More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_R0056 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_R0020  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0048  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.544704  hitchhiker  0.00053111 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0056  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0061  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0021  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.984556  normal  0.270863 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0050  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0200036 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0058  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0063  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0057  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.185628  hitchhiker  0.000293533 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0097  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000376718  normal  0.165584 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0054  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00629084  normal  0.3868 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0008  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000983847  hitchhiker  0.000163043 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0078  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000280494  normal  0.145068 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0041  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.239536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0033  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000292455  normal  0.447414 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0011  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000293397  hitchhiker  0.000919348 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0091  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000036342  hitchhiker  0.00439232 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0062  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000746222  normal  0.783318 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t04  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t10  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0117548  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t16  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.266667  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t41  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.155004  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t62  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.132362  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0060  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000273656  normal  0.689003 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0015  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00408326  hitchhiker  0.00315011 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA15  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.140136  normal  0.0102335 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA50  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000979507  normal  0.305106 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA6  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0168581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA72  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000170851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA81  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00142149  normal  0.0185896 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R14  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000817824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R3  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00599738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R43  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000550301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R58  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000367704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R79  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000916269  hitchhiker  0.00756682 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R92  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000124955  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0072  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.064194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0067  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000523585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0062  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0469123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0016  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.262033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0006  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000138481  normal  0.649612 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0038  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0023  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000263771  hitchhiker  0.000576138 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t10  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.922263  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t49  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t69  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.595714  hitchhiker  0.00914053 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0041  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.312045 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0080  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00204855  normal  0.185983 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0072  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000523195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0004  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.892843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0036  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000936293  normal  0.188106 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0010  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0704322  hitchhiker  0.00208971 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0047  tRNA-Ala  96.61 
 
 		 77 bp  93.7  5e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.591987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0059  tRNA-Ala  96.61 
 
 		 77 bp  93.7  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.455983  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0069  tRNA-Ala  96.61 
 
 		 77 bp  93.7  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.181592  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0053  tRNA-Ala  96.61 
 
 		 77 bp  93.7  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0051  tRNA-Ala  92.54 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00326143  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0013  tRNA-Ala  96.61 
 
 		 77 bp  93.7  5e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0447386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0046  tRNA-Ala  92.54 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0258027  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0053  tRNA-Ala  96.61 
 
 		 77 bp  93.7  5e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0047  tRNA-Ala  96.61 
 
 		 77 bp  93.7  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0017  tRNA-Ala  96.61 
 
 		 77 bp  93.7  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0003  tRNA-Ala  96.61 
 
 		 77 bp  93.7  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0005  tRNA-Ala  94.83 
 
 		 73 bp  91.7  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00314904 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0005  tRNA-Ala  94.83 
 
 		 73 bp  91.7  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.352047  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0025  tRNA-Ala  94.83 
 
 		 73 bp  91.7  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0010  tRNA-Ala  94.83 
 
 		 73 bp  91.7  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0057492  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0010  tRNA-Ala  94.83 
 
 		 73 bp  91.7  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.407573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0469  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 78 bp  87.7  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000319828  normal  0.0257822 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0128  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 78 bp  87.7  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000050642  normal  0.0403899 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5641  tRNA-Ile  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0047  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000145993  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0003  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4292  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 78 bp  87.7  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000724507  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0010  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 79 bp  87.7  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0026  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0248198  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ala-4  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 79 bp  87.7  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.511469  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 79 bp  87.7  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0004  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000571046  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ala-3  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 79 bp  87.7  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0060  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000375554  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ala-5  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 79 bp  87.7  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 79 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.520164  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ala-4  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 79 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0627  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 78 bp  87.7  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000351596  normal  0.0173581 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00147071  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.132549  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0010  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0003  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00193312  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0013  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000457589  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0057  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0288839  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0077  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000402465  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0085  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00934773  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4264  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 78 bp  87.7  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000257856  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0003  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0017  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00161415  hitchhiker  0.00407434 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0084  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0403496  normal  0.138563 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0103  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000241452  normal  0.0209132 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4205  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 78 bp  87.7  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000556554  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>