More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1727 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_1727  replication restart DNA helicase PriA  100 
 
 
789 aa  1626    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.584251 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0573  primosomal protein N'  69.7 
 
 
774 aa  1118    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0130712  hitchhiker  0.00834371 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2007  primosomal protein N'  92.43 
 
 
793 aa  1515    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00478973 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5138  primosome assembly protein PriA  43.3 
 
 
739 aa  597  1e-169  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5088  primosome assembly protein PriA  43.06 
 
 
739 aa  595  1e-168  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.420968  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4961  primosome assembly protein PriA  43.06 
 
 
739 aa  593  1e-168  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0377  primosome assembly protein PriA  42.51 
 
 
746 aa  588  1e-166  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0536  primosome assembly protein PriA  43.11 
 
 
743 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0398  primosome assembly protein PriA  42.84 
 
 
739 aa  579  1e-164  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.844316  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5787  primosome assembly protein PriA  42.19 
 
 
739 aa  582  1e-164  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66720  primosome assembly protein PriA  42.38 
 
 
739 aa  582  1e-164  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5137  primosomal protein N`  42.99 
 
 
739 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2743  primosome assembly protein PriA  42.02 
 
 
733 aa  565  1e-160  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0400  primosome assembly protein PriA  42.36 
 
 
744 aa  568  1e-160  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0603  primosome assembly protein PriA  42.99 
 
 
740 aa  568  1e-160  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001745  helicase PriA essential for oriC/DnaA-independent DNA replication  41.25 
 
 
733 aa  564  1.0000000000000001e-159  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.579492  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4789  primosome assembly protein PriA  42.89 
 
 
731 aa  560  1e-158  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00727  primosome assembly protein PriA  40.7 
 
 
733 aa  558  1e-157  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03820  primosome assembly protein PriA  42.02 
 
 
732 aa  554  1e-156  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.846253  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4050  primosomal protein N'  42.02 
 
 
732 aa  554  1e-156  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0116  primosome assembly protein PriA  42.38 
 
 
732 aa  554  1e-156  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4099  primosome assembly protein PriA  42.38 
 
 
732 aa  553  1e-156  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03769  hypothetical protein  42.02 
 
 
732 aa  554  1e-156  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880403  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4038  primosome assembly protein PriA  42.56 
 
 
731 aa  553  1e-156  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45350  primosome assembly protein PriA  42.1 
 
 
739 aa  551  1e-155  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.746979  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0117  primosome assembly protein PriA  43.12 
 
 
732 aa  552  1e-155  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4311  primosome assembly protein PriA  42.12 
 
 
732 aa  549  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3495  primosomal protein N'  42.65 
 
 
736 aa  551  1e-155  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0457  primosomal protein N'  42.78 
 
 
736 aa  550  1e-155  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4377  primosome assembly protein PriA  41.76 
 
 
732 aa  546  1e-154  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.679343 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4471  primosome assembly protein PriA  41.76 
 
 
732 aa  547  1e-154  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4427  primosome assembly protein PriA  41.73 
 
 
732 aa  548  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4341  primosome assembly protein PriA  42.12 
 
 
732 aa  548  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.849244  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2869  primosomal protein N'  40.05 
 
 
753 aa  547  1e-154  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4425  primosome assembly protein PriA  42.12 
 
 
732 aa  548  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.981494  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5393  primosome assembly protein PriA  41.63 
 
 
732 aa  545  1e-154  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.670889  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4495  primosome assembly protein PriA  42.14 
 
 
732 aa  548  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4418  primosome assembly protein PriA  41.89 
 
 
732 aa  548  1e-154  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3812  primosome assembly protein PriA  42.12 
 
 
732 aa  547  1e-154  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3672  primosomal protein N'  42.93 
 
 
736 aa  548  1e-154  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4122  primosomal protein N'  42.56 
 
 
737 aa  543  1e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2251  primosome assembly protein PriA  41.04 
 
 
734 aa  543  1e-153  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.889331  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4167  primosome assembly protein PriA  41.63 
 
 
732 aa  545  1e-153  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4083  primosome assembly protein PriA  41.63 
 
 
732 aa  545  1e-153  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0534  primosomal protein N'  42.3 
 
 
742 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.680664  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0028  primosome assembly protein PriA  39.11 
 
 
736 aa  542  9.999999999999999e-153  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0169  primosome assembly protein PriA  42.05 
 
 
732 aa  539  9.999999999999999e-153  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2694  transcription elongation factor GreA / replication restart DNA helicase PriA  40.49 
 
 
736 aa  541  9.999999999999999e-153  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000288054  hitchhiker  0.00453215 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3794  primosome assembly protein PriA  41.62 
 
 
731 aa  541  9.999999999999999e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0183  primosome assembly protein PriA  41.68 
 
 
732 aa  541  9.999999999999999e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4426  primosomal protein N'  41.35 
 
 
731 aa  534  1e-150  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0499  primosomal protein N'  41.22 
 
 
731 aa  526  1e-148  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3844  primosomal protein N'  41.35 
 
 
731 aa  527  1e-148  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0551  primosomal protein N'  41.35 
 
 
731 aa  528  1e-148  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0496  primosomal protein N'  41.35 
 
 
731 aa  528  1e-148  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0475  primosomal protein N'  41.35 
 
 
731 aa  527  1e-148  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2594  primosomal protein N`  40.21 
 
 
733 aa  525  1e-147  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1987  primosomal protein N' (replication factor Y)  38.07 
 
 
774 aa  525  1e-147  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3356  primosomal protein N'  40.05 
 
 
734 aa  523  1e-147  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3761  primosomal protein N'  40.86 
 
 
731 aa  522  1e-147  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3778  primosomal protein N'  39.58 
 
 
731 aa  521  1e-146  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1123  primosome assembly protein PriA  41.14 
 
 
730 aa  521  1e-146  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0274294  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0822  primosomal protein N'  41.07 
 
 
723 aa  515  1.0000000000000001e-145  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.102519  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2239  primosome assembly protein PriA  39.27 
 
 
733 aa  517  1.0000000000000001e-145  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0379  primosomal protein N'  41.17 
 
 
731 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2149  primosome assembly protein PriA  39.53 
 
 
733 aa  517  1.0000000000000001e-145  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3601  primosome assembly protein PriA  40.99 
 
 
732 aa  510  1e-143  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.550659  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0445  primosomal protein N'  41.51 
 
 
735 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4366  primosomal protein N'  39.79 
 
 
736 aa  509  9.999999999999999e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2267  primosome assembly protein PriA  40.91 
 
 
745 aa  508  9.999999999999999e-143  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04038  primosome assembly protein PriA  40.36 
 
 
740 aa  503  1e-141  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0799  primosomal protein N'  42.02 
 
 
774 aa  505  1e-141  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96943  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4126  primosomal protein N'  37.73 
 
 
743 aa  498  1e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000536083  hitchhiker  0.00000144445 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2496  primosome assembly protein PriA  40.72 
 
 
738 aa  497  1e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.733405  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0275  primosomal protein N'  40.36 
 
 
737 aa  493  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00025836  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0166  primosome assembly protein PriA  39.53 
 
 
704 aa  495  9.999999999999999e-139  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.331124  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4189  primosomal protein N'  39.33 
 
 
725 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03519  primosome assembly protein PriA  37.58 
 
 
729 aa  487  1e-136  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.822304  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2924  primosomal protein N' (replication factor Y)  37.68 
 
 
725 aa  487  1e-136  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2778  primosomal protein N' (replication factor Y)  37.81 
 
 
725 aa  487  1e-136  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0591  primosomal protein N`  38.62 
 
 
720 aa  483  1e-135  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.798479  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0743  primosomal protein N'  38.62 
 
 
720 aa  483  1e-135  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000000905593  unclonable  0.000000000088889 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0248  primosomal protein N'  41.31 
 
 
731 aa  479  1e-134  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  unclonable  0.00000476665  normal  0.18889 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2327  primosomal protein N'  37.19 
 
 
734 aa  457  1e-127  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0753846  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0374  primosomal protein N'  37.17 
 
 
754 aa  449  1e-125  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0607469  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4079  primosomal protein N'  37.61 
 
 
724 aa  448  1.0000000000000001e-124  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0044  primosomal protein N'  43.2 
 
 
662 aa  444  1e-123  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2014  primosomal protein N'  43.2 
 
 
662 aa  444  1e-123  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2672  replication restart DNA helicase PriA  37.45 
 
 
738 aa  443  1e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.868647 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1758  primosomal protein N'  33.68 
 
 
732 aa  433  1e-120  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3173  primosome assembly protein PriA  38.64 
 
 
765 aa  430  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3497  primosome assembly protein PriA  38.93 
 
 
765 aa  431  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.631062 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0167  primosomal protein N'  35.67 
 
 
752 aa  426  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00132621 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2781  replication restart DNA helicase PriA  37.01 
 
 
719 aa  423  1e-117  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.360664 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0185  primosomal protein N'  35.67 
 
 
752 aa  424  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2810  primosomal protein N'  35.76 
 
 
758 aa  421  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3302  primosome assembly protein PriA  38.41 
 
 
768 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.304002  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3490  primosome assembly protein PriA  37.76 
 
 
764 aa  418  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000105942  normal  0.279843 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3022  primosome assembly protein PriA  35.89 
 
 
752 aa  414  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3303  primosome assembly protein PriA  36.26 
 
 
764 aa  409  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>