa  71.6  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0986312 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4140  hypothetical protein  78.85 
 
 		 52 aa  70.1  0.000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.520127  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1824  hypothetical protein  60.78 
 
 		 56 aa  68.6  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.248733 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1257  hypothetical protein  78.85 
 
 		 52 aa  67  0.00000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3215  protein of unknown function UPF0057  59.62 
 
 		 54 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2905  protein of unknown function UPF0057  59.62 
 
 		 54 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4529  protein of unknown function UPF0057  71.15 
 
 		 52 aa  63.9  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0887  hypothetical protein  57.41 
 
 		 55 aa  63.5  0.0000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.141786 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2993  hypothetical protein  62.5 
 
 		 52 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.761732  normal  0.0250059 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2976  hypothetical protein  62.5 
 
 		 52 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.318311  normal  0.0724443 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2941  hypothetical protein  62.5 
 
 		 52 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0778428 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2909  hypothetical protein  62.5 
 
 		 52 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3098  hypothetical protein  62.5 
 
 		 52 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.532788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2734  hypothetical protein  55.77 
 
 		 52 aa  59.3  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000636371 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0450  hypothetical protein  46.15 
 
 		 56 aa  57  0.00000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3317  protein of unknown function UPF0057  47.17 
 
 		 58 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3147  hypothetical protein  56.25 
 
 		 52 aa  55.8  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000486244  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02486  hypothetical protein  58.33 
 
 		 52 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3908  hypothetical protein  58.33 
 
 		 52 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.363662 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2946  hypothetical protein  58.33 
 
 		 52 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02522  predicted membrane protein  58.33 
 
 		 52 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1017  protein of unknown function UPF0057  58.33 
 
 		 52 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3215  hypothetical protein  58.33 
 
 		 52 aa  55.1  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2786  hypothetical protein  58.33 
 
 		 52 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.313284 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1040  hypothetical protein  58.33 
 
 		 52 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2801  hypothetical protein  58.33 
 
 		 52 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3564  protein of unknown function UPF0057  48.08 
 
 		 54 aa  52  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.295411  normal  0.13478 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3240  hypothetical protein  48.08 
 
 		 54 aa  52  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.696832  normal  0.0916248 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_31254  predicted protein  48.98 
 
 		 52 aa  50.4  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0361  protein of unknown function UPF0057  37.74 
 
 		 58 aa  50.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.869004  normal  0.794905 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01010  cation transport-related protein, putative  62 
 
 		 57 aa  50.4  0.000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.249867  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2651  hypothetical protein  52.5 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2324  hypothetical protein  47.73 
 
 		 70 aa  49.7  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.653065  normal  0.0692425 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1858  hypothetical protein  40.38 
 
 		 57 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.208589 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1812  salt-stress induced hydrophobic peptide  43.75 
 
 		 68 aa  48.5  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1531  hypothetical protein  53.66 
 
 		 58 aa  48.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.647152 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3712  protein of unknown function UPF0057  50 
 
 		 53 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3436  protein of unknown function UPF0057  45.1 
 
 		 54 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.668514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45467  predicted protein  46 
 
 		 144 aa  47.4  0.00007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.564065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_36994  predicted protein  46.94 
 
 		 81 aa  45.4  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.384013  normal  0.185346 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001339  plasma membrane protein involved in salt tolerance  38 
 
 		 54 aa  45.4  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.9667  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0309  hypothetical protein  63.46 
 
 		 52 aa  43.9  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02312  stress response RCI peptide, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10590)  46.15 
 
 		 157 aa  43.9  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000114001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05228  hypothetical protein  38.46 
 
 		 54 aa  41.2  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>