79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3561 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_3766  succinylarginine dihydrolase  82.74 
 
 		 449 aa  783    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.283643  normal  0.0241485 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4477  succinylarginine dihydrolase  83.63 
 
 		 449 aa  784    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.146428 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1438  succinylarginine dihydrolase  83.63 
 
 		 449 aa  784    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.531333  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1836  succinylarginine dihydrolase  93.08 
 
 		 448 aa  874    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2907  succinylarginine dihydrolase  79.24 
 
 		 448 aa  758    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.254862  normal  0.617439 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4616  succinylarginine dihydrolase  80.13 
 
 		 448 aa  766    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52660  succinylarginine dihydrolase  79.46 
 
 		 448 aa  759    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3561  succinylarginine dihydrolase  100 
 
 		 448 aa  929    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0211379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3982  succinylarginine dihydrolase  83.41 
 
 		 449 aa  781    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.282024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4281  succinylarginine dihydrolase  84.38 
 
 		 448 aa  783    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3671  succinylarginine dihydrolase  64.64 
 
 		 448 aa  596  1e-169  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0073  succinylarginine dihydrolase  63 
 
 		 444 aa  593  1e-168  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1321  succinylarginine dihydrolase  65.02 
 
 		 444 aa  593  1e-168  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0233544  normal  0.210198 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02354  succinylarginine dihydrolase  63.68 
 
 		 446 aa  592  1e-168  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0061994  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2357  succinylarginine dihydrolase  62.78 
 
 		 446 aa  588  1e-167  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.119707  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2329  succinylarginine dihydrolase  62.78 
 
 		 444 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.217972  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1802  succinylarginine dihydrolase  62.11 
 
 		 445 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.303487  hitchhiker  0.0000138557 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3315  succinylarginine dihydrolase  63.82 
 
 		 446 aa  582  1.0000000000000001e-165  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2225  succinylarginine dihydrolase  61.21 
 
 		 445 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00552655 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2842  succinylarginine dihydrolase  61.43 
 
 		 445 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.355282  hitchhiker  0.000000291277 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2706  succinylarginine dihydrolase  62.33 
 
 		 444 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1534  succinylarginine dihydrolase  61.66 
 
 		 445 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1584  succinylarginine dihydrolase  62.33 
 
 		 444 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0917284 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1659  succinylarginine dihydrolase  62.33 
 
 		 444 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.149262  unclonable  0.0000227076 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2497  succinylarginine dihydrolase  61.66 
 
 		 444 aa  570  1e-161  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2479  succinylarginine dihydrolase  61.66 
 
 		 444 aa  570  1e-161  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.913037  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1854  succinylarginine dihydrolase  61.66 
 
 		 444 aa  570  1e-161  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000137714 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1728  succinylarginine dihydrolase  61.88 
 
 		 444 aa  570  1e-161  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.212978 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2610  succinylarginine dihydrolase  61.66 
 
 		 444 aa  566  1e-160  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0460868  hitchhiker  0.00355964 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2490  succinylarginine dihydrolase  61.66 
 
 		 444 aa  566  1e-160  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2251  succinylarginine dihydrolase  60.54 
 
 		 444 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2841  succinylarginine dihydrolase  61.43 
 
 		 446 aa  561  1e-158  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00651645 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2842  succinylarginine dihydrolase  62.78 
 
 		 446 aa  555  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2421  succinylarginine dihydrolase  62.78 
 
 		 446 aa  555  1e-157  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.637626  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2870  succinylarginine dihydrolase  62.78 
 
 		 446 aa  555  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1161  succinylarginine dihydrolase  62.33 
 
 		 446 aa  556  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.224357  normal  0.0804902 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2723  succinylarginine dihydrolase  62.78 
 
 		 446 aa  555  1e-157  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.204477  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2781  succinylarginine dihydrolase  62.78 
 
 		 446 aa  555  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1732  succinylarginine dihydrolase  62.78 
 
 		 446 aa  555  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.728912  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1783  succinylarginine dihydrolase  62.11 
 
 		 446 aa  555  1e-157  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.164145  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0595  succinylarginine dihydrolase  62.78 
 
 		 446 aa  555  1e-157  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1065  succinylarginine dihydrolase  62.11 
 
 		 446 aa  554  1e-157  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.230821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1779  succinylarginine dihydrolase  62.56 
 
 		 446 aa  556  1e-157  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1184  succinylarginine dihydrolase  61.88 
 
 		 446 aa  553  1e-156  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0316114  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1065  succinylarginine dihydrolase  62.11 
 
 		 446 aa  553  1e-156  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0705  succinylarginine dihydrolase  61.88 
 
 		 446 aa  553  1e-156  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4295  succinylarginine dihydrolase  61.66 
 
 		 446 aa  552  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.569596  normal  0.19343 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0487  succinylarginine dihydrolase  63 
 
 		 449 aa  549  1e-155  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1562  succinylarginine dihydrolase  61.88 
 
 		 446 aa  547  1e-154  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2919  succinylarginine dihydrolase  61.43 
 
 		 446 aa  545  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.310668  normal  0.342556 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2120  succinylarginine dihydrolase  62.11 
 
 		 446 aa  547  1e-154  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.949409 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2804  succinylarginine dihydrolase  61.12 
 
 		 447 aa  543  1e-153  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2226  succinylarginine dihydrolase  60.27 
 
 		 447 aa  532  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2517  succinylarginine dihydrolase  60.27 
 
 		 447 aa  532  1e-150  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.658735 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2118  succinylarginine dihydrolase  60.27 
 
 		 447 aa  532  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1991  succinylarginine dihydrolase  59.96 
 
 		 453 aa  528  1e-149  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01714  succinylarginine dihydrolase  59.96 
 
 		 447 aa  529  1e-149  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01702  hypothetical protein  59.96 
 
 		 447 aa  529  1e-149  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1699  succinylarginine dihydrolase  60.99 
 
 		 441 aa  530  1e-149  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1887  succinylarginine dihydrolase  59.64 
 
 		 447 aa  525  1e-148  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0206768 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1897  succinylarginine dihydrolase  59.96 
 
 		 447 aa  527  1e-148  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.310179  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2463  succinylarginine dihydrolase  59.73 
 
 		 447 aa  525  1e-148  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.849491 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1828  succinylarginine dihydrolase  59.73 
 
 		 447 aa  526  1e-148  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1446  succinylarginine dihydrolase  59.73 
 
 		 447 aa  523  1e-147  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.555371 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1967  succinylarginine dihydrolase  59.73 
 
 		 447 aa  523  1e-147  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1418  succinylarginine dihydrolase  58.52 
 
 		 447 aa  515  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.488484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1433  succinylarginine dihydrolase  58.74 
 
 		 447 aa  517  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1867  succinylarginine dihydrolase  58.52 
 
 		 447 aa  515  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2040  succinylarginine dihydrolase  58.52 
 
 		 447 aa  516  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1401  succinylarginine dihydrolase  58.3 
 
 		 447 aa  512  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587954  normal  0.224315 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1594  succinylarginine dihydrolase  54.22 
 
 		 447 aa  474  1e-132  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.539722  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0626  succinylarginine dihydrolase  53.01 
 
 		 447 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00494853 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1673  succinylarginine dihydrolase  50 
 
 		 448 aa  443  1e-123  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1667  succinylarginine dihydrolase  49.78 
 
 		 448 aa  441  9.999999999999999e-123  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1855  succinylarginine dihydrolase  51.78 
 
 		 446 aa  429  1e-119  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.367441  normal  0.80763 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2204  succinylarginine dihydrolase  51.23 
 
 		 447 aa  429  1e-119  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.5143  normal  0.200224 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0527  succinylarginine dihydrolase  46.43 
 
 		 424 aa  348  1e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.258432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0882  succinylarginine dihydrolase  46.35 
 
 		 421 aa  347  2e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.465376  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1941  succinylarginine dihydrolase  42.32 
 
 		 415 aa  316  5e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>