More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1922 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_1922  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  100 
 
 
309 aa  643    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.459243  normal  0.0162799 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5267  molybdopterin and thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing enzyme  44.78 
 
 
298 aa  237  2e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3522  molybdopterin and thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing enzyme  43.77 
 
 
298 aa  236  3e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2046  hypothetical protein  34.93 
 
 
290 aa  109  5e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000420492  hitchhiker  0.0000188727 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2502  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.52 
 
 
292 aa  106  6e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.435247  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2230  hypothetical protein  32.79 
 
 
679 aa  105  7e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000280585  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12362  hypothetical protein  34.07 
 
 
318 aa  105  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1994  molybdopterin/thiamine biosynthesis family protein  32.86 
 
 
672 aa  103  4e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1623  hypothetical protein  34.34 
 
 
295 aa  101  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.240534  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0151  hypothetical protein  34.62 
 
 
300 aa  96.3  6e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0374  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  32.68 
 
 
684 aa  94.7  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3075  hypothetical protein  30.86 
 
 
989 aa  94.4  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.697159  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1525  hypothetical protein  31.36 
 
 
287 aa  91.3  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0692  hypothetical protein  32.95 
 
 
968 aa  89.4  8e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.233309 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0600  thiamine biosynthesis protein ThiF  34.9 
 
 
214 aa  83.2  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0589  hypothetical protein  34.53 
 
 
236 aa  80.9  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0970373  hitchhiker  0.000644128 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1548  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.98 
 
 
443 aa  80.9  0.00000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.47369 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2396  hypothetical protein  30.77 
 
 
290 aa  79  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000837429  normal  0.548926 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0188  hypothetical protein  38.46 
 
 
252 aa  77.8  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.430925  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1682  thiamine biosynthesis protein ThiF  34.06 
 
 
207 aa  77  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000522342  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0525  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  36.59 
 
 
248 aa  77  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.449442 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0191  hypothetical protein  29.68 
 
 
291 aa  75.9  0.0000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.409062  normal  0.837302 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2450  adenylyltransferase ThiF  31.36 
 
 
258 aa  75.1  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0085  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  31.94 
 
 
251 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1238  4-methyl-5-(beta-hydroxyethyl)thiazole monophosphate synthesis protein ThiF  37.61 
 
 
247 aa  72.4  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4642  adenylyltransferase ThiF  36.51 
 
 
249 aa  72  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.144035  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0822  hypothetical protein  29.66 
 
 
1006 aa  71.2  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2504  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.83 
 
 
285 aa  70.5  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00024143  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0802  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.61 
 
 
251 aa  69.3  0.00000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.445237  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0018  hypothetical protein  29.13 
 
 
347 aa  69.3  0.00000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0652  molybdopterin biosynthesis MoeB protein  30.61 
 
 
251 aa  69.3  0.00000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.522282  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0802  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.9 
 
 
242 aa  68.9  0.00000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0279  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.3 
 
 
273 aa  68.9  0.00000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.266697  normal  0.0271151 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0112  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.72 
 
 
216 aa  68.9  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.157166  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0519  UBA/ThiF-type NAD/FAD binding fold protein  30.67 
 
 
245 aa  68.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0245  thiamine biosynthesis protein (HesA/MoeB/ThiF family protein)  30.81 
 
 
345 aa  68.6  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.881416 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3463  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.8 
 
 
379 aa  68.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.838901  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1314  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.38 
 
 
231 aa  68.2  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.530207  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2183  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  31.72 
 
 
245 aa  68.2  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1702  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.21 
 
 
264 aa  68.2  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00338443  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2358  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.4 
 
 
248 aa  67  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0252  molybdopterin and thiamine biosynthesis protein  30.91 
 
 
272 aa  67.4  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4133  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.81 
 
 
464 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.6578  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1439  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.77 
 
 
239 aa  67.4  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81395  predicted protein  28.64 
 
 
443 aa  67  0.0000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.163199 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2985  thiamine biosynthesis adenylyltransferase ThiF  27.11 
 
 
282 aa  67  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1940  rhodanese-like protein  31.64 
 
 
388 aa  66.6  0.0000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.865805  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1276  thiamine biosynthesis protein ThiF  32.42 
 
 
283 aa  66.6  0.0000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0911002  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1532  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  37.3 
 
 
259 aa  66.2  0.0000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1499  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.97 
 
 
250 aa  66.2  0.0000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.039426  normal  0.0112948 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1067  thiamine biosynthesis protein ThiF  32.12 
 
 
267 aa  65.9  0.0000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.451189  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0890  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.07 
 
 
273 aa  65.9  0.0000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0522  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.62 
 
 
259 aa  65.1  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1073  ThiF/MoeZ/MoeB domain/rhodanese-like domain-containing protein  36.21 
 
 
368 aa  65.5  0.000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0735  thiamine biosynthesis protein ThiF  31.65 
 
 
267 aa  65.1  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0941  molybdopterin biosynthesis MoeB protein  36.21 
 
 
368 aa  65.5  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.217219  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1190  thiamine biosynthesis protein ThiF  31.39 
 
 
267 aa  65.1  0.000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1525  ThiF family protein  35.16 
 
 
276 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.822958  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4639  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.44 
 
 
355 aa  64.3  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1275  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.2 
 
 
291 aa  64.3  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0075  thiamine biosynthesis protein ThiF  33.58 
 
 
202 aa  63.9  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.173177  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1847  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.96 
 
 
241 aa  64.3  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1043  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold:MoeZ/MoeB  30.2 
 
 
280 aa  63.9  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000044291  hitchhiker  0.000000000393673 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0797  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.97 
 
 
265 aa  63.9  0.000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1368  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.17 
 
 
255 aa  63.9  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000273518  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1796  hypothetical protein  33.12 
 
 
709 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.284537  normal  0.928195 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1730  hypothetical protein  33.12 
 
 
709 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0548  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.83 
 
 
237 aa  63.2  0.000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1107  adenylyltransferase thiF  33.33 
 
 
260 aa  62.8  0.000000006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1749  hypothetical protein  33.12 
 
 
709 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.13421  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17601  molybdopterin biosynthesis protein  33.62 
 
 
381 aa  63.2  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2505  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.15 
 
 
254 aa  62.8  0.000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000813417  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2005  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.03 
 
 
249 aa  62.8  0.000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0522  HesA/MoeB/ThiF family protein  35.06 
 
 
267 aa  62.4  0.000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1880  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.75 
 
 
282 aa  62  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0654  thiF family protein  37.61 
 
 
248 aa  62.4  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.392164  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0884  molybdopterin biosynthesis protein  31.15 
 
 
276 aa  62.4  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.167114  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1336  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.96 
 
 
244 aa  62  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0617  molybdenum cofactor biosynthesis protein  37.04 
 
 
265 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.230334  normal  0.726284 
 
 
-
 
NC_002950  PG0446  thiF protein  30.56 
 
 
235 aa  61.2  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0750126 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1464  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.78 
 
 
242 aa  61.6  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0729  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.11 
 
 
219 aa  61.2  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00160483  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0383  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.04 
 
 
223 aa  61.2  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.351767  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2855  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold:MoeZ/MoeB  36.11 
 
 
248 aa  61.6  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000693391  hitchhiker  0.000000536113 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3654  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  32.37 
 
 
318 aa  61.6  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17561  molybdopterin biosynthesis protein  32.45 
 
 
382 aa  61.6  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0806  dinucleotide-utilizing enzyme  34.86 
 
 
269 aa  61.6  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0887502  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1123  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.57 
 
 
396 aa  61.2  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.632622  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1632  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.13 
 
 
275 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.135466  normal  0.0862863 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0925  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.64 
 
 
266 aa  61.2  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.246319  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1822  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.29 
 
 
256 aa  61.6  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0657406  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2212  thiF family protein  32.8 
 
 
272 aa  60.8  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.261926  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1394  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.35 
 
 
278 aa  60.8  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2139  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.69 
 
 
386 aa  60.5  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000312689  normal  0.0185629 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1000  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.67 
 
 
247 aa  60.8  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0884  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  31.03 
 
 
259 aa  60.5  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.370155 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1008  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.54 
 
 
244 aa  60.8  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0106797  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2240  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.41 
 
 
270 aa  60.1  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.590447 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0885  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold:MoeZ/MoeB  28.57 
 
 
260 aa  60.5  0.00000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0972  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  30.05 
 
 
390 aa  60.1  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>